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中国甜柿cDNA-SSAP文库构建及自然脱涩相关基因功能验证

摘要第8-10页
Abstract第10-12页
缩略语表第13-15页
第一章 课题提出和前人研究进展第15-26页
    1.1 课题的提出第15-17页
    1.2 前人研究进展第17-25页
        1.2.1 柿单宁第17-21页
            1.2.1.1 柿单宁分类第17页
            1.2.1.2 柿单宁生物合成第17-19页
            1.2.1.3 柿单宁转录调控第19-20页
            1.2.1.4 柿果脱涩第20-21页
        1.2.2 目的基因的分离策略第21-25页
            1.2.2.1 PCR扩增第22页
            1.2.2.2 转录水平差异显示第22-23页
            1.2.2.3 图位克隆第23页
            1.2.2.4 转座子或T-DNA标签技术第23-24页
            1.2.2.5 基于核苷酸测序技术的基因克隆第24页
            1.2.2.6 基于特异蛋白的基因克隆第24-25页
    1.3 研究目的和研究内容第25-26页
        1.3.1 研究目的第25页
        1.3.2 研究内容第25-26页
第二章 柿果温水脱涩研究及差异cDNA文库构建第26-60页
    2.1 前言第26-27页
    2.2 材料和方法第27-39页
        2.2.1 试验材料第27页
        2.2.2 单宁含量的测定第27-28页
            2.2.2.1 相关试剂及其配制方法第27页
            2.2.2.2 Folin-Ciocalteu法第27-28页
            2.2.2.3 印迹法第28页
        2.2.3 总DNA提取第28-29页
        2.2.4 总RNA提取第29页
        2.2.5 cDNA合成第29-32页
            2.2.5.1 单链cDNA合成第29-30页
            2.2.5.2 双链cDNA合成第30-32页
        2.2.6 实时定量PCR第32页
        2.2.7 cDNA/gDNA-SSAP技术体系及程序第32-35页
            2.2.7.1 cDNA/gDNA双酶切第32-33页
            2.2.7.2 接头连接第33-34页
            2.2.7.3 cDNA/gDNA-SSAP预扩增第34-35页
            2.2.7.4 cDNA/gDNA-SSAP选择性扩增第35页
            2.2.7.5 选择性扩增产物电泳检测第35页
        2.2.8 差异条带的分离及克隆测序第35-38页
            2.2.8.1 差异条带的分离第35页
            2.2.8.2 差异条带的扩增第35-36页
            2.2.8.3 目的条带的切胶回收第36页
            2.2.8.4 目的条带与载体连接第36-37页
            2.2.8.5 转化感受态细胞第37页
            2.2.8.6 单克隆增殖第37页
            2.2.8.7 阳性检测与测序第37-38页
        2.2.9 水溶性果胶(WSP)含量的测定第38-39页
            2.2.9.1 相关试剂及其配制方法第38页
            2.2.9.2 咔唑比色法第38-39页
        2.2.10 SOD、POD、CAT酶活的测定第39页
        2.2.11 数据分析第39页
    2.3 结果与分析第39-52页
        2.3.1 柿果温水处理过程中单宁含量的变化第39-41页
        2.3.2 柿果温水处理过程中SOD、POD及CAT酶活的变化第41-42页
        2.3.3 柿逆转座子DkRE1分布特性研究第42页
        2.3.4 柿果温水处理过程中逆转座子DkRE1的激活与转座第42-43页
        2.3.5 柿果温水处理过程中cDNA/gDNA-SSAP条带分析第43-45页
        2.3.6 柿果温水处理过程中cDNA/gDNA-SSAP差异条带克隆及功能注释第45-48页
        2.3.7 候选基因片段在‘鄂柿1号’温水脱涩过程中的表达变化第48-50页
        2.3.8 候选基因片段在‘磨盘柿’温水脱涩过程中的表达变化第50-52页
        2.3.9 柿果温水脱涩过程中水溶性果胶的含量变化第52页
    2.4 讨论第52-60页
        2.4.1 温水脱涩对柿果中逆转座子活性的影响第52-53页
        2.4.2 温水脱涩对柿单宁前体生物合成及跨膜转运的影响第53-55页
        2.4.3 醛类在柿果温水脱涩过程中的可能作用第55-57页
        2.4.4 果胶在柿果温水脱涩过程中的可能作用第57-60页
第三章 中国甜柿自然脱涩相关基因DkPK的筛选及鉴定第60-81页
    3.1 前言第60-61页
    3.2 材料与方法第61-70页
        3.2.1 试验材料第61页
        3.2.2 单宁含量测定第61页
            3.2.2.1 果肉单宁含量测定第61页
            3.2.2.2 叶片单宁含量测定第61页
        3.2.3 总RNA提取第61页
        3.2.4 cDNA合成第61-62页
            3.2.4.1 用于qRT-PCR的单链cDNA合成第61-62页
            3.2.4.2 用于基因分离的单链cDNA合成第62页
        3.2.5 DkPK全长cDNA的分离第62-67页
            3.2.5.1 cDNA片段的获取第62页
            3.2.5.2 染色体步移第62-65页
            3.2.5.3 3’RACE第65-66页
            3.2.5.4 cDNA全长克隆第66-67页
        3.2.6 实时定量PCR第67页
        3.2.7 DkPK1的亚细胞定位第67-69页
            3.2.7.1 载体构建第67-68页
            3.2.7.2 瞬时表达第68-69页
        3.2.8 柿叶片瞬时超表达第69-70页
            3.2.8.1 载体构建第69页
            3.2.8.2 瞬时表达第69-70页
    3.3 结果与分析第70-76页
        3.3.1 不同柿品种果实发育过程中单宁含量的变化第70页
        3.3.2 6 个DkPK在中国甜柿中的分离及序列分析第70-72页
        3.3.3 6 个DkPK在不同柿品种果实发育过程中的表达变化第72-73页
        3.3.4 DkPK1在中国甜柿种子中的高度表达第73-74页
        3.3.5 DkPK1在烟草叶片中的亚细胞定位第74-75页
        3.3.6 超表达DkPK1对‘磨盘柿’叶片中可溶性单宁含量的影响第75页
        3.3.7 超表达DkPK1对‘磨盘柿’叶片中DkPDC表达的影响第75-76页
    3.4 讨论第76-81页
        3.4.1 中国甜柿自然脱涩相关基因的筛选第76-78页
        3.4.2 DkPK1在中国甜柿自然脱涩过程中的可能作用第78-79页
        3.4.3 中国甜柿自然脱涩模型的推测第79-81页
第四章 应用酵母单杂交系统筛选DkPK1和DkCAD1互作转录因子第81-92页
    4.1 前言第81-82页
    4.2 材料与方法第82-86页
        4.2.1 试验材料第82页
        4.2.2 总DNA提取第82页
        4.2.3 启动子序列获取第82-83页
            4.2.3.1 染色体步移第82页
            4.2.3.2 启动子克隆第82-83页
        4.2.4 诱饵载体pAbAi-PK/CAD构建第83-84页
        4.2.5 酵母菌株感受态制备第84-85页
        4.2.6 诱饵菌株构建及阳性检测第85页
        4.2.7 诱饵菌株AbA毒性检测第85-86页
        4.2.8 酵母文库筛选第86页
    4.3 结果与分析第86-89页
        4.3.1 启动子获取及诱饵载体构建第86页
        4.3.2 诱饵菌株毒性检测第86-88页
        4.3.3 酵母文库筛选第88-89页
        4.3.4 互作转录因子生物信息学分析第89页
    4.4 讨论第89-92页
        4.4.1 基于酵母文库筛选目的基因互作蛋白第89-90页
        4.4.2 中国甜柿自然脱涩转录调控第90-92页
第五章 全文总结与展望第92-94页
    5.1 总结第92-93页
    5.2 创新之处第93页
    5.3 进一步工作设想第93-94页
参考文献第94-110页
附录第110-120页
作者简历及在学期间的科研实践第120-121页
致谢第121-122页

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