摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
引言 | 第7-11页 |
1 理论方法 | 第11-16页 |
1.1 有限差分近似计算法 | 第11页 |
1.2 ABEEMσπ模型 | 第11-15页 |
1.2.1 电负性标度 | 第11-13页 |
1.2.2 ABEEMσπ模型 | 第13-14页 |
1.2.3 Fukui函数 | 第14-15页 |
1.3 硬软酸碱原理 | 第15-16页 |
2 特征小分子的性质 | 第16-23页 |
2.1 构型的选取及优化 | 第16页 |
2.2 小分子整体活性指标 | 第16-23页 |
2.2.1 价态电负性和价态硬度 | 第16-17页 |
2.2.2 特征小分子电荷 | 第17-19页 |
2.2.3 ab initio方法计算能量 | 第19-20页 |
2.2.4 ABEEMσπ方法与从头算方法下的活性指标 | 第20-23页 |
3 取代基小分子的性质 | 第23-28页 |
3.1 模型分子的获得 | 第23-25页 |
3.1.1 ABEEM模型中的价态电负性和价态硬度 | 第23-24页 |
3.1.2 取代基分子的电荷 | 第24-25页 |
3.2 取代基分子整体活性指标 | 第25-28页 |
3.2.1 取代基分子的能量 | 第25-26页 |
3.2.2 ABEEM方法与从头算方法计算的整体活性指标 | 第26-28页 |
4 活性区域内不同长度氨基酸残基的性质 | 第28-33页 |
4.1 模型分子的获得 | 第28-29页 |
4.2 模型分子的命名 | 第29-30页 |
4.3 活性区域内氨基酸残基整体活性指标 | 第30-31页 |
4.4 整体软度与解离常数之间的关系 | 第31-33页 |
5 卡律蝎毒素(ChTX)及其6个突变体的性质 | 第33-40页 |
5.1 CHTX蛋白质及其突变体的电荷 | 第33-34页 |
5.2 整体反应性指标与解离常数之间的关系 | 第34-38页 |
5.3 蛋白质活性位点的预测 | 第38-40页 |
结论 | 第40-41页 |
参考 文献 | 第41-45页 |
附录A 活性区域内不同长度氨基酸残基的电荷 | 第45-48页 |
附录B ABEEMσπ方法计算不同长度的氨基酸残基整体活性指标 | 第48-50页 |
附录C ABEEM方法计算Fukui函数值最大原子位点的性质 | 第50-53页 |
攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第53-54页 |
致谢 | 第54页 |