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干旱胁迫下斑茅全长cDNA文库的构建及hir基因功能的初步分析

中文摘要第9-10页
Abstract第10页
1.引言第11-35页
    1.1 斑茅对甘蔗抗旱育种的意义第11-12页
    1.2 干旱对农作物生长的影响第12-19页
        1.2.1 干早胁迫对植物的伤害第12-13页
            1.2.1.1 植物生长受到抑制第12-13页
            1.2.1.2 消弱植物的光合作用第13页
            1.2.1.3 活性氧对植物的氧化伤害第13页
        1.2.2 植物耐旱性的生物学机理第13-16页
            1.2.2.1 通过调整气孔开闭来防止水分散失第13页
            1.2.2.2 渗透调节第13-14页
            1.2.2.3 抗氧化防御系统第14-15页
            1.2.2.4 脱落酸作用第15页
            1.2.2.5 Lea蛋白的保护作用第15-16页
            1.2.2.6 水通道蛋白在农作物抗旱机制中的作用第16页
        1.2.3 植物水分胁迫的分子响应第16-19页
            1.2.3.1 水分胁迫的信号感知第17页
            1.2.3.2 水分胁迫的信号传导第17-18页
            1.2.3.3 水分胁迫的基因表达第18-19页
    1.3 抗旱基因的分离克隆策略第19-22页
        1.3.1 基于基因的DNA序列分离基因的方法第20页
        1.3.2 基于基因功能的分离方法第20-21页
        1.3.3 从基因转录产物分离第21页
        1.3.4 基于基因翻译产物的方法第21-22页
    1.4 全长cDNA文库构建方法的研究进展第22-33页
        1.4.1 Oligo-Capping方法(Oligo-Capping Method)第22-24页
        1.4.2 CAPture法(CAPture Method)第24-26页
        1.4.3 SMART法(Switching Mechanism At5'end of RNA Transcript methodl第26-30页
        1.4.4 CAP-Trapper法(CAP-Trapper Method)第30-32页
        1.4.5 CAP-Jumping法第32-33页
    1.5 本研究的目的意义,研究内容和技术路线第33-35页
2.材料和方法第35-42页
    2.1 实验材料第35-37页
        2.1.1 植物材料第35页
        2.1.2 主要仪器第35页
        2.1.3 主要试剂和试剂盒第35页
        2.1.4 所用质粒载体、引物、细菌第35-37页
            2.1.4.1 质粒载体第35-36页
            2.1.4.2 引物第36-37页
            2.1.4.3 所用细菌第37页
    2.2 实验方法第37-42页
        2.2.1 斑茅抗旱全长cDNA文库的构建第37-39页
            2.2.1.1 斑茅的干旱处理第37-38页
            2.2.1.2 总RNA的提取和mRNA的纯化第38页
            2.2.1.3 全长cDNA第一链的合成第38页
            2.2.1.4 全长cDNA第二链的合成第38页
            2.2.1.5 分段切取ds cDNA片段第38页
            2.2.1.6 与T-Vector连接和转化第38页
            2.2.1.7 文库滴定、重组率测定第38-39页
            2.2.1.8 cDNA文库质量鉴定第39页
            2.2.1.9 选取个别片段的菌落进行测序第39页
        2.2.2 渗透胁迫下HIR基因的荧光实时定量分析第39-40页
            2.2.2.1 斑茅叶片总RNA制备以及纯度、完整性鉴定第39页
            2.2.2.2 cDNA合成第39页
            2.2.2.3 FQ-PCR(两步法PCR扩增)第39-40页
        2.2.3 构建载体第40-41页
            2.2.3.1 构建环境诱导型表达载体第40页
            2.2.3.2 构建RNAi载体第40-41页
        2.2.4 转化:第41-42页
            2.2.4.1 将环境诱导型载体转入农杆菌第41页
            2.2.4.2 转化拟南芥第41页
            2.2.4.3 用草甘膦进行筛选第41页
            2.2.4.4 对阳性转化植株提取DNA做PCR验证第41-42页
3.结果与分析第42-53页
    3.1 斑茅全长cDNA文库的构建第42-44页
        3.1.1 总RNA的制备第42页
        3.1.2 全长cDNA第一链的合成第42-43页
        3.1.3 全长cDNA第二链的合成第43页
        3.1.4 cDNA文库的构建和质量鉴定第43-44页
        3.1.5 全长文库部分克隆的测序分析第44页
    3.2 HIR全长基因的分析第44-48页
        3.2.1 基因的预测第44-47页
        3.2.2 荧光定量实时PCR分析第47-48页
    3.3 HIR基因功能的初步分析第48-53页
        3.3.1 环境诱导型载体构建第48-50页
            3.3.1.1 HIR基因的扩增第48页
            3.3.1.2 目的基因与环境诱导型载体pCRBI连接第48-49页
            3.3.1.3 连接产物转入农杆菌第49-50页
        3.3.2 转化第50-51页
        3.3.3 RNAi载体构建第51-53页
            3.3.3.1 正向片段的连入第51页
            3.3.3.2 反向片段的连入第51-53页
4.讨论第53-57页
    4.1 RNA提取第53页
    4.2 双链cDNA合成第53-54页
    4.3 HIR基因在作物抗旱中的作用第54-57页
5.结论与展望第57-58页
参考文献第58-63页
附录第63-71页
    附录1:文库测序结果举例第63-68页
    附录2:所用分子生物学实验方法第68-70页
        1.大肠杆菌感受态细胞的制备第68页
        2.大肠杆菌细胞的热激法转化第68-69页
        3.根癌农杆菌感受态细胞制备第69页
        4.农杆菌细胞的冻融法转化第69页
        5.CTAB提取拟南芥基因组DNA第69页
        6.LB培养基第69-70页
        7.YEB培养基第70页
    附录3:缩写词第70-71页
在学期间发表的论文第71-72页
致谢第72页

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