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鳄蜥(Shinisaurus crocodilurus)微卫星文库的构建及遗传结构分析

摘要第1-5页
Abstract第5-9页
第一章 综述第9-20页
 第一节 鳄蜥研究现状第9-12页
  1 分类地位第9页
  2 种群地理分布第9-10页
  3 形态学研究第10页
  4 生理、生化及解剖学研究第10页
  5 生态习性第10-11页
   ·鳄蜥的栖息地选择第10页
   ·行为习性第10-11页
   ·热生态学第11页
   ·交配繁殖模式第11页
   ·食性第11页
  6 人工繁殖第11-12页
  7 鳄蜥的保护遗传学研究第12页
 第二节 保护遗传学及常用分子遗传标记第12-18页
  1 保护遗传学第12-13页
  2 常用分子遗传标记第13-16页
   ·等位酶技术第13页
   ·随机扩增多态DNA(RAPD)第13-14页
   ·扩增片段长度多态性(AFLP)第14页
   ·主要组织相容性复合体(MHC)第14页
   ·限制性片段长度多态性(RFLP)第14-15页
   ·单核苷酸多态性(SNP)第15页
   ·线粒体DNA(mtDNA)第15页
   ·微卫星标记(SSR)第15-16页
  3 微卫星遗传标记的筛选及其应用第16-18页
   ·微卫星标记的引物获取第16-17页
     ·从数据库或相关文献中查询第16页
     ·从近缘物种中筛选第16页
     ·传统法第16页
     ·微卫星富集法第16-17页
   ·微卫星标记在濒危动物保护遗传学的应用第17-18页
     ·种群遗传结构分析第17页
     ·亲子鉴定及交配系统研究第17-18页
     ·种群动态和物种进化历史揭示第18页
     ·近缘物种及杂交个体鉴别第18页
     ·辅助种群调查第18页
 第三节 本研究的目的和意义第18-20页
  1 待解决问题第18-19页
  2 本研究目的及意义第19-20页
第二章 材料与方法第20-31页
 第一节 样品采集第20页
 第二节 主要试剂和仪器第20-22页
  1 主要试剂第20-21页
  2 主要仪器设备第21-22页
 第三节 实验方法第22-30页
  1 基因组DNA提取第22-23页
   ·组织样品DNA的提取第22页
   ·唾液样品DNA的提取第22-23页
  2 微卫星文库的构建第23-28页
   ·DNA提取第23页
   ·限制性酶切鳄蜥基因组DNA及酶切片段的选择回收第23-24页
   ·接头的连接及回收产物的检测与扩增第24-25页
   ·连接产物的扩增(SAULA扩增)与回收第25页
   ·杂交第25-26页
   ·磁珠富集洗脱第26-27页
   ·CA富集产物克隆转化第27-28页
  3 微卫星序列测定及引物设计第28页
  4 微卫星位点多态性检测第28-30页
   ·溶解引物第28页
   ·PCR反应条件摸索第28-29页
   ·聚丙烯酰胺电泳(PAGE)检测微卫星位点的多态性第29-30页
     ·10%非变性聚丙烯酰胺凝胶和显色液的制备第29页
     ·PAGE胶银染第29-30页
   ·扩增产物片段大小的确定第30页
  5 父权分析第30页
 第四节 数据分析第30-31页
第三章 结果与讨论第31-42页
 第一节 结果与分析第31-38页
  1 鳄蜥微卫星位点的筛选第31-35页
   ·鳄蜥基因组DNA的提取第31页
   ·限制性酶切第31-32页
   ·DNA片段与接头的连接第32页
   ·分子杂交与磁珠富集第32-33页
   ·阳性克隆筛选与测序第33-34页
   ·引物设计第34-35页
   ·微卫星位点的多态性检测第35页
  2 鳄蜥遗传多样性分析第35-38页
   ·哈温平衡与连锁不平衡检测第35页
   ·微卫星位点的多态信息含量第35-36页
   ·鳄蜥养殖种群遗传多样性第36-38页
 第二节 讨论第38-42页
  1 取样及DNA的提取第38-39页
   ·样品取样方法第38页
   ·口腔唾液DNA的提取第38-39页
  2 微卫星文库的构建第39-40页
   ·微卫星基因分型第39页
   ·微卫星在鳄蜥保护遗传学研究的应用第39-40页
  3 鳄蜥遗传结构分析第40-42页
   ·罗坑保护区鳄蜥人工养殖种群的遗传多样性第40-41页
   ·鳄蜥的保护对策第41-42页
参考文献第42-53页
附录第53-57页
附图第57-59页
攻读硕士期间发表的论文第59-60页
致谢第60-62页

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