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全基因组关联分析中上位性识别算法的研究及其并行化设计

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
第1章 绪论第11-18页
    1.1 引言第11-12页
    1.2 研究背景和意义第12-15页
        1.2.1 研究背景第12-14页
        1.2.2 研究意义第14-15页
    1.3 国内外研究现状与存在的问题第15-17页
    1.4 论文组织与结构第17-18页
第2章 上位效应概述与检测方法第18-25页
    2.1 上位效应含义第18-20页
    2.2 上位效应模型第20-22页
    2.3 上位效应检测方法第22-25页
第3章 基于贝叶斯理论的上位性识别算法的设计与实现第25-33页
    3.1 引言第25-26页
    3.2 算法设计与实现第26-30页
        3.2.1 上位性组第26-27页
        3.2.2 贝叶斯标记划分模型第27-28页
        3.2.3 先验分布的选择第28-29页
        3.2.4 马尔科夫—蒙特卡罗过程第29页
        3.2.5 上位性组的统计显著性第29-30页
    3.3 实验结果与分析第30-32页
        3.3.1 模拟实验第30-31页
        3.3.2 真实实验第31-32页
    3.4 本章小结第32-33页
第4章 基于蚁群优化的上位性识别算法的设计与实现第33-43页
    4.1 引言第33页
    4.2 算法设计与实现第33-37页
        4.2.1 蚁群优化介绍第33-34页
        4.2.2 赌轮选择和路径长度第34-36页
        4.2.3 信息素的更新与专家知识第36-37页
        4.2.4 后续处理第37页
    4.3 实验结果与分析第37-41页
        4.3.1 参数设置第37-38页
        4.3.2 模拟实验 1第38-40页
        4.3.3 模拟实验 2第40-41页
    4.4 本章小结第41-43页
第5章 并行化技术在上位性识别中的研究与应用第43-54页
    5.1 引言第43页
    5.2 算法设计与实现第43-51页
        5.2.1 问题描述第43-44页
        5.2.2 卡方测试的上限值第44-46页
        5.2.3 Hadoop 分布式系统基础架构基本介绍第46-47页
        5.2.4 Hadoop 分布式文件系统 HDFS第47-48页
        5.2.5 MapReduce 框架第48-50页
        5.2.6 云计算模型第50-51页
    5.3 实验结果与分析第51-53页
        5.3.1 模拟实验第51页
        5.3.2 真实数据实验第51-53页
    5.4 本章小结第53-54页
第6章 结束语第54-56页
参考文献第56-60页
致谢第60-61页
攻读硕士学位期间的研究成果第61页

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