| 目录 | 第5-7页 |
| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-16页 |
| 1 EST概述 | 第10页 |
| 2 部分DNA分子标记在甘蔗研究上的应用 | 第10-11页 |
| 2.1 RAPD标记在甘蔗研究上的应用 | 第10-11页 |
| 2.2 AFLP标记在甘蔗研究上的应用 | 第11页 |
| 2.3 TRAP标记在甘蔗研究上的应用 | 第11页 |
| 2.4 SSR标记在甘蔗研究上的应用 | 第11页 |
| 3 EST-SSRs标记 | 第11-12页 |
| 4 EST-SSRs标记的应用 | 第12-14页 |
| 4.1 遗传图谱构建 | 第12-13页 |
| 4.2 遗传多样性研究 | 第13页 |
| 4.3 基因比较作图 | 第13-14页 |
| 5 研究内容、目的和意义 | 第14-16页 |
| 5.1 研究内容 | 第14页 |
| 5.2 研究目的 | 第14页 |
| 5.3 研究意义 | 第14-15页 |
| 5.4 研究方法与技术路线 | 第15-16页 |
| 第二章 甘蔗EST资源中的SSR信息分析 | 第16-20页 |
| 1 材料与方法 | 第16页 |
| 1.1 甘蔗EST来源 | 第16页 |
| 1.2 EST前处理 | 第16页 |
| 1.3 去冗余-聚类 | 第16页 |
| 1.4 SSR筛选 | 第16页 |
| 2 结果与分析 | 第16-19页 |
| 2.1 甘蔗EST中出现SSR的频率 | 第16-17页 |
| 2.2 甘蔗EST-SSRs标记的特性 | 第17-18页 |
| 2.3 甘蔗EST-SSRs标记的多态性潜力预测 | 第18-19页 |
| 3 讨论 | 第19-20页 |
| 第三章 甘蔗EST-SSRs标记的开发 | 第20-46页 |
| 1 材料与方法 | 第20-36页 |
| 1.1 植物材料 | 第20-21页 |
| 1.2 仪器及软件 | 第21页 |
| 1.3 主要试剂与来源 | 第21-23页 |
| 1.5 DNA浓度测定和质量判定 | 第23页 |
| 1.6 ESTSSRs引物设计 | 第23页 |
| 1.7 PCR反应体系和程序优化 | 第23-24页 |
| 1.8 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第24页 |
| 1.9 毛细管电泳检测 | 第24-25页 |
| 1.10 引物筛选 | 第25-36页 |
| 2 结果与分析 | 第36-46页 |
| 2.1 DNA提取结果与质量检测 | 第36页 |
| 2.2 退火温度优化结果 | 第36-37页 |
| 2.3 PCR反应体系的优化结果 | 第37-38页 |
| 2.4 引物筛选结果 | 第38-46页 |
| 第四章 甘蔗EST-SSRs标记的鉴定 | 第46-63页 |
| 1 材料与方法 | 第46-49页 |
| 1.1 供试材料 | 第46-47页 |
| 1.2 实验方法 | 第47-49页 |
| 1.3 条带统计与分析 | 第49页 |
| 2 结果与分析 | 第49-60页 |
| 2.0 SSR扩增产物及条带分析 | 第49-51页 |
| 2.1 遗传相似性分析 | 第51-54页 |
| 2.2 遗传多样性分析 | 第54-56页 |
| 2.3 聚类分析 | 第56-59页 |
| 2.4 主成分分析(PCA) | 第59-60页 |
| 3 讨论 | 第60-63页 |
| 3.1 关于EST-SSRs标记与基因组SSR标记引物 | 第60-61页 |
| 3.2 关于所测试甘蔗无性系的遗传多样性 | 第61-62页 |
| 3.3 关于所开发的引物的后续利用 | 第62页 |
| 3.4 关于进一步开发EST-SSRs标记的可能性 | 第62-63页 |
| 全文总结 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-70页 |
| 致谢 | 第70页 |