| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 1 前言 | 第14-30页 |
| 1.1 哺乳类动物性别决定 | 第14-16页 |
| 1.1.1 Sry基因的结构和功能 | 第15页 |
| 1.1.2 Sry的进化 | 第15-16页 |
| 1.1.3 Sry基因的下游基因 | 第16页 |
| 1.2 哺乳类动物卵巢的分化发育 | 第16-22页 |
| 1.2.1 哺乳类动物卵巢的结构及分化发育 | 第16-18页 |
| 1.2.2 卵巢早期发育的分子机理 | 第18-22页 |
| 1.3 鱼类性别决定 | 第22-25页 |
| 1.3.1 鱼类性别决定基因 | 第22-23页 |
| 1.3.2 影响鱼类性别决定的环境因子 | 第23-25页 |
| 1.4 鱼类卵巢分化发育的机理 | 第25-28页 |
| 1.4.1 鱼类卵巢的分化发育 | 第25页 |
| 1.4.2 鱼类卵巢发育相关的分子机理 | 第25-28页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第28-30页 |
| 2 材料与方法 | 第30-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第30-34页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第30页 |
| 2.1.2 实验仪器设备 | 第30页 |
| 2.1.3 常用试剂与耗材 | 第30-31页 |
| 2.1.4 常用溶液配方 | 第31-33页 |
| 2.1.5 PCR扩增引物 | 第33页 |
| 2.1.6 生物信息学分析软件和在线网址 | 第33-34页 |
| 2.2 研究方法 | 第34-44页 |
| 2.2.1 黄河鲤卵巢不同发育时期的组织学观察 | 第34页 |
| 2.2.2 黄河鲤性腺分化早期相关基因的表达 | 第34-35页 |
| 2.2.3 黄河鲤卵巢发育关键时期的转录组测序及信息分析 | 第35-36页 |
| 2.2.4 卵巢分化发育密切相关DEGs结构和表达模式研究 | 第36-41页 |
| 2.2.5 信号通路对黄河鲤卵巢分化发育的影响 | 第41-42页 |
| 2.2.6 TPT对黄河鲤卵巢分化发育的影响 | 第42-44页 |
| 3 结果 | 第44-120页 |
| 3.1 黄河鲤卵巢发育的组织学特征 | 第44-45页 |
| 3.2 黄河鲤性腺分化关键时间的确定 | 第45-47页 |
| 3.2.1 性腺分化早期相关基因的表达趋势 | 第45页 |
| 3.2.2 雄性性别分化相关基因的表达 | 第45页 |
| 3.2.3 雌性性别分化相关基因的表达 | 第45-47页 |
| 3.3 黄河鲤卵巢发育关键时期转录组的比较与分析 | 第47-57页 |
| 3.3.1 黄河鲤卵巢发育关键时期的组织学特征 | 第47-48页 |
| 3.3.2 卵巢转录物组信息分析 | 第48-49页 |
| 3.3.3 不同发育时期基因的表达分析 | 第49-50页 |
| 3.3.4 不同发育时期基因和DEGs的GO功能分析 | 第50-53页 |
| 3.3.5 卵巢发育期间DEGs的KEGG分析 | 第53页 |
| 3.3.6 QRT-PCR 验证和分析性腺发育相关 DEGs | 第53-56页 |
| 3.3.7 基因SNP和INDEL的鉴定 | 第56页 |
| 3.3.8 基因可变剪接分析 | 第56-57页 |
| 3.4 卵巢分化密切相关的DEGs结构和表达模式分析 | 第57-90页 |
| 3.4.1 foxl2基因 | 第57-68页 |
| 3.4.2 dax1基因 | 第68-76页 |
| 3.4.3 lhx8基因 | 第76-83页 |
| 3.4.4 dnmt1基因 | 第83-90页 |
| 3.5 信号通路对黄河鲤卵巢分化发育的影响 | 第90-107页 |
| 3.5.1 notch信号通路抑制剂DAPT对黄河鲤卵巢分化发育的影响 | 第90-103页 |
| 3.5.2 NF-κB信号通路对黄河鲤卵巢分化的影响 | 第103-107页 |
| 3.6 TPT对黄河鲤卵巢分化发育的影响 | 第107-120页 |
| 3.6.1 TPT对原始性腺分化发育的影响 | 第107页 |
| 3.6.2 TPT对体外短期培养原始性腺基因表达的影响 | 第107-108页 |
| 3.6.3 TPT对体外短期培养幼稚精、卵巢基因表达的影响 | 第108-110页 |
| 3.6.4 TPT处理黄河鲤原始性腺、幼稚精卵巢的转录物组分析 | 第110-120页 |
| 4 讨论 | 第120-140页 |
| 4.1 黄河鲤卵巢分化关键时间的确定为研究卵巢发育提供了基础资料 | 第120-121页 |
| 4.2 转录组测序研究卵巢分化发育的分子机制 | 第121-126页 |
| 4.2.1 三个卵巢发育时期的形态学和基因表达特征 | 第122-123页 |
| 4.2.2 与卵巢分化发育相关的信号通路 | 第123-125页 |
| 4.2.3 PGC-OJ的DEGs是重要的候选基因资源 | 第125页 |
| 4.2.4 基因的选择性剪切呈现了丰富的的遗传信息 | 第125-126页 |
| 4.3 卵巢分化发育候选基因结构和表达分析 | 第126-132页 |
| 4.3.1 Foxl2基因 | 第126-128页 |
| 4.3.2 Dax1基因 | 第128-129页 |
| 4.3.3 Lhx8基因 | 第129-130页 |
| 4.3.4 Dnmt1基因 | 第130-132页 |
| 4.4 信号通路对黄河鲤卵巢分化发育的影响 | 第132-136页 |
| 4.4.1 Notch信号通路抑制剂DAPT参与调控黄河鲤卵巢分化 | 第132-134页 |
| 4.4.2 NF-κB信号参与调控黄河鲤精、卵巢分化 | 第134-136页 |
| 4.5 TPT对黄河鲤卵巢分化发育的影响 | 第136-140页 |
| 4.5.1 TPT抑制黄河鲤仔鱼卵巢的分化 | 第136-137页 |
| 4.5.2 TPT调控类固醇合成相关基因的表达抑制卵巢的分化发育。 | 第137页 |
| 4.5.3 转录组测序分析TPT对卵巢分化发育的干扰机制 | 第137-140页 |
| 5. 结论 | 第140-142页 |
| 5.1 首次确定黄河鲤性腺初始分化的关键时间在 45-50 dpf | 第140页 |
| 5.2 分析不同发育时期卵巢转录组信息发现与卵巢分化密切相关的基因和信号通路 | 第140页 |
| 5.3 Foxl2、dax1、lhx8、dnmt1可能分别参与了卵巢的分化发育和功能维持 | 第140页 |
| 5.4 Notch和NF-κB信号通路可能参与调控黄河鲤卵巢发育 | 第140-141页 |
| 5.5 TPT诱导性腺分化的分子机制可能与类固醇激素生物合成有关 | 第141-142页 |
| 参考文献 | 第142-158页 |
| 附录 | 第158-188页 |
| 附录A 缩略语 | 第158-161页 |
| 附录B 附表 | 第161-165页 |
| 附录C 附图 | 第165-188页 |
| 致谢 | 第188-191页 |
