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基于自身基因组SSR标记的中国樱桃遗传多样性及群体遗传分析

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
缩略词表第8-11页
1 前言第11-20页
    1.1 中国樱桃介绍第11页
    1.2 中国樱桃种质资源的分布及现状第11-13页
        1.2.1 中国樱桃的主要分布第11-12页
        1.2.2 中国樱桃生存与利用现状第12-13页
    1.3 遗传多样性和群体遗传结构第13-14页
        1.3.1 基本概念第13页
        1.3.2 影响遗传多样性及群体遗传结构的因素第13-14页
    1.4 中国樱桃遗传多样性研究进展第14-18页
        1.4.1 形态学标记第14-15页
        1.4.2 细胞学标记第15页
        1.4.3 DNA水平的研究第15-18页
        1.4.4 存在的局限第18页
    1.5 本研究的目的与意义第18-20页
2 材料与方法第20-25页
    2.1 实验材料第20-22页
    2.2 总基因组DNA的提取与检测第22页
    2.3 SSR引物的开发与筛选第22页
    2.4 SSR-PCR扩增与聚丙烯酰胺凝胶电泳第22-23页
        2.4.1 SSR-PCR扩增体系第22-23页
        2.4.2 聚丙烯酰胺制胶流程第23页
    2.5 分子数据的统计与分析第23-25页
        2.5.1 条带的统计第23页
        2.5.2 遗传多样性及遗传瓶颈分析第23-24页
        2.5.3 群体遗传结构与分化分析第24-25页
3 结果与分析第25-38页
    3.1 自身基因组SSR引物筛选与评价第25-28页
        3.1.1 引物筛选第25-27页
        3.1.2 引物多态性评价第27-28页
    3.2 中国樱桃的遗传多样性评价第28-29页
    3.3 遗传瓶颈效应第29-32页
    3.4 群体遗传结构与分化第32-38页
        3.4.1 STRUCTURE结果第32页
        3.4.2 邻位法(NJ)聚类分析第32-35页
        3.4.3 主成分分析(PCoA)第35页
        3.4.4 群体间的遗传分化第35-38页
4 讨论第38-42页
    4.1 中国樱桃自身基因组开发的SSR分子标记的评价第38页
    4.2 中国樱桃遗传多样性评价第38-39页
    4.3 中国樱桃群体遗传结构分析第39-41页
    4.4 中国樱桃的保护及改良策略第41-42页
5 小结第42-44页
    5.1 结论第42-43页
    5.2 创新点第43-44页
参考文献第44-51页
致谢第51-52页
论文撰写与发表情况第52页

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