摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-8页 |
引言 | 第8-10页 |
1 基础理论 | 第10-19页 |
·分子力场 | 第10-13页 |
·分子力场概述 | 第10页 |
·分子力场中所有作用项的一般形式 | 第10-13页 |
·ABEEM-7P水分子模型 | 第13-15页 |
·ABEEM-7P水分子模型概述 | 第13-14页 |
·ABEEM-7P水分子模型总能量 | 第14-15页 |
·分子动力学模拟 | 第15-19页 |
·分子动力学模拟原理简介 | 第15-16页 |
·周期性边界条件 | 第16-17页 |
·截断半径与最近镜像 | 第17-19页 |
2 ABEEM-7P模型下水分子的动力学模拟 | 第19-39页 |
·分子动力学模拟细节 | 第19页 |
·不同条件对NPT系综下水分子动力学模拟性质的影响 | 第19-31页 |
·不同NVT系综运行时间的影响 | 第19-20页 |
·不同压力弛豫时间P? 的影响 | 第20-21页 |
·氧原子上孤对电子和氢原子开始形成氢键距离的影响 | 第21-31页 |
·NPT系综下不同温度、模拟时间和压力弛豫时间的动力学模拟 | 第31-38页 |
·216个水分子的动力学性质随温度的变化 | 第31-34页 |
·500个水分子的动力学性质随温度的变化 | 第34-38页 |
·小结 | 第38-39页 |
3 ABEEM力场和AMBER力场的比较 | 第39-46页 |
·216个水分子动力学性质的比较 | 第39-41页 |
·500个水分子动力学性质的比较 | 第41-44页 |
·小结 | 第44-46页 |
结论 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-49页 |
致谢 | 第49页 |