基于改进蜂群算法的三维蛋白质结构预测研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 1 绪论 | 第11-19页 |
| ·研究背景 | 第11-14页 |
| ·研究的目的及意义 | 第14-15页 |
| ·国内外现状 | 第15-17页 |
| ·本文的研究内容 | 第17页 |
| ·本文的章节安排 | 第17-19页 |
| 2 蛋白质的结构及其预测的相关知识 | 第19-31页 |
| ·蛋白质的组成 | 第19-20页 |
| ·蛋白质结构预测模型 | 第20-26页 |
| ·2D HP格点模型 | 第21-23页 |
| ·2D AB非格点模型 | 第23-25页 |
| ·全原子模型 | 第25-26页 |
| ·蛋白质结构预测方法分类 | 第26-28页 |
| ·蛋白质二级结构预测 | 第26页 |
| ·蛋白质三维结构预测 | 第26-28页 |
| ·常用蛋白质数据库 | 第28-29页 |
| ·本章小结 | 第29-31页 |
| 3 基于DE-ABC的 3D蛋白质折叠预测 | 第31-46页 |
| ·AB非格点模型的描述 | 第31-33页 |
| ·相关的搜索算法 | 第33-37页 |
| ·差分算法的原理 | 第33-36页 |
| ·人工蜂群算法原理 | 第36-37页 |
| ·混合的DE-ABC算法 | 第37-39页 |
| ·实验结果与分析 | 第39-45页 |
| ·参数设置 | 第39页 |
| ·斐波那契数列结果 | 第39-42页 |
| ·真实蛋白质序列结果 | 第42-45页 |
| ·本章小结 | 第45-46页 |
| 4 基于改进蜂群算法的蛋白质折叠预测 | 第46-60页 |
| ·Toy模型的数学描述 | 第46页 |
| ·人工蜂群算法基本原理 | 第46页 |
| ·改进的算法及相关策略 | 第46-49页 |
| ·提高的策略 | 第46-47页 |
| ·改进后的算法流程 | 第47-49页 |
| ·实验结果与分析 | 第49-59页 |
| ·参数设置 | 第49-50页 |
| ·斐波那契数列结果 | 第50-54页 |
| ·真实蛋白质序列结果 | 第54-57页 |
| ·结果比较与分析 | 第57-59页 |
| ·本章小结 | 第59-60页 |
| 5 总结与展望 | 第60-62页 |
| ·论文工作总结 | 第60页 |
| ·研究展望 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-67页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
