| 中文摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-26页 |
| 1 野鸟与禽流感病原生态学研究 | 第9-11页 |
| ·野鸟种群中禽流感病毒的分布 | 第9-10页 |
| ·野鸟中禽流感病毒的遗传变异 | 第10页 |
| ·候鸟迁徙与禽流感病毒的传播 | 第10-11页 |
| 2 禽流感病毒跨种传播研究 | 第11-16页 |
| ·流感病毒概述 | 第11-12页 |
| ·流感哺乳动物感染模型 | 第12-13页 |
| ·流感病毒哺乳动物间水平传播机制 | 第13-14页 |
| ·反向遗传学技术在流感病毒中的应用 | 第14-16页 |
| 3 病毒宏基因组学研究进展 | 第16-26页 |
| ·病毒宏基因组的兴起 | 第17-18页 |
| ·病毒宏基因组的优势及策略 | 第18-20页 |
| ·高通量测序 | 第20-24页 |
| ·病毒宏基因组学在公共卫生中的应用 | 第24页 |
| ·宏基因组学技术的机遇与挑战 | 第24-26页 |
| 第二章 野鸟禽流感监测及遗传特征分析 | 第26-57页 |
| 1 材料与方法 | 第27-33页 |
| ·材料与试剂 | 第27页 |
| ·主要仪器 | 第27-28页 |
| ·样品采集 | 第28页 |
| ·样品处理及鉴定 | 第28-31页 |
| ·流感病毒分离 | 第31-33页 |
| ·测序及进化树构建 | 第33页 |
| 2 实验结果 | 第33-54页 |
| ·调查结果 | 第33-37页 |
| ·禽流感与猪、人流感进化关系 | 第37-47页 |
| ·禽流感病毒基因重组、重配 | 第47-54页 |
| 3 讨论 | 第54-56页 |
| 4 小结 | 第56-57页 |
| 第三章 应用小鼠模型评估野鸟源病毒对哺乳动物的致病性 | 第57-69页 |
| 1 材料与方法 | 第58-61页 |
| ·实验毒株 | 第58页 |
| ·主要试剂 | 第58页 |
| ·主要仪器 | 第58页 |
| ·实验动物 | 第58页 |
| ·试验方法 | 第58-61页 |
| 2 实验结果 | 第61-67页 |
| ·病毒HA裂解位点 | 第61-62页 |
| ·小鼠感染情况 | 第62-64页 |
| ·感染小鼠病毒滴度 | 第64-66页 |
| ·感染小鼠病理变化 | 第66-67页 |
| 3 讨论 | 第67-68页 |
| 4 小结 | 第68-69页 |
| 第四章 野鸟源病毒在哺乳动物间跨种传播能力评估 | 第69-81页 |
| 1 材料与方法 | 第69-73页 |
| ·实验毒株 | 第69-70页 |
| ·实验动物及鸡胚 | 第70页 |
| ·主要试剂 | 第70页 |
| ·主要仪器 | 第70页 |
| ·实验方法 | 第70-73页 |
| 2 实验结果 | 第73-79页 |
| ·野鸟源病毒受体分析 | 第73-75页 |
| ·豚鼠传播实验结果 | 第75-77页 |
| ·H3N2病毒株构建 | 第77-78页 |
| ·H3N2变异株受体分析 | 第78-79页 |
| 3 讨论 | 第79-80页 |
| 4 小结 | 第80-81页 |
| 第五章 病毒宏基因组学方法建立及应用 | 第81-97页 |
| 1 材料与方法 | 第82-86页 |
| ·试剂及材料 | 第82页 |
| ·主要仪器 | 第82页 |
| ·样品制备 | 第82-84页 |
| ·测序和数据分析 | 第84-86页 |
| 2 实验结果 | 第86-95页 |
| ·样品检测结果 | 第86-87页 |
| ·高通量测序结果 | 第87-92页 |
| ·病毒分离与验证 | 第92页 |
| ·新型猪嵴病毒变异株分析 | 第92-94页 |
| ·吉林省鼠汉坦病毒进化分析 | 第94-95页 |
| 3 讨论 | 第95-96页 |
| 4 小结 | 第96-97页 |
| 结论 | 第97-98页 |
| 缩略词 | 第98-100页 |
| 参考文献 | 第100-115页 |
| 致谢 | 第115-116页 |
| 博士期间发表的学术论文 | 第116-117页 |