| 摘要 | 第1-9页 |
| abstract | 第9-12页 |
| 1 .前言 | 第12-28页 |
| ·水稻纹枯病简介 | 第12-18页 |
| ·水稻纹枯病病征 | 第13-14页 |
| ·立枯丝核菌简介 | 第14-15页 |
| ·立枯丝核菌的分类地位和分类特征 | 第15-16页 |
| ·立枯丝核菌的病原形态和病原生物学 | 第16-17页 |
| ·立枯丝核菌的致病机理 | 第17-18页 |
| ·物理图谱构建 | 第18-22页 |
| ·光学图谱 | 第19-20页 |
| ·荧光原位杂交 | 第20-21页 |
| ·序列标签位点作图 | 第21-22页 |
| ·染色体核型分析 | 第22-23页 |
| ·全基因组重测序研究 | 第23-27页 |
| ·高通量测序技术简介 | 第24-26页 |
| ·重测序研究进展 | 第26-27页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第27-28页 |
| 2. 材料与方法 | 第28-42页 |
| ·材料 | 第28-30页 |
| ·所用菌株材料 | 第28页 |
| ·菌株与质粒 | 第28页 |
| ·酶与生化试剂 | 第28-29页 |
| ·仪器设备 | 第29-30页 |
| ·培养基 | 第30页 |
| ·方法 | 第30-42页 |
| ·立枯丝核菌活化及生长观察 | 第30页 |
| ·立枯丝核菌细胞形态学观察 | 第30-31页 |
| ·立枯丝核菌侵染离体叶片组织 | 第31页 |
| ·真菌染色体压片 | 第31-32页 |
| ·荧光原位杂交(FISH) | 第32-35页 |
| ·高低毒力重测序 | 第35-36页 |
| ·基因功能验证 | 第36-42页 |
| 3. 结果与分析 | 第42-67页 |
| ·立枯丝核菌AG-11A、D12、D23菌株细胞形态学观察 | 第42-44页 |
| ·菌落形成过程的观察 | 第42-44页 |
| ·菌株AG-11A菌丝形态的显微观察 | 第44页 |
| ·高中低毒力菌株侵染水稻叶片的观察 | 第44-45页 |
| ·染色体核型分析 | 第45-47页 |
| ·荧光原位杂交 | 第47-49页 |
| ·立枯丝核菌AG-11A 02888基因克隆 | 第47-49页 |
| ·荧光原位杂交结果 | 第49页 |
| ·高低毒力重测序 | 第49-51页 |
| ·高低毒力重测序基因功能验证 | 第51-67页 |
| ·三个Effector基因活性检测、序列结构比较分析 | 第51-54页 |
| ·SNPs随机验证 | 第54-55页 |
| ·代谢组学数据分析 | 第55-67页 |
| 4. 讨论与展望 | 第67-70页 |
| ·立枯丝核菌核型分析 | 第67页 |
| ·立枯丝核菌荧光原位杂交 | 第67-68页 |
| ·立枯丝核菌高低毒力全基因组重测序分析 | 第68-69页 |
| ·高中低毒力菌株代谢组分析 | 第69页 |
| ·本文创新之处 | 第69页 |
| ·后续实验展望 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
| 附录 | 第77-95页 |