多搜索策略的多生物序列比对自适应遗传算法
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-15页 |
| ·课题背景 | 第11-12页 |
| ·研究目的及意义 | 第12-13页 |
| ·国内外在该方向的研究现状及分析 | 第13页 |
| ·论文的主要工作及结构安排 | 第13-15页 |
| 第2章 生物序列比对的基础知识 | 第15-23页 |
| ·生物序列比对的概念 | 第15页 |
| ·现有的生物序列比对技术 | 第15-19页 |
| ·相似性比对方法 | 第15-16页 |
| ·打分矩阵比对方法 | 第16-17页 |
| ·蛋白质打分矩阵 | 第17-18页 |
| ·目标函数比对方法 | 第18-19页 |
| ·连续空位比对方法 | 第19-20页 |
| ·双序列比对算法与多序列比对算法 | 第20-22页 |
| ·双序列比对方法 | 第20-21页 |
| ·多序列比对算法 | 第21-22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 第3章 多序列比对研究的目标 | 第23-26页 |
| ·多序列比对问题的提出 | 第23页 |
| ·多序列比对问题的描述 | 第23页 |
| ·现有的比对算法研究中存在的主要问题 | 第23-24页 |
| ·多序列比对算法研究的目标 | 第24页 |
| ·本章小结 | 第24-26页 |
| 第4章 多序列比对遗传算法的实现 | 第26-30页 |
| ·遗传算法概述 | 第26页 |
| ·基于遗传算法的多序列比对遗传算法的基本思想 | 第26-27页 |
| ·基于遗传算法的多序列比对遗传算法的描述 | 第27-29页 |
| ·基本步骤 | 第27-28页 |
| ·多序列比对遗传算法流程图 | 第28-29页 |
| ·各种改进的遗传算法 | 第29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第5章 自适应遗传算法的关键技术 | 第30-45页 |
| ·自适应遗传算法的主要思想 | 第30页 |
| ·自适应遗传算法设计及实现 | 第30-35页 |
| ·问题的物理表示 | 第30-32页 |
| ·获取PAM-N打分矩阵 | 第32-34页 |
| ·获取序列 | 第34-35页 |
| ·自适应遗传算法的初始化 | 第35页 |
| ·自适应遗传算法遗传策略的设计 | 第35-44页 |
| ·适应度计算 | 第36-39页 |
| ·基于熵的遗传算子的变化 | 第39-40页 |
| ·两点交叉算子 | 第40-43页 |
| ·两点变异算子 | 第43-44页 |
| ·终止条件 | 第44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第6章 比对测试的结果及分析 | 第45-51页 |
| ·测试数据来源 | 第45页 |
| ·评判标准 | 第45-46页 |
| ·交叉概率和变异概率的调整 | 第46页 |
| ·测试结果分析 | 第46-50页 |
| ·输出结果示例 | 第46-49页 |
| ·测试综合分析 | 第49-50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 第7章 总结及展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
