| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-14页 |
| 第二章 蛋白质组概况 | 第14-25页 |
| ·基本概念 | 第14-18页 |
| ·蛋白质，多肽及其序列 | 第14-16页 |
| ·蛋白质组 | 第16-18页 |
| ·质谱仪器以及蛋白质鉴定相关技术 | 第18-25页 |
| ·概述 | 第18页 |
| ·质谱介绍 | 第18-21页 |
| ·蛋白质鉴定算法介绍以及SEQUEST[18]详述 | 第21-25页 |
| 第三章 定量蛋白质组技术 | 第25-40页 |
| ·定量蛋白质组定量技术简介 | 第25-32页 |
| ·基于2DE 点光密度的定量方法 | 第26页 |
| ·基于质谱的标记定量技术简介 | 第26-28页 |
| ·基于质谱的非标记定量技术 | 第28-32页 |
| ·现有的定量软件介绍 | 第32-36页 |
| ·概述 | 第32页 |
| ·ASAPRatio | 第32-36页 |
| ·ReLEX | 第36页 |
| ·现有的定量软件优点以及问题 | 第36-38页 |
| ·发展与展望 | 第38-40页 |
| 第四章 定量蛋白质组软件Quant 开发 | 第40-56页 |
| ·引言 | 第40页 |
| ·系统概述 | 第40-45页 |
| ·系统构架 | 第42-45页 |
| ·方法与流程 | 第45-56页 |
| ·质谱数据标准 | 第45-47页 |
| ·数据过滤 | 第47页 |
| ·读取肽段信息 | 第47-49页 |
| ·构建单一肽段离子的色谱图 | 第49-50页 |
| ·评估数据 | 第50-51页 |
| ·平滑 | 第51-53页 |
| ·确定峰位置 | 第53-55页 |
| ·计算峰下面积得到相对定量结果 | 第55-56页 |
| 第五章 定量结果分析 | 第56-62页 |
| ·软件测试评估 | 第56-59页 |
| ·标准实验设计 | 第56-57页 |
| ·标准数据测试结果 | 第57-59页 |
| ·比较测试 | 第59-60页 |
| ·结果与讨论 | 第60-62页 |
| 第六章 结论与展望 | 第62-65页 |
| ·主要工作进展 | 第62-63页 |
| ·定量过程中常见的技术难点以及对应的策略 | 第63-64页 |
| ·峰信号处理算法 | 第63页 |
| ·峰选择过程中聚类算法的孤立点分析 | 第63页 |
| ·质谱同位素峰识别算法 | 第63-64页 |
| ·与国内外同类研究工作相比的创新性 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文目录 | 第69页 |