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人Brg1蛋白Bromodomain结构域的溶液结构测定及其与乙酰化组蛋白的相互作用研究

目录第1-8页
中文摘要第8-10页
英文摘要第10-12页
第一部分 综述:染色质重构及人Brg1蛋白质生物学功能第12-49页
 第一章 真核生物的染色质重构第12-26页
  1.染色质重构的定义第12-13页
  2.ATP依赖的染色质重构复合物至少可分为四类第13-18页
     ·SWI2/SNF2亚类第14-16页
     ·ISWI亚类第16页
     ·Mi-2亚类第16-17页
     ·DOMINO亚类第17页
     ·INO80复合物第17-18页
  3.ATP依赖的染色质重构机理第18-22页
     ·染色质重构复合物与DNA和核小体的结合第18-19页
     ·ATP依赖的核小体解聚第19-20页
     ·ATP依赖的染色质重构第20-22页
  4.染色质重构复合物在细胞周期中的作用第22-23页
  5.染色质重构复合物在启动子的定位第23-26页
 第二章 组蛋白密码第26-34页
  1.表观遗传第26页
  2.组蛋白的化学修饰第26-29页
     ·组蛋白乙酰化第28页
     ·组蛋白甲基化第28页
     ·组蛋白磷酸化第28-29页
     ·组蛋白的泛素化第29页
  3.组蛋白密码第29-31页
  4.组蛋白密码的解读第31-32页
  5.乙酰化的生物学功能第32-34页
 第三章 人Brg1的生物学功能第34-42页
  1.hBrg1在细胞周期调控中的作用第34-37页
  2.Brg1在肿瘤发生中的作用第37-38页
     ·Brg1与肺癌第38页
     ·Brg1与乳腺癌第38页
  3.Brg1在发育和分化中的作用第38-42页
     ·Brg1与肌肉细胞的发育与分化第38-40页
     ·Brg1与神经细胞的发育与分化第40-41页
     ·Brg1与淋巴细胞的发育与分化第41-42页
 参考文献第42-49页
第二部分 人Brg1 Bromodomain结构域的溶液结构及其与乙酰化组蛋白相互作用的研究第49-99页
 第四章 Brg1 Bromodomain简介第49-56页
  1.人Brg1蛋白质第49页
  2.Bromodomain的分类第49-50页
  3.Bromodomain的结构第50-51页
  4.Bromodomain是乙酰化赖氨酸结合结构域第51页
  5.Bromodomain的配基选择性第51-53页
  6.Bromodomain的生物学功能第53-54页
  7.染色质重构复合物和组蛋白乙酰化复合物(HATs)第54-55页
  8.本研究课题的内容与意义第55-56页
 第五章 材料和方法第56-76页
  1.人Brg1蛋白质Bromodomain结构域基因的亚克隆第56-60页
     ·Brg1 Bromodomain基因的引物设计及PCR扩增第56-57页
     ·PCR产物胶回收第57页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备及质粒的转化第57-58页
     ·重组Bromodomain-pGEM-T质粒的构建与扩增第58-59页
     ·载体pET-22b(+)的中量制备(碱裂解法)第59-60页
     ·人Brg1 Bromodomain表达质粒(BD-pET-22b)的构建第60页
  2.人Brg1 Bromodomain结构域的表达与纯化第60-61页
  3.蛋白质分子量鉴定第61-63页
     ·%SDS-PAGE蛋白质电泳第61-62页
     ·小肽电泳第62-63页
  4.蛋白质浓度的测定第63页
  5.圆二色光谱(CD)第63页
  6.多肽合成与纯化第63-64页
  7.NMR波谱解析人Brg1 Bromodomain结构域的三维溶液空间结构第64-74页
     ·~(15)N-标记和~(15)N/~(13)C双标记Bromodomain结构域的样品制备第64-65页
     ·NMR实验与数据变换第65-69页
     ·主链顺序认证及侧链化学位移的获得第69-71页
     ·二级结构的确定第71-72页
     ·结构计算第72-74页
  8.化学位移干扰实验第74-75页
  9.人Brg1 Bromodomain与乙酰化H3-K14的分子动力学模拟第75页
  10.Brg1 Bromodomain突变体的制备第75-76页
 第六章 实验结果与讨论第76-97页
  1.Brg1 Bromodomain的基因克隆和表达载体构建第76页
  2.Brg1 Bromodomain结构域的表达和纯化第76-77页
  3.Brg1 Bromodomain蛋白质的稳定性研究第77-79页
  4.NMR波谱解析人Brg1 Bromodomain蛋白质的三维溶液结构第79-85页
     ·Brg1 Bromodomain主链和侧链的化学位移认证第79-81页
     ·Brg1 Bromodomain的氢氘交换实验和二级结构预测第81-82页
     ·Bromodomain的蛋白质的结构计算第82-85页
  5.Brg1 Bromodomain的结构描述第85-87页
  6.Brg1 Bromodomain与其它Bromodomain的结构比较第87-88页
  7.Brg1 Bromodomain与乙酰化组蛋白多肽的结合第88-92页
  8.Brg1 Bromodomain与H3-AcK14的复合物模型第92-93页
  9.Brg1 Bromodomain与乙酰化组蛋白的突变研究第93-95页
  10.讨论第95-97页
 参考文献第97-99页
致谢第99-100页
发表论文第100页
学术会议第100页

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