| 摘要 | 第1-13页 |
| Abstract | 第13-15页 |
| 1 前言 | 第15-40页 |
| ·海洋多环芳烃来源危害及其降解微生物 | 第15-18页 |
| ·海洋多环芳烃来源 | 第15-16页 |
| ·多环芳烃的危害 | 第16-17页 |
| ·多环芳烃降解微生物种类 | 第17-18页 |
| ·解决难培养微生物培养难题的思路 | 第18页 |
| ·微生物降解芘的分子机制研究进展 | 第18-40页 |
| 2 材料与方法 | 第40-62页 |
| ·材料 | 第40-44页 |
| ·菌株来源 | 第40页 |
| ·试剂和药品 | 第40页 |
| ·分子生物学用酶 | 第40-41页 |
| ·分子生物学试剂盒和细菌生理生化测试条 | 第41页 |
| ·主要仪器 | 第41页 |
| ·本研究中使用的培养基和常用溶液配方 | 第41-44页 |
| ·分析软件 | 第44页 |
| ·基本方法 | 第44-62页 |
| ·P1 菌用 1/5216E 固体平板+萘蒸汽熏蒸法培养 | 第45页 |
| ·P1 菌在 PAHs 碳源中液体培养 | 第45页 |
| ·用实验室常用的培养基测试 P1 菌能否生长 | 第45页 |
| ·P1 菌单因子测试 | 第45-50页 |
| ·培养基中 NaCl 浓度测试 | 第46页 |
| ·培养基 pH 值范围测试 | 第46页 |
| ·培养温度测试 | 第46-47页 |
| ·摇床培养转速测试 | 第47页 |
| ·测试 ML 培养基中 FeSO4和 FeCl333 | 第47页 |
| ·测试胰蛋白胨浓度范围 | 第47-48页 |
| ·测试 L-谷氨酸钠浓度范围 | 第48页 |
| ·测试 NaAc 浓度范围 | 第48页 |
| ·测试丙酮酸钠浓度范围 | 第48-49页 |
| ·测试柠檬酸钠浓度范围 | 第49页 |
| ·测试酵母膏浓度范围 | 第49-50页 |
| ·ML 培养基培养条件下的 P1 菌生长曲线绘制 | 第50页 |
| ·P1 菌响应面优化 | 第50-56页 |
| ·PB 实验 | 第50-52页 |
| ·爬坡实验 | 第52-54页 |
| ·响应面实验 | 第54-56页 |
| ·P1 菌固体培养 | 第56页 |
| ·用于 RT-PCR 实验的芘诱导 P1 菌培养方案 | 第56-57页 |
| ·P1 菌 PAHs 诱导培养方案及转录组和蛋白组测序 | 第57-58页 |
| ·细菌 RNA 的提取 | 第58-60页 |
| ·细菌基因组 DNA 的提取 | 第60页 |
| ·转录组和蛋白组分析芘代谢通路基本思路 | 第60-62页 |
| 3 结果与讨论 | 第62-111页 |
| ·P1 菌液体培养条件的优化 | 第62-90页 |
| ·尝试用实验室常用的培养深海来源细菌的培养基培养 P1 菌 | 第62页 |
| ·设计几种适合 P1 菌液体培养的培养基 | 第62-70页 |
| ·设计 MM-1 培养基 | 第62-68页 |
| ·设计 MM-2 培养基 | 第68-70页 |
| ·单因子测试 | 第70-76页 |
| ·NaCl 浓度测试 | 第70-71页 |
| ·pH 梯度测试 | 第71页 |
| ·培养温度测试 | 第71-72页 |
| ·摇床培养转速测试 | 第72页 |
| ·测试在 ML 培养基中添加 FeSO4和 FeCl3的区别 | 第72页 |
| ·测试胰蛋白胨浓度范围 | 第72-73页 |
| ·测试 L-谷氨酸钠浓度范围 | 第73-74页 |
| ·测试 NaAc 浓度范围 | 第74-75页 |
| ·测试丙酮酸钠浓度范围 | 第75页 |
| ·测试柠檬酸钠浓度范围 | 第75页 |
| ·测试酵母膏浓度范围 | 第75-76页 |
| ·绘制基于 ML 培养基的 P1 菌生长曲线 | 第76-77页 |
| ·响应面优化 ML-1 培养基 | 第77-88页 |
| ·PB 实验 | 第77-80页 |
| ·爬坡实验 | 第80-81页 |
| ·响应面实验 | 第81-88页 |
| ·讨论 | 第88-90页 |
| ·P1 菌固体平板培养条件优化 | 第90-92页 |
| ·用实验室常用的海洋细菌培养基固体平板培养 P1 菌 | 第90页 |
| ·利用 P1 菌发酵液制平板培养 P1 菌 | 第90-91页 |
| ·讨论 | 第91-92页 |
| ·P1 菌降解芘代谢通路分析 | 第92-111页 |
| ·基因组分析 PAHs 降解基因 | 第92-101页 |
| ·PAH 双加氧酶 | 第92-96页 |
| ·PAHs 降解基因簇分析 | 第96-101页 |
| ·转录组和蛋白组关联分析芘降解代谢通路 | 第101-108页 |
| ·讨论 | 第108-111页 |
| 4 小结与展望 | 第111-114页 |
| 参考文献 | 第114-121页 |
| 致谢 | 第121-122页 |
| 附录 | 第122页 |
