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迟缓爱德华氏菌基因组fosmid文库的构建、opp基因簇的克隆及aroA基因缺失突变株的构建

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
第一章 文献综述第10-30页
   ·微生物致病性共同特征第10-15页
     ·毒素第10页
     ·黏附第10-12页
     ·侵袭第12-13页
     ·胞内生活方式第13页
     ·与宿主免疫系统相关作用第13页
     ·毒力因子分泌的保守机制第13-14页
     ·铁摄取第14页
     ·毒力因子的调节第14-15页
   ·迟缓爱德华氏菌研究进展第15-24页
     ·概述第15-16页
     ·致病机制第16-21页
       ·黏附和侵袭第16-18页
       ·与宿主免疫系统的对抗第18页
       ·T355第18-20页
       ·T655第20-21页
       ·铁摄取第21页
     ·疫苗防治第21-24页
       ·疫苗构建的若干思路第22-24页
       ·E.tarda 疫苗研究进展第24页
   ·基因组文库在微生物研究中的应用第24-30页
     ·基因组文库第24-25页
     ·大片段基因组文库第25-28页
       ·Cosmid 文库第25-26页
       ·Fosmid 文库第26-28页
     ·大片段基因组文库在微生物中的应用第28-30页
第二章 迟缓爱德华氏菌基因组fosmid 文库构建及生物信息学分析第30-56页
 第一节 迟缓爱德华氏菌基因组fosmid 文库构建第32-41页
   ·材料与方法第32-36页
     ·材料与试剂第32页
     ·基因组DNA 提取第32-33页
     ·脉冲场电泳(PFGE)第33页
     ·Fosmid 文库构建第33-36页
     ·文库质量鉴定第36页
   ·结果第36-39页
     ·基因DNA 提取及合适片段DNA 制备第36-37页
     ·DNA 回收第37-38页
     ·文库质量鉴定第38-39页
   ·讨论第39-41页
 第二节 迟缓爱德华氏菌基因组初探及毒力相关基因寻找第41-56页
   ·材料与方法第41页
     ·末端测序第41页
     ·生物信息学分析第41页
   ·结果与讨论第41-55页
     ·序列质量第41页
     ·GC 含量第41-42页
     ·相近物种分析第42-43页
     ·KEGG 基因功能分类第43-49页
     ·毒力相关基因寻找第49-55页
   ·结论第55-56页
第三章 从迟缓爱德华氏菌基因组fosmid文库克隆编码寡肽透过酶的opp基因簇第56-64页
 1. 材料与方法第57-58页
   ·菌株与质粒第57页
   ·Fosmid 文库构建第57页
   ·opp 基因簇克隆第57-58页
   ·生物信息学分析第58页
 2 结果及讨论第58-63页
   ·opp 基因簇克隆第58-59页
   ·opp 基因簇序列分析第59-61页
   ·opp 基因簇非编码区第61-62页
   ·基于OppA 保守结构域的进化地位分析第62-63页
 3. 结论第63-64页
第四章 迟缓爱德华氏菌aroA 基因的克隆及其缺失突变株的构建第64-83页
 第一节 迟缓爱德华氏菌aroA 基因的克隆及序列分析第66-74页
   ·材料与方法第66-68页
     ·菌种与质粒第66页
     ·aroA 克隆筛选第66-67页
     ·aroA 上下游扩增第67-68页
     ·aroA ORF 确认第68页
     ·aroA 序列分析第68页
   ·结果与讨论第68-74页
     ·文库筛选第69页
     ·aroA 上下游扩增第69-70页
     ·aroA ORF 确认第70-71页
     ·aroA 序列分析第71-74页
 第二节 迟缓爱德华氏菌aroA 基因缺失突变株构建第74-83页
   ·材料与方法第74-78页
     ·实验鱼第74页
     ·细菌及质粒第74页
     ·aroA 缺失第74-77页
     ·△aroA 毒性实验第77-78页
     ·△aroA 在牙鲆体内存活实验第78页
   ·结果第78-81页
     ·aroA 缺失第78-80页
     ·毒性实验第80页
     ·△aroA 在牙鲆体内存活实验第80-81页
   ·讨论第81-83页
参考文献第83-94页
致谢第94页

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