| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 第一章 绪论 | 第18-26页 |
| 1.1 引言 | 第18-24页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第18-20页 |
| 1.1.2 国内外研究现状及评价 | 第20-24页 |
| 1.2 研究目标和主要研究内容 | 第24-25页 |
| 1.2.1 关键的科学问题与研究目标 | 第24页 |
| 1.2.2 主要研究内容 | 第24-25页 |
| 1.3 研究技术路线 | 第25-26页 |
| 第二章 木姜子属落叶组植物形态学鉴定 | 第26-38页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-27页 |
| 2.1.1 木姜子属落叶组植物样品采集 | 第26页 |
| 2.1.2 植物腊叶标本的制作 | 第26-27页 |
| 2.2 实验结果 | 第27-37页 |
| 2.2.1 木姜子属落叶组植物形态鉴定 | 第27-35页 |
| 2.2.2 木姜子属落叶组植物检索表 | 第35-37页 |
| 2.3 本章小结 | 第37-38页 |
| 第三章 木姜子属落叶组植物亲缘及进化关系探究 | 第38-53页 |
| 3.1 材料与方法 | 第38-43页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第38-39页 |
| 3.1.2 样品基因组DNA提取与检测 | 第39-40页 |
| 3.1.3 构建DNA文库与测序 | 第40-41页 |
| 3.1.4 数据质控 | 第41页 |
| 3.1.5 测序reads与参考基因组比对 | 第41页 |
| 3.1.6 变异检测和注释 | 第41-42页 |
| 3.1.7 SNP系统发育树构建 | 第42页 |
| 3.1.8 叶绿体基因组拼接与系统发育树构建 | 第42-43页 |
| 3.2 结果与分析 | 第43-51页 |
| 3.2.1 样品DNA提取及检测结果 | 第43-44页 |
| 3.2.2 测序数据质量评估 | 第44-45页 |
| 3.2.3 测序结果与参考基因组比对分析 | 第45-47页 |
| 3.2.4 全基因组遗传变异结果分析 | 第47-48页 |
| 3.2.5 木姜子属落叶组植物系统发育分析 | 第48-51页 |
| 3.3 本章小结 | 第51-53页 |
| 第四章 木姜子属落叶组植物化学指纹图谱研究 | 第53-89页 |
| 4.1 材料与方法 | 第54-57页 |
| 4.1.1 样品采集与处理 | 第54-55页 |
| 4.1.2 气相色谱质谱联用仪(GC-MS)挥发性成分检测 | 第55-56页 |
| 4.1.3 叶片化学成分分析 | 第56页 |
| 4.1.5 聚类分析 | 第56页 |
| 4.1.6 山苍子精油抑制真菌活性测定 | 第56-57页 |
| 5.1.7 山苍子精油抑制细菌活性测定 | 第57页 |
| 5.1.8 数据分析 | 第57页 |
| 4.2 结果与分析 | 第57-87页 |
| 4.2.1 叶片GC-MS检测 | 第57-58页 |
| 4.2.2 叶片挥发性成分鉴定 | 第58-73页 |
| 4.2.3 木姜子属落叶组植物叶片挥发油化学指纹分析 | 第73-74页 |
| 4.2.4 木姜子属落叶组植物叶片挥发油化学成分聚类分析 | 第74页 |
| 4.2.5 山苍子精油对真菌的抑菌性评估 | 第74-76页 |
| 4.2.6 三种山苍子精油抑菌活性评价 | 第76-79页 |
| 4.2.7 山苍子精油化学成分分析 | 第79-86页 |
| 4.2.8 山苍子精油主要成分与抑菌效果相关性分析 | 第86-87页 |
| 4.3 本章小结 | 第87-89页 |
| 第五章 杨叶木姜子遗传多样性分析 | 第89-102页 |
| 5.1 材料与方法 | 第90-93页 |
| 5.1.1 样品采集与处理 | 第90-91页 |
| 5.1.2 样品总DNA提取与检测 | 第91-92页 |
| 5.1.3 基因组GBS文库构建及测序 | 第92页 |
| 5.1.4 数据统计与分析 | 第92-93页 |
| 5.2 结果与分析 | 第93-100页 |
| 5.2.1 DNA样品制备及GBS文库构建 | 第93-94页 |
| 5.2.2 SNP检测与注释 | 第94-95页 |
| 5.2.3 群体遗传结构分析 | 第95-98页 |
| 5.2.4 群体遗传多样性分析 | 第98-100页 |
| 5.3 本章小结 | 第100-102页 |
| 第六章 结论与展望 | 第102-109页 |
| 6.1 结论 | 第102-103页 |
| 6.1.1 木姜子属落叶组植物分子系统进化关系 | 第102页 |
| 6.1.2 木姜子属落叶组植物叶片化学指纹图谱分析 | 第102-103页 |
| 6.2 讨论 | 第103-108页 |
| 6.3 展望 | 第108-109页 |
| 附录A SNP变异检测及注释结果 | 第109-110页 |
| 附录B InDel变异检测及注释结果 | 第110-111页 |
| 附录C SV检测及注释结果 | 第111-112页 |
| 附录D CNV检测及注释结果 | 第112-113页 |
| 附录E 各样本基因组结构变异分布可视化 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-120页 |
| 在读期间的学术研究 | 第120-121页 |
| 致谢 | 第121页 |
