| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-57页 |
| ·废水处理系统中微生物生态研究概述 | 第17-30页 |
| ·废水处理系统中的微生物群落组成 | 第17-22页 |
| ·微生物群落结构与系统功能的关系 | 第22-30页 |
| ·通过比较功能不同的平行生态系统间群落结构的差异来鉴定功能菌 | 第23-24页 |
| ·通过分析群落结构与功能的动态变化间的关系鉴定功能菌 | 第24-28页 |
| ·根据活性微生物组成的动态变化鉴定与系统功能相关的功能菌 | 第28-29页 |
| ·通过群落结构与代谢物组成的共变化统计分析来鉴定功能菌 | 第29-30页 |
| ·废水处理系统中重要功能类群-Thauera属细菌的研究 | 第30-46页 |
| ·废水处理系统中Thauera属细菌的作用 | 第31-33页 |
| ·Thauera属细菌的重要功能 | 第31-32页 |
| ·Thauera属细菌可能引起的问题 | 第32-33页 |
| ·Thauera属细菌污染物降解的研究 | 第33-41页 |
| ·Thauera属细菌的污染物降解能力 | 第33-37页 |
| ·Thauera属细菌的污染物代谢途径 | 第37-41页 |
| ·芳香族化合物的厌氧代谢 | 第37-41页 |
| ·芳香族化合物的好氧代谢 | 第41页 |
| ·细菌反硝化概述 | 第41-46页 |
| ·反硝化基因 | 第42-44页 |
| ·Thauera属细菌反硝化的研究 | 第44-46页 |
| 参考文献 | 第46-57页 |
| 第二章 Thauera类群特异性PCR-DGGE方法的建立及在焦化废水处理装置监测中的应用 | 第57-83页 |
| 摘要 | 第57-58页 |
| ABSTRACT | 第58-59页 |
| 引言 | 第59-60页 |
| ·材料与方法 | 第60-66页 |
| ·焦化废水处理装置 | 第60-61页 |
| ·生物膜样品采集和DNA提取 | 第61-62页 |
| ·Thauera特异性引物的特异性和灵敏度的评估 | 第62页 |
| ·Thauera特异性PCR扩增及V3 区PCR扩增 | 第62-64页 |
| ·克隆文库的构建与分析 | 第64-66页 |
| ·DGGE分析 | 第66页 |
| ·DGGE指纹图谱的主成份分析(PCA) | 第66页 |
| ·核酸序列登录号 | 第66页 |
| ·实验结果 | 第66-75页 |
| ·Thauera特异性PCR方法的建立 | 第66-69页 |
| ·Thauera特异性PCR-DGGE方法的建立和评估 | 第69-71页 |
| ·焦化废水处理装置中Thauera的结构在操作条件波动时的变化 | 第71-75页 |
| ·讨论 | 第75-77页 |
| ·本章总结 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-83页 |
| 第三章 类群特异性PCR和DGGE引导分离重要功能菌Thauera属菌株 | 第83-103页 |
| 摘要 | 第83-84页 |
| ABSTRACT | 第84-85页 |
| 引言 | 第85-86页 |
| ·材料和方法 | 第86-91页 |
| ·生物膜样品采集 | 第86页 |
| ·培养基设计 | 第86-87页 |
| ·培养基筛选 | 第87页 |
| ·菌株筛选 | 第87页 |
| ·基因组DNA提取 | 第87-88页 |
| ·玻珠击打法(bead beating) | 第87-88页 |
| ·Triton X-100 煮沸裂解法 | 第88页 |
| ·PCR | 第88-90页 |
| ·Thauera特异性PCR | 第89页 |
| ·细菌16S rRNA基因PCR | 第89页 |
| ·细菌V3 区PCR | 第89-90页 |
| ·PCR产物的DGGE分析 | 第90页 |
| ·测序与序列分析 | 第90页 |
| ·核酸序列登录号 | 第90-91页 |
| ·结果 | 第91-96页 |
| ·Thauera培养基的筛选 | 第91-93页 |
| ·菌株筛选 | 第93-94页 |
| ·划线纯化 | 第94-95页 |
| ·测序鉴定 | 第95-96页 |
| ·讨论 | 第96-98页 |
| ·本章总结 | 第98-99页 |
| 参考文献 | 第99-103页 |
| 第四章 Thauera分离株的芳香族污染物降解能力及相关基因的比较研究 | 第103-127页 |
| 摘要 | 第103-104页 |
| ABSTRACT | 第104-105页 |
| 引言 | 第105-106页 |
| ·材料和方法 | 第106-112页 |
| ·菌种 | 第106页 |
| ·基因组DNA提取 | 第106-107页 |
| ·PCR | 第107-109页 |
| ·ERIC-PCR | 第107-108页 |
| ·nirS 和nirK基因PCR | 第108-109页 |
| ·LmPH基因PCR | 第109页 |
| ·克隆文库的构建与分析 | 第109-110页 |
| ·培养基及培养条件 | 第110-111页 |
| ·化学成分分析 | 第111-112页 |
| ·实验结果 | 第112-119页 |
| ·Thauera菌株的系统分类地位及在废水处理系统中的含量 | 第112页 |
| ·Thauera菌株的形态及基因组指纹图谱的比较 | 第112-114页 |
| ·Thauera菌株对焦化废水中有机污染物的降解能力 | 第114-116页 |
| ·Thauera菌株苯酚降解能力的比较 | 第116-117页 |
| ·nirS/nirK及LmPH基因的测序分析 | 第117-119页 |
| ·讨论 | 第119-121页 |
| ·本章小结 | 第121-123页 |
| 参考文献 | 第123-127页 |
| 第五章 Thauera属细菌反硝化功能及相关基因的比较研究 | 第127-154页 |
| 摘要 | 第127-128页 |
| ABSTRACT | 第128-129页 |
| 引言 | 第129-130页 |
| ·材料和方法 | 第130-136页 |
| ·Thauera菌株 | 第130-131页 |
| ·培养基和培养条件 | 第131页 |
| ·气体的自动采集与分析 | 第131-133页 |
| ·DNA提取 | 第133页 |
| ·PCR | 第133-134页 |
| ·细菌16S rRNA基因PCR | 第133-134页 |
| ·nirS和nosZ基因PCR | 第134页 |
| ·克隆测序及序列分析 | 第134-135页 |
| ·数据分析 | 第135-136页 |
| ·实验结果 | 第136-147页 |
| ·Thauera属细菌反硝化功能的比较 | 第136-140页 |
| ·16S rRNA、nirS和nosZ 基因的测序和分析 | 第140-143页 |
| ·pH、NO_3~-/NO_2~-及O_2 对反硝化的影响 | 第143-147页 |
| ·讨论 | 第147-149页 |
| ·本章小结 | 第149-150页 |
| 参考文献 | 第150-154页 |
| 本研究的创新性 | 第154-155页 |
| 附录1. 废水处理装置硝化池生物膜中基因的多样性及其功能的稳定性 | 第155-187页 |
| 附录2. 溶液试剂及培养基 | 第187-188页 |
| 附录3. 实验中所用的仪器设备 | 第188-189页 |
| 附录4. 缩写简称 | 第189-190页 |
| 致谢 | 第190-191页 |
| 已(待)发表的学术文章、专利及参加的科研课题 | 第191-192页 |
