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双孢蘑菇褐化相关PPO基因的研究及香菇EST-SSR标记的建立

摘要第1-4页
Abstract第4-9页
第一部分第9-34页
 1 文献综述第10-14页
   ·PPO 的生理功能第10页
   ·PPO 的酶催化机制第10-11页
   ·PPO 的分子生物学研究进展第11-14页
     ·PPO 基因的克隆第11-12页
     ·PPO 基因的表达第12-14页
 2 引言第14-16页
   ·本研究的主要内容及意义第14页
     ·研究内容第14页
     ·本研究的目的与意义第14页
   ·本研究的技术路线第14-16页
     ·双孢蘑菇酶促褐变的相关因素分析第14-15页
     ·双孢蘑菇PPO 基因组及其启动子序列克隆和分析第15-16页
 3 材料与方法第16-21页
   ·双孢蘑菇酶促褐变相关酶活性变化第16-17页
     ·试验材料及处理第16页
     ·主要仪器和试剂第16页
     ·比色度测定第16页
     ·Folin-酚比色法测定总酚含量第16-17页
     ·多酚氧化酶(PPO)活性测定第17页
     ·苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性测定第17页
   ·双孢蘑菇 PPO 基因及其启动子序列克隆第17-20页
     ·试验材料第17-18页
     ·酶、试剂盒和相关试剂第18页
     ·主要数据库及软件第18页
     ·PCR 扩增双孢蘑菇PPO 基因组全长序列第18-19页
     ·启动子序列全长获得第19-20页
     ·同源性分析及系统进化树构建第20页
   ·基因表达的半定量RT-PCR 分析第20-21页
 4 结果与分析第21-30页
   ·双孢蘑菇酶促褐变相关酶活性变化第21-23页
     ·双孢蘑菇储藏期间褐变度的变化第21页
     ·双孢蘑菇储藏期间总酚含量的变化第21-22页
     ·双孢蘑菇储藏期间PPO 活性的变化第22-23页
     ·双孢蘑菇储藏期间PAL 活性的变化第23页
   ·双孢蘑菇PPO 基因及其启动子序列克隆和功能分析第23-30页
     ·PPO 基因组全长的获得及序列分析第23-24页
     ·PPO 启动子的克隆及序列分析第24-27页
     ·进化树分析第27-29页
     ·双孢蘑菇PP03 和PP04 基因的表达分析第29-30页
 5 讨论第30-33页
   ·双孢蘑菇的褐变与多酚氧化酶的关系第30页
   ·双孢蘑菇PPO 基因组序列的克隆第30-31页
   ·双孢蘑菇PPO 基因的启动子序列的克隆第31-33页
     ·植物启动子核苷酸序列的保守性第31页
     ·利用PPO 基因启动子抑制褐变第31-33页
 6 结论第33-34页
第二部分第34-62页
 1 文献综述第35-42页
   ·第一代分子标记及在香菇中的应用第35-36页
     ·RFLP第35-36页
     ·RAPD第36页
     ·AFLP第36页
   ·第二代分子标记及在香菇中应用第36-38页
     ·ISSR第36-37页
     ·SSR第37-38页
   ·第三代分子标记及在香菇中的应用第38-39页
     ·SNP第38页
     ·EST第38-39页
   ·EST-SSR 的开发过程第39-40页
   ·EST-SSR 的研究进展第40-42页
     ·EST-SSR 的用途第40-41页
     ·EST-SSR 与基因组SSR(gSSR)的比较第41-42页
 2 引言第42-43页
   ·本研究的主要内容、目标及意义第42页
     ·研究内容和目标第42页
     ·研究意义第42页
   ·本研究所采取的技术路线第42-43页
 3 材料与方法第43-46页
   ·香菇EST 和基因序列的获得第43页
   ·香菇EST 和基因序列的前处理第43页
   ·序列的组装第43页
   ·EST-SSR 位点的搜索第43页
   ·EST-SSR 引物的设计第43页
   ·ORF 的确定第43页
   ·EST-SSR 多态性的分析第43-45页
     ·所选香菇材料第43-44页
     ·材料DNA 的提取第44页
     ·PCR 扩增第44-45页
     ·最适退火温度的确定第45页
     ·电泳检测第45页
   ·统计数据聚类分析第45-46页
 4 结果与分析第46-59页
   ·香菇 EST-SSR 信息的处理与分析第46-50页
     ·香菇EST 序列的获得与处理第46页
     ·EST-SSR 的分布频率和分布特点第46-47页
     ·EST-SSR 不同基序类型的分布特点第47-48页
     ·EST-SSR 基序不同长度的分布特点第48页
     ·EST-SSR 基序重复次数的分布特点第48-49页
     ·SSR 在Unigene 上的分布特点第49-50页
   ·EST-SSR 标记的开发第50-55页
     ·EST-SSR 引物的设计第50页
     ·最适退火温度的确定与引物的筛选第50-51页
     ·EST-SSR 标记的多态性第51-55页
   ·应用EST-SSR 多态性标记检测香菇品种的遗传多样性第55-59页
     ·EST-SSR 标记的多态性信息含量(PIC)第56页
     ·香菇品种的聚类分析第56-59页
 5 讨论第59-61页
   ·EST 数据库的应用价值第59页
   ·EST-SSR 的分布特征第59-60页
     ·EST-SSR 的分布频率第59页
     ·EST-SSR 的分布类型第59-60页
   ·EST-SSR 引物的扩增率和多态性第60-61页
 6 结论第61-62页
参考文献第62-69页
附录第69-73页
致谢第73-74页
个人简介第74页

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