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布鲁氏菌Per基因影响细胞自噬的分子机制

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-10页
综述一 布鲁氏菌研究进展第16-40页
    1 布鲁氏菌概述第17-22页
        1.1 布鲁氏菌的病原学特征第17-20页
        1.2 布鲁氏菌的分类第20-21页
        1.3 布鲁氏菌病的流行与传播第21-22页
    2 布鲁氏菌病的疫苗第22-24页
        2.1 减毒活疫苗第22-23页
        2.2 基因工程疫苗第23-24页
    3 布鲁氏菌病的诊断与防治第24-25页
        3.1 细菌学诊断第24页
        3.2 血清学诊断第24-25页
        3.3 分子生物学诊断第25页
        3.4 布鲁氏菌病的防治第25页
    4 布鲁氏菌的研究进展第25-40页
        4.1 基因组学研究进展第25-27页
        4.2 外膜蛋白研究进展第27-29页
        4.3 分泌系统研究进展第29页
        4.4 布鲁氏菌脂多糖研究进展第29-36页
        4.5 布鲁氏菌脂多糖与机体天然免疫第36-40页
综述二 细胞自噬研究进展第40-56页
    1 细胞自噬概述第40-43页
    2 自噬相关调控基因第43-46页
    3 自噬的检测方法第46-48页
    4 布鲁氏菌与细胞自噬第48-50页
    5 microRNA(miRNA)与细胞自噬第50-52页
    6 自噬与疾病第52-56页
1 引言第56-57页
2 技术路线第57-58页
第一部分 B.melitensis M5-90疫苗株per基因缺失株的构建第58-80页
    前言第58页
    1 材料与方法第58-70页
        1.1 实验材料第58-61页
            1.1.1 菌株与载体第58-59页
            1.1.2 引物第59页
            1.1.3 试剂第59页
            1.1.4 实验仪器第59-60页
            1.1.5 主要溶液配制方法第60-61页
        1.2 实验方法第61-70页
            1.2.1 同源重组质粒pGEM-△per的构建第61-69页
                1.2.1.1 B.melitensis M5-90疫苗株基因组的提取第61-62页
                1.2.1.2 per基因左、右同源臂(C端、N端)和卡那霉素抗性基因的扩增第62-63页
                1.2.1.3 PCR扩增产物的回收第63页
                1.2.1.4 回收产物与pMD20-T载体连接第63页
                1.2.1.5 大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备第63-64页
                1.2.1.6 连接产物的转化第64页
                1.2.1.7 筛选阳性克隆并测序第64-65页
                1.2.1.8 同源重组质粒pGEM-△per的构建与鉴定第65-69页
            1.2.2 缺失株M5-90-△per的构建第69-70页
                1.2.2.1 制备B.melitensis M5-90疫苗株感受态细胞第69页
                1.2.2.2 电转化与阳性重组子的筛选第69页
                1.2.2.3 缺失株M5-90-△per的PCR鉴定第69-70页
                1.2.2.4 缺失株M5-90-△per的遗传稳定性检测第70页
    2 结果与分析第70-77页
        2.1 同源重组质粒pGEM-△per的构建第70-73页
        2.2 缺失株M5-90-△per的PCR鉴定第73-76页
        2.3 缺失株M5-90-△per的遗传稳定性检测第76-77页
    3 讨论第77-79页
    4 小结第79页
    5 结论第79页
    6 创新点第79-80页
第二部分 B.melitensis M5-90及其缺失株M5-90-△per感染条件下RAW264.7细胞差异基因表达谱、差异miRNAs的鉴定与联合分析第80-128页
    前言第80-82页
    1 材料与方法第82-95页
        1.1 实验材料第82-84页
            1.1.1 细胞第82页
            1.1.2 菌种第82页
            1.1.3 试剂第82-83页
            1.1.4 实验仪器第83页
            1.1.5 主要溶液配制方法第83-84页
        1.2 实验方法第84-95页
            1.2.1 miRNA Microarray-Single基因表达谱芯片实验第84-87页
                1.2.1.1 细胞培养第84页
                1.2.1.2 菌株培养第84页
                1.2.1.3 芯片实验样品制备第84-85页
                1.2.1.4 miRNA Microarray-Single基因表达谱芯片实验第85-86页
                1.2.1.5 qRT-PCR验证miRNA Microarray-Single基因表达谱芯片结果第86-87页
            1.2.2 Agilent基因表达谱芯片实验第87-90页
                1.2.2.1 细胞培养第87页
                1.2.2.2 菌株培养第87页
                1.2.2.3 Agilent基因表达谱芯片实验样品制备第87页
                1.2.2.4 Agilent基因表达谱芯片实验第87-89页
                1.2.2.5 qRT-PCR验证Agilent基因表达谱芯片结果第89-90页
            1.2.3 miRNA表达谱芯片与Agilent基因表达谱芯片结果的联合分析第90-95页
                1.2.3.1 联合分析流程第90-91页
                1.2.3.2 优化mimic转染效率第91-92页
                1.2.3.3 qRT-PCR验证预测的靶基因第92页
                1.2.3.4 双荧光素酶报告基因重组质粒的构建第92-94页
                1.2.3.5 共转染第94页
                1.2.3.6 双荧光素酶报告基因的检测第94-95页
                1.2.3.7 突变体双荧光素酶报告基因实验第95页
    2 结果与分析第95-123页
        2.1 miRNA Microarray-Single基因表达谱芯片结果第95-97页
        2.2 qRT-PCR验证miRNA Microarray-Single基因表达谱芯片结果第97-98页
        2.3 Agilent基因表达谱芯片结果第98-105页
        2.4 miRNA-mRNA联合分析第105-110页
        2.5 miRNA-mRNA联合分析结果的qRT-PCR验证第110-113页
        2.6 流式细胞仪筛选mimic转染的最佳浓度第113-114页
        2.7 qRT-PCR验证靶基因Slc5a3与Tbc1d14第114-116页
        2.8 miR-146b-5p靶向结合并调节Tbc1d14第116-117页
        2.9 双荧光素酶报告基因实验验证miR-146b-5p靶向调节Tbc1d14第117-123页
    3 讨论第123-127页
    4 小结第127页
    5 结论第127页
    6 创新点第127-128页
第三部分 B.melitensis M5-90感染条件下miR-146b-5p对RAW264.7自噬的影响第128-153页
    前言第128-130页
    1 材料与方法第130-136页
        1.1 实验材料第130-132页
            1.1.1 细胞第130页
            1.1.2 菌种第130页
            1.1.3 试剂第130-131页
            1.1.4 实验仪器第131页
            1.1.5 主要溶液配制方法第131-132页
        1.2 实验方法第132-136页
            1.2.1 细胞培养第133页
            1.2.2 菌种培养与感染第133页
            1.2.3 B.melitensis M5-90、M5-90-△per感染条件下RAW264.7自噬分析第133-135页
                1.2.3.1 Western-blot检测LC3-Ⅱ/Ⅰ蛋白第133-134页
                1.2.3.2 透射电镜检测自噬溶酶体第134-135页
            1.2.4 qRT-PCR验证miR-146b-5p的过表达与抑制表达第135页
            1.2.5 B.melitensis M5-90感染条件下miR-146b-5p对RAW264.7自噬的影第135-136页
                1.2.5.1 Western-blot检测LC3-Ⅱ/Ⅰ蛋白第135-136页
                1.2.5.2 透射电镜检测自噬溶酶体第136页
    2 结果与分析第136-149页
        2.1 缺失株M5-90-△per感染RAW264.7细胞的LC3-Ⅱ/Ⅰ显著降低第136-137页
        2.2 缺失株M5-90-△per感染RAW264.7细胞的自噬溶酶体数显著减少第137-140页
        2.3 qRT-PCR验证miR-146b-5p的过表达与抑制表达第140-141页
        2.4 过表达miR-146b-5p导致LC3-Ⅱ/Ⅰ比值显著降低第141-143页
        2.5 过表达miR-146b-5p导致RAW264.7的自噬溶酶体数显著减少第143-149页
    3 讨论第149-152页
    4 小结第152页
    5 结论第152页
    6 创新点第152-153页
第四部分 B. melitensis M5-90感染条件下Tbc1d14对RAW264.7自噬的影响第153-180页
    前言第153-155页
    1 材料与方法第155-160页
        1.1 实验材料第155页
            1.1.1 细胞第155页
            1.1.2 菌种第155页
            1.1.3 试剂第155页
            1.1.4 实验仪器第155页
            1.1.5 主要溶液配制方法第155页
        1.2 实验方法第155-160页
            1.2.1 细胞培养第155页
            1.2.2 菌种培养与感染第155页
            1.2.3 携带Tbc1d14、GFP的重组腺病毒的制备第155-158页
            1.2.4 qRT-PCR验证Tbc1d14基因的过表达第158-159页
            1.2.5 过表达Tbc1d14导致miR-146b-5p介导的RAW264.7自噬升高第159页
            1.2.6 携带Tbc1d14、GFP的重组腺病毒感染RAW264.7后DGE测序分析第159-160页
            1.2.7 DGE测序分析结果的qRT-PCR验证第160页
    2 结果与分析第160-177页
        2.1 Tbc1d14、GFP的重组腺病毒的制备第160-162页
        2.2 重组腺病毒感染效率的检测以及qRT-PCR验证Tbc1d14基因的表达第162-165页
        2.3 过表达Tbc1d14导致miR-146b-5p介导的RAW264.7自噬升高第165-170页
        2.4 DGE测序结果第170-175页
        2.5 DGE测序结果的qRT-PCR验证第175-177页
    3 讨论第177-179页
    4 小结第179页
    5 结论第179页
    6 创新点第179-180页
全文结论第180-181页
展望第181-182页
参考文献第182-203页
中英文缩略词对照表第203-207页
附录第207-235页
致谢第235页

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