摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-8页 |
引言 | 第12-14页 |
第一章 甘草miRNA在小鼠血清中的检测 | 第14-26页 |
1.1 引言 | 第14页 |
1.2 实验材料 | 第14-16页 |
1.2.1 样本 | 第14页 |
1.2.2 试剂 | 第14页 |
1.2.3 仪器 | 第14-15页 |
1.2.4 实验动物 | 第15页 |
1.2.5 试剂配制 | 第15-16页 |
1.3 实验方法 | 第16-20页 |
1.3.1 动物分组及给药 | 第16页 |
1.3.2 样品收集 | 第16-17页 |
1.3.3 血清中总RNA的提取 | 第17页 |
1.3.4 目标miRNA的RT-PCR检测 | 第17-20页 |
1.3.5 实时荧光定量PCR鉴定目标miRNA | 第20页 |
1.4 实验结果 | 第20-25页 |
1.4.1 小鼠体质量结果 | 第20-21页 |
1.4.2 甘草miRNA在血清中的检测结果 | 第21-25页 |
1.5 本章小结 | 第25-26页 |
第二章 甘草及其miRNA对小鼠肠道菌群的影响 | 第26-40页 |
2.1 引言 | 第26页 |
2.2 实验材料 | 第26-27页 |
2.2.1 样本 | 第26页 |
2.2.2 试剂 | 第26页 |
2.2.3 仪器 | 第26-27页 |
2.3 实验方法 | 第27-30页 |
2.3.1 粪便基因组DNA提取 | 第27-28页 |
2.3.2 样品质量检测及PCR扩增 | 第28页 |
2.3.3 建库测序和信息分析 | 第28-30页 |
2.4 实验结果 | 第30-36页 |
2.4.1 基因组质量检测结果 | 第30-31页 |
2.4.2 OTU及物种群落结构 | 第31-34页 |
2.4.3 Alpha多样性分析 | 第34页 |
2.4.4 Beta多样性分析 | 第34-36页 |
2.5 本章小结 | 第36-40页 |
第三章 甘草及其miRNA对小鼠肠道组织转录组的影响 | 第40-66页 |
3.1 引言 | 第40页 |
3.2 实验材料 | 第40-41页 |
3.2.1 样本 | 第40页 |
3.2.2 试剂 | 第40页 |
3.2.3 仪器 | 第40-41页 |
3.3 实验方法 | 第41-46页 |
3.3.1 小鼠回肠组织总RNA提取 | 第41页 |
3.3.2 样品质量检测 | 第41页 |
3.3.3 建库测序 | 第41-42页 |
3.3.4 生物信息学分析 | 第42-44页 |
3.3.5 利用实时荧光定量PCR验证转录组测序结果 | 第44-45页 |
3.3.6 肠道组织切片HE染色 | 第45-46页 |
3.4 实验结果 | 第46-62页 |
3.4.1 RNA质量检测结果 | 第46-47页 |
3.4.2 测序数据统计和评估 | 第47-50页 |
3.4.3 基因表达分析 | 第50-51页 |
3.4.4 基因差异表达分析 | 第51-53页 |
3.4.5 差异表达基因GO富集分析 | 第53-54页 |
3.4.6 差异表达基因KEGG Pathway功能分析 | 第54-56页 |
3.4.7 利用实时荧光定量PCR验证转录组测序结果 | 第56-60页 |
3.4.8 肠道组织HE染色病理结果 | 第60-62页 |
3.5 本章小结 | 第62-66页 |
第四章 甘草及其miRNA对小鼠脾脏免疫相关基因的影响 | 第66-80页 |
4.1 引言 | 第66页 |
4.2 实验材料 | 第66-68页 |
4.2.1 样本 | 第66页 |
4.2.2 试剂 | 第66页 |
4.2.3 仪器 | 第66-67页 |
4.2.4 免疫相关基因引物 | 第67-68页 |
4.3 实验方法 | 第68-71页 |
4.3.1 小鼠脾脏淋巴细胞总RNA的提取 | 第68-69页 |
4.3.2 小鼠脾脏RNA免疫相关基因的RT-PCR鉴定 | 第69-70页 |
4.3.3 实时荧光定量PCR检测免疫基因的表达差异 | 第70-71页 |
4.4 实验结果 | 第71-76页 |
4.4.1 小鼠脾脏淋巴细胞总RNA提取及免疫相关基因扩增鉴定 | 第71-73页 |
4.4.2 实时荧光定量PCR得到的免疫相关基因的差异表达量 | 第73-76页 |
4.5 本章小结 | 第76-80页 |
第五章 总结与展望 | 第80-84页 |
5.1 总结 | 第80-82页 |
5.2 展望 | 第82-84页 |
参考文献 | 第84-88页 |
附录1 转录组测序验证基因对应通路 | 第88-90页 |
附录2 转录组测序用于验证的基因测序表达量 | 第90-92页 |
致谢 | 第92-94页 |
攻读硕士学位期间发表的论文 | 第94页 |