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甘草及其miRNA对小鼠肠道菌群和免疫的影响

摘要第4-6页
abstract第6-8页
引言第12-14页
第一章 甘草miRNA在小鼠血清中的检测第14-26页
    1.1 引言第14页
    1.2 实验材料第14-16页
        1.2.1 样本第14页
        1.2.2 试剂第14页
        1.2.3 仪器第14-15页
        1.2.4 实验动物第15页
        1.2.5 试剂配制第15-16页
    1.3 实验方法第16-20页
        1.3.1 动物分组及给药第16页
        1.3.2 样品收集第16-17页
        1.3.3 血清中总RNA的提取第17页
        1.3.4 目标miRNA的RT-PCR检测第17-20页
        1.3.5 实时荧光定量PCR鉴定目标miRNA第20页
    1.4 实验结果第20-25页
        1.4.1 小鼠体质量结果第20-21页
        1.4.2 甘草miRNA在血清中的检测结果第21-25页
    1.5 本章小结第25-26页
第二章 甘草及其miRNA对小鼠肠道菌群的影响第26-40页
    2.1 引言第26页
    2.2 实验材料第26-27页
        2.2.1 样本第26页
        2.2.2 试剂第26页
        2.2.3 仪器第26-27页
    2.3 实验方法第27-30页
        2.3.1 粪便基因组DNA提取第27-28页
        2.3.2 样品质量检测及PCR扩增第28页
        2.3.3 建库测序和信息分析第28-30页
    2.4 实验结果第30-36页
        2.4.1 基因组质量检测结果第30-31页
        2.4.2 OTU及物种群落结构第31-34页
        2.4.3 Alpha多样性分析第34页
        2.4.4 Beta多样性分析第34-36页
    2.5 本章小结第36-40页
第三章 甘草及其miRNA对小鼠肠道组织转录组的影响第40-66页
    3.1 引言第40页
    3.2 实验材料第40-41页
        3.2.1 样本第40页
        3.2.2 试剂第40页
        3.2.3 仪器第40-41页
    3.3 实验方法第41-46页
        3.3.1 小鼠回肠组织总RNA提取第41页
        3.3.2 样品质量检测第41页
        3.3.3 建库测序第41-42页
        3.3.4 生物信息学分析第42-44页
        3.3.5 利用实时荧光定量PCR验证转录组测序结果第44-45页
        3.3.6 肠道组织切片HE染色第45-46页
    3.4 实验结果第46-62页
        3.4.1 RNA质量检测结果第46-47页
        3.4.2 测序数据统计和评估第47-50页
        3.4.3 基因表达分析第50-51页
        3.4.4 基因差异表达分析第51-53页
        3.4.5 差异表达基因GO富集分析第53-54页
        3.4.6 差异表达基因KEGG Pathway功能分析第54-56页
        3.4.7 利用实时荧光定量PCR验证转录组测序结果第56-60页
        3.4.8 肠道组织HE染色病理结果第60-62页
    3.5 本章小结第62-66页
第四章 甘草及其miRNA对小鼠脾脏免疫相关基因的影响第66-80页
    4.1 引言第66页
    4.2 实验材料第66-68页
        4.2.1 样本第66页
        4.2.2 试剂第66页
        4.2.3 仪器第66-67页
        4.2.4 免疫相关基因引物第67-68页
    4.3 实验方法第68-71页
        4.3.1 小鼠脾脏淋巴细胞总RNA的提取第68-69页
        4.3.2 小鼠脾脏RNA免疫相关基因的RT-PCR鉴定第69-70页
        4.3.3 实时荧光定量PCR检测免疫基因的表达差异第70-71页
    4.4 实验结果第71-76页
        4.4.1 小鼠脾脏淋巴细胞总RNA提取及免疫相关基因扩增鉴定第71-73页
        4.4.2 实时荧光定量PCR得到的免疫相关基因的差异表达量第73-76页
    4.5 本章小结第76-80页
第五章 总结与展望第80-84页
    5.1 总结第80-82页
    5.2 展望第82-84页
参考文献第84-88页
附录1 转录组测序验证基因对应通路第88-90页
附录2 转录组测序用于验证的基因测序表达量第90-92页
致谢第92-94页
攻读硕士学位期间发表的论文第94页

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