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一个多巴反应性肌张力障碍家系基因突变筛查研究

摘要第5-6页
Abstact第6-7页
第一章 绪论第13-25页
    1.1 多巴反应性肌张力障碍疾病研究第13-17页
        1.1.1 DRD分子遗传学研究进展第13-15页
        1.1.2 多巴反应性肌张力障碍的发病机制第15-16页
        1.1.3 多巴反应性肌张力障碍的临床表现及诊断第16-17页
    1.2 基因芯片技术与单核苷酸多态性分析第17-21页
        1.2.1 基因芯片技术研究进展第17-18页
        1.2.2 单核苷酸多态性分析研究第18-19页
        1.2.3 基因芯片与SNP检测技术第19-21页
    1.3 全外显子测序技术第21-22页
        1.3.1 全外显子测序研究进展第21页
        1.3.2 全外显子测序技术研究进展第21-22页
    1.4 研究内容及意义第22-25页
第二章 多巴反应性肌张力障碍疾病的GCH1、TH、SPR基因突变研究第25-41页
    2.1 引言第25-27页
        2.1.1 DRD致病基因的研究进展第25-26页
        2.1.2 聚合酶链式反应(PCR)技术简介第26-27页
    2.2 研究对象第27-28页
    2.3 实验材料与仪器第28-29页
        2.3.1 实验设备第28页
        2.3.2 主要试剂和耗材第28-29页
        2.3.3 主要试剂的配制第29页
    2.4 实验方法与过程第29-37页
        2.4.1 血液样品采集第29页
        2.4.2 全基因组DNA提取第29-31页
        2.4.3 基因组DNA样本质量检测第31页
        2.4.4 引物设计第31-34页
        2.4.5 聚合酶链式反应第34-36页
        2.4.6 琼脂糖凝胶电泳检测第36-37页
        2.4.7 PCR扩增产物测序及结果分析第37页
    2.5 结果与分析第37-40页
        2.5.1 全基因组DNA提取结果第37-38页
        2.5.2 PCR扩增产物电泳结果第38-39页
        2.5.3 测序分析结果第39页
        2.5.4 结果与讨论第39-40页
    2.6 本章小结第40-41页
第三章 应用单核苷酸多态性芯片对DRD家系基因突变的研究第41-52页
    3.1 引言第41-43页
        3.1.1 Illumina Human Zhonghua-8 Bead-Chips简述第41-42页
        3.1.2 生物信息学简述第42-43页
    3.2 研究对象第43-44页
    3.3 实验材料与仪器第44-45页
        3.3.1 实验设备第44页
        3.3.2 主要试剂和耗材第44-45页
    3.4 实验流程及分析方法第45-47页
        3.4.1 芯片检测的前期样本准备第45页
        3.4.2 中华 8 SNP分型实验流程第45-46页
        3.4.3 SNP分型数据分析方法第46-47页
    3.5 结果与分析第47-51页
        3.5.1 DNA样本质检结果第47-48页
        3.5.2 SNP芯片检测结果与分析第48-49页
        3.5.3 SNP分型数据分析结果第49-51页
    3.6 本章小结第51-52页
第四章 应用全外显子测序技术对DRD家系基因突变研究第52-64页
    4.1 引言第52-55页
        4.1.1 高通量测序技术简述第52页
        4.1.2 Illumina Hiseq2500 系统简介第52-55页
    4.2 研究对象第55页
    4.3 实验材料与仪器第55页
        4.3.1 实验设备第55页
        4.3.2 主要试剂和耗材第55页
    4.4 实验流程及分析方法第55-58页
        4.4.1 前期样本准备第55-56页
        4.4.2 外显子测序流程及分析方法第56-57页
        4.4.3 测序结果筛选方法第57-58页
    4.5 结果与分析第58-63页
        4.5.1 外显子测序基因组样本质检结果第58页
        4.5.2 文库构建质检结果第58-59页
        4.5.3 测序数据质控结果第59-60页
        4.5.4 序列比对结果第60-61页
        4.5.5 测序数据分析结果第61-62页
        4.5.6 测序数据筛选结果第62-63页
    4.6 本章小结第63-64页
第五章 候选SNP与DRD疾病的关联性研究第64-76页
    5.1 研究对象第64页
    5.2 实验材料与仪器第64-65页
        5.2.1 主要实验设备第64页
        5.2.2 主要试剂和耗材第64-65页
    5.3 实验方法与过程第65-68页
        5.3.1 DRD家系的候选SNP筛查第65页
        5.3.2 血液样品采集第65页
        5.3.3 全基因组DNA提取第65页
        5.3.4 引物设计及合成第65-66页
        5.3.5 PCR扩增反应第66-67页
        5.3.6 琼脂糖凝胶电泳检测第67页
        5.3.7 PCR扩增产物测序及结果分析第67页
        5.3.8 SNP位点相关基因的功能性分析第67-68页
    5.4 实验结果与分析第68-75页
        5.4.1 候选SNP筛查结果第68页
        5.4.2 候选SNP引物设计结果第68-69页
        5.4.3 个体基因组PCR扩增的电泳检测结果第69-70页
        5.4.4 PCR扩增产物的测序结果及分析第70-72页
        5.4.5 候选SNP突变位点的测序验证结果第72-73页
        5.4.6 候选SNP验证结果与分析第73-74页
        5.4.7 SNP176 相关基因的功能性分析结果第74-75页
    5.5 本章小结第75-76页
结论与展望第76-78页
    结论第76页
    本研究创新性评价第76页
    展望第76-78页
参考文献第78-87页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第87-88页
致谢第88-89页
附件第89页

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