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六个猪背膘厚相关基因的联合效应初步分析

摘要第7-8页
ABSTRACT第8页
缩略词表第9-10页
1 前言第10-25页
    1.1 研究问题由来第10页
    1.2 现代猪育种技术的发展第10-11页
    1.3 国际上猪背膘厚相关候选基因研究进展第11-14页
        1.3.1 黑素皮质素受体-4(MC4R)基因第11-12页
        1.3.2 瘦素(Leptin)第12-13页
        1.3.3 激素敏感脂肪酶(HSL)基因第13页
        1.3.4 影响脂肪沉积相关基因研究的总结第13-14页
    1.4 本课题组发现的背膘厚相关候选基因第14-18页
        1.4.1 甘油三酯转移酶(DGAT)基因第14-16页
        1.4.2 钙粘蛋白相关蛋白beta1(CTNNBL1)基因第16-17页
        1.4.3 原发性心肌症相关蛋白Ⅰ(CMYA1)基因第17-18页
        1.4.4 含Jmjc结构域组蛋白去甲基化酶1(JHDM1A)第18页
    1.5 本研究拟分离脂肪沉积相关基因SH2B1的研究进展第18-21页
        1.5.1 SH2B1基因的发现第18页
        1.5.2 SH2B1基因的研究进展第18-21页
    1.6 比较基因组方法在分离新基因中的应用第21-22页
    1.7 单核苷酸多态性的发现与检测方法第22页
    1.8 多个基因联合效应分析在家畜育种中的研究现状第22-24页
    1.9 本研究的目的和意义第24-25页
2 材料与方法第25-35页
    2.1 材料第25-27页
        2.1.1 样品第25页
        2.1.2 主要仪器设备第25页
        2.1.3 主要试剂及配制第25-26页
        2.1.4 主要分子生物学软件、统计软件和相关网站第26-27页
    2.2 方法第27-35页
        2.2.1 试验群体性状测定第27页
        2.2.2 猪基因组DNA的提取和检测第27-28页
        2.2.3 总RNA的提取和检测第28-29页
        2.2.4 候选基因的分离第29-32页
        2.2.5 PCR-RFLP方法检测猪MC4R、DGAT2、CTNNBL1、CMYA1和JHDM1A基因的多态性第32-33页
        2.2.6 统计分析模型的构建第33-35页
3 结果第35-48页
    3.1 猪SH2B1基因第35-38页
        3.1.1 猪SH2B1基因的分离与序列分析第35-37页
        3.1.2 猪SH2B1基因的SNPs筛选结果第37页
        3.1.3 SH2B1基因的SNP检测第37页
        3.1.4 猪SH2B1基因的关联分析第37-38页
    3.2 猪MC4R、DGAT2、CTNNBL1、CMYA1、JHDM1A基因的SNP分型及其与背膘厚的关联分析第38-43页
        3.2.1 MC4R基因第38-39页
        3.2.2 DGAT2基因第39-40页
        3.2.3 CTNNBL1基因第40-41页
        3.2.4 CMYA1基因第41-42页
        3.2.5 JHDM1A基因第42-43页
    3.3 与背膘厚显著关联的基因间两两互作分析第43-45页
        3.3.1 两个基因互作对三点平均背膘厚的影响第43-44页
        3.3.2 两个基因互作对最后肋骨处背膘厚的影响第44-45页
    3.4 与背膘厚显著关联的基因的三基因间联合分析第45-48页
        3.4.1 三个基因互作对三点平均背膘厚的影响第45-46页
        3.4.2 三个基因互作对最后肋骨处背膘厚的影响第46-48页
4 讨论第48-51页
    4.1 候选基因SNP检测第48页
    4.2 关于统计模型第48-49页
    4.3 单个基因与背膘厚性状关联分析第49页
    4.4 关于多个基因联合效应对同一背膘厚性状的影响第49-51页
5 小结第51-52页
    5.1 本研究获得的主要结果与结论第51页
    5.2 本研究的创新点与特色第51页
    5.3 本研究的不足及下一步研究工作的建议第51-52页
参考文献第52-58页
致谢第58页

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