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秀丽线虫核酸酶Dicer在细胞凋亡中功能转变的机制研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
第1章 引言第11-31页
    1.1 细胞凋亡第11-14页
        1.1.1 概述第11页
        1.1.2 细胞凋亡的特点第11-12页
        1.1.3 细胞凋亡的机制第12-13页
        1.1.4 细胞凋亡的意义第13-14页
    1.2 秀丽线虫-生物学研究理想的模式生物第14-19页
        1.2.1 秀丽线虫的生物学特性第14-15页
        1.2.2 秀丽线虫中细胞凋亡的特点和机制第15-19页
    1.3 染色体 DNA 降解的研究现状第19-25页
        1.3.1 DFF40 --最早被发现参与细胞凋亡的核酸酶第19-20页
        1.3.2 DCR-1 --线虫中启动 DNA 降解的关键核酸酶第20-21页
        1.3.3 EndoG/CPS-6 --线粒体中参与凋亡细胞 DNA 降解的核酸酶第21-22页
        1.3.4 CRN 家族第22页
        1.3.5 DNase II 家族核酸酶第22-23页
        1.3.6 线虫中染色体 DNA 降解的模型第23-24页
        1.3.7 染色体 DNA 降解异常导致的疾病第24-25页
    1.4 Dicer 核酸酶的研究现状第25-29页
        1.4.1 概述第25-26页
        1.4.2 Dicer 蛋白 RNase 活性与结构的关系第26-27页
        1.4.3 线虫 DCR-1 蛋白在细胞凋亡中的功能转变第27-29页
    1.5 本文的研究目的和主要内容第29-31页
第2章 具有 DNase 活性的 tDCR-1 蛋白制备条件摸索第31-65页
    2.1 本章引论第31-32页
    2.2 实验材料第32-34页
        2.2.1 菌株第32-33页
        2.2.2 细胞第33页
        2.2.3 载体第33页
        2.2.4 试剂第33-34页
    2.3 实验方法第34-47页
        2.3.1 克隆构建第34-35页
        2.3.2 大肠杆菌表达与纯化第35-38页
        2.3.3 包涵体变复性方法第38-39页
        2.3.4 体外转录翻译系统表达纯化蛋白第39-40页
        2.3.5 昆虫细胞表达与纯化第40-43页
        2.3.6 蛋白电泳检测方法第43-45页
        2.3.7 DNase 活性的测定第45页
        2.3.8 CED-3 纯化与活性测定第45-47页
    2.4 结果与讨论第47-65页
        2.4.1 大肠杆菌表达 tDCR-1 结果第47-52页
        2.4.2 tDCR-1 包涵体变复性结果第52-55页
        2.4.3 体外转录翻译系统表达 DCR-1 结果第55-60页
        2.4.4 昆虫细胞表达 tDCR-1 结果第60-63页
        2.4.5 小结第63-65页
第3章 抑制 tDCR-1 活性的关键临界区域及抑制机理研究第65-91页
    3.1 本章引论第65-66页
    3.2 实验材料第66-67页
        3.2.1 线虫第66页
        3.2.2 载体第66页
        3.2.3 试剂第66-67页
    3.3 实验方法第67-72页
        3.3.1 克隆构建第67-69页
        3.3.2 体外转录翻译系统表达蛋白第69页
        3.3.3 DNase 活性测定第69页
        3.3.4 体外 TUNEL 实验第69-70页
        3.3.5 显微注射构建转基因线虫第70-72页
        3.3.6 体内细胞死亡数目检测第72页
    3.4 结果与讨论第72-91页
        3.4.1 N 端各结构域对 tDCR-1 蛋白 DNase 活性抑制效果分析第72-80页
        3.4.2 抑制 tDCR-1 DNase 活性的关键临界区域鉴定第80-83页
        3.4.3 二级结构依赖的抑制机理分析第83-87页
        3.4.4 其他不相关序列对 tDCR-1 蛋白 DNase 活性的抑制第87-90页
        3.4.5 小结第90-91页
第4章 CED-3 激活的 DCR-1 蛋白与 DNA 结合能力分析第91-110页
    4.1 本章引论第91-93页
    4.2 实验材料第93页
    4.3 实验方法第93-97页
        4.3.1 克隆构建第93-94页
        4.3.2 昆虫细胞表达纯化蛋白第94页
        4.3.3 凝胶迁移法(EMSA)检测双链 DNA 的结合第94-96页
        4.3.4 Pull down 法检测与质粒 DNA 的结合第96-97页
        4.3.5 拓扑异构酶 I 处理超螺旋质粒 DNA第97页
    4.4 结果与讨论第97-110页
        4.4.1 DCR-1 蛋白与短链 dsDNA 的结合第97-100页
        4.4.2 DCR-1 蛋白与超螺旋质粒 DNA 的结合第100-101页
        4.4.3 DNA 的构象对 DCR-1 活性的影响第101-102页
        4.4.4 DCR-1 蛋白结合 DNA 的区域鉴定第102-108页
        4.4.5 小结第108-110页
第5章 通过结构模拟探讨 DCR-1 蛋白功能转变的机制第110-121页
    5.1 本章引论第110页
    5.2 实验材料第110页
    5.3 实验方法第110-112页
        5.3.1 结构建模第110-111页
        5.3.2 RNase 活性检测第111-112页
        5.3.3 新 RNase III 克隆构建第112页
    5.4 结果第112-118页
        5.4.1 结构建模结果第112-115页
        5.4.2 RNase 活性检测结果第115-116页
        5.4.3 新 RNase III 蛋白 DNase 活性检测结果第116-118页
    5.5 讨论第118-121页
第6章 论文总结与展望第121-124页
参考文献第124-133页
致谢第133-135页
附录 A 常用试剂和储液配制方法第135-136页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第136页

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