| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 缩略词 | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-25页 |
| 1.1 转录组测序的发展及应用 | 第9-11页 |
| 1.1.1 转录组测序的原理 | 第9-10页 |
| 1.1.2 RNAseq的应用 | 第10-11页 |
| 1.2 玉米茎腐病的研究进展 | 第11-14页 |
| 1.2.1 茎腐病的发生和危害 | 第11页 |
| 1.2.2 茎腐病致病菌 | 第11-12页 |
| 1.2.3 茎腐病发病及防治 | 第12页 |
| 1.2.4 茎腐病的抗性遗传研究 | 第12-13页 |
| 1.2.5 玉米茎腐病抗性机理的研究 | 第13-14页 |
| 1.3 植物抗病机理研究 | 第14-17页 |
| 1.3.1 植物的免疫系统 | 第14-15页 |
| 1.3.2 植物R蛋白和病原菌效应因子的互作 | 第15-17页 |
| 1.4 植物抗病和激素的关系 | 第17-22页 |
| 1.4.1 水杨酸SA在植物抗病中的作用 | 第18页 |
| 1.4.2 茉莉酸JA在植物抗病中的作用 | 第18-19页 |
| 1.4.3 茉莉酸JA和乙烯ET的协同作用 | 第19页 |
| 1.4.4 茉莉酸JA和水杨酸SA的拮抗作用 | 第19-20页 |
| 1.4.5 生长素IAA在植物抗病中的作用 | 第20-22页 |
| 1.5 苯丙烷代谢途径和植物抗病 | 第22-23页 |
| 1.6 禾谷镰刀菌的毒素及寄主抗性的研究 | 第23-24页 |
| 1.7 寄主对禾谷镰刀菌的抗性机理研究 | 第24-25页 |
| 第二章 材料方法 | 第25-35页 |
| 2.1 材料来源 | 第25-28页 |
| 2.2 病原菌的培养、接种及性状鉴定 | 第28-31页 |
| 2.2.1 病原菌的培养及接种 | 第28-30页 |
| 2.2.2 性状鉴定 | 第30-31页 |
| 2.3 RNAseq材料取样及总RNA的提取 | 第31-33页 |
| 2.4 转录组测序 | 第33页 |
| 2.5 转录组分析 | 第33页 |
| 2.6 反转录和real-time qRT-PCR验证 | 第33-35页 |
| 2.6.1 第一链cDNA的合成 | 第33-34页 |
| 2.6.2 real-time qRT-PCR试验 | 第34-35页 |
| 第三章 结果与分析 | 第35-90页 |
| 3.1 性状调查 | 第35-38页 |
| 3.1.1 材料选择 | 第35-37页 |
| 3.1.2 表型鉴定 | 第37-38页 |
| 3.2 转录组分析 | 第38-43页 |
| 3.2.1 样品RNA提取 | 第38-39页 |
| 3.2.2 转录组测序reads质量检测及样品重复相关性分析 | 第39-40页 |
| 3.2.3 Mapping statistics | 第40-42页 |
| 3.2.4 差异基因的分析 | 第42-43页 |
| 3.3 Real-time qRT-PCR验证差异基因 | 第43-46页 |
| 3.4 接种禾谷镰刀菌后四个近等基因系中共有的差异基因 | 第46-60页 |
| 3.4.1 四个近等基因系中共有上调表达基因的GO分析 | 第46-52页 |
| 3.4.2 四个近等基因系中共有上调表达的抗病相关基因 | 第52-55页 |
| 3.4.3 四个近等基因系中共有下调表达的基因 | 第55-56页 |
| 3.4.4 讨论 | 第56-60页 |
| 3.5 qRfg1在转录组水平上对禾谷镰刀菌抗性的影响 | 第60-73页 |
| 3.5.1 禾谷镰刀菌接种后NIL2和NIL4的转录组 | 第60-62页 |
| 3.5.2 NIL2和NIL4间的组成型差异 | 第62-63页 |
| 3.5.3 NIL2中特异差异表达的基因 | 第63-67页 |
| 3.5.4 NIL4中特异差异表达的基因 | 第67-72页 |
| 3.5.5 讨论 | 第72-73页 |
| 3.6 qRfg2在转录组水平上对禾谷镰刀菌抗性的影响 | 第73-79页 |
| 3.6.1 接种禾谷镰刀菌后NIL3和NIL4的转录组 | 第73-75页 |
| 3.6.2 NIL3和NIL4间的本底差异 | 第75页 |
| 3.6.3 禾谷镰刀菌接种诱导Trp合成途径基因的表达 | 第75-76页 |
| 3.6.4 禾谷镰刀菌接种后NIL4中生长素信号途径被较高诱导 | 第76-77页 |
| 3.6.5 接种禾谷镰刀菌后生长素运输相关基因的表达 | 第77-78页 |
| 3.6.6 讨论 | 第78-79页 |
| 3.7 QTL定位区段内基因的表达 | 第79-85页 |
| 3.7.1 qRfg1定位区段内差异基因的表达 | 第79页 |
| 3.7.2 qR-g2定位区段内差异基因的表达 | 第79-84页 |
| 3.7.3 qRfg1和qRfg2候选基因的表达 | 第84-85页 |
| 3.8 qRfg1和qRfg2在转录组水平的互作 | 第85-90页 |
| 3.8.1 NIL1通过组成型高表达抗病相关基因抵抗禾谷镰刀菌的侵染. | 第85-86页 |
| 3.8.2 NIL1中生长素相关基因的表达 | 第86页 |
| 3.8.3 讨论 | 第86-90页 |
| 第四章 结论 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-104页 |
| 附录 | 第104-110页 |
| 致谢 | 第110-111页 |
| 个人简介 | 第111页 |
