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花绒寄甲转录组测序及重要功能基因分析

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 文献综述第12-24页
    1.1 花绒寄甲研究进展第12-16页
        1.1.1 分类地位和分布第12页
        1.1.2 形态学特性第12-13页
        1.1.3 生活史及生物学特性第13-14页
        1.1.4 人工饲养的研究概况第14页
        1.1.5 对天牛的生物防治第14-16页
    1.2 高通量测序技术的研究进展第16-18页
        1.2.1 全基因组 de novo 测序第16-17页
        1.2.2 转录组测序第17-18页
    1.3 与生长发育和繁殖相关的基因研究概况第18-21页
        1.3.1 长寿基因 mth第18页
        1.3.2 细胞色素 P450第18-21页
            1.3.2.1 细胞色素 P450 简介第18-20页
            1.3.2.2 昆虫细胞色素 P450 的功能第20-21页
            1.3.2.3 昆虫细胞色素 CYP6 家族第21页
    1.4 实时定量 PCR第21-22页
    1.5 本研究的目的与意义第22-24页
第二章 花绒寄甲转录组高通量测序分析第24-34页
    2.1 引言第24-25页
    2.2 材料与方法第25-27页
        2.2.1 材料第25页
            2.2.1.1 试虫第25页
            2.2.1.2 主要试剂及来源第25页
            2.2.1.3 主要仪器及产地第25页
        2.2.2 实验方法第25-27页
            2.2.2.1 总 RNA 提取第25-26页
            2.2.2.2 RNA 质量检测第26页
            2.2.2.3 cDNA 文库建立及高通量测序第26页
            2.2.2.4 序列拼接、组装第26页
            2.2.2.5 Unigene 功能注释第26-27页
            2.2.2.6 花绒寄甲基因组大小第27页
    2.3 结果与分析第27-33页
        2.3.1 RNA 质量第27页
        2.3.2 转录组的从头测序组装第27-29页
        2.3.3 预测蛋白注释第29-30页
        2.3.4 GO 注释第30-32页
        2.3.5 代谢通路分析第32页
        2.3.6 转录组信息存放第32页
        2.3.7 花绒寄甲基因组大小第32-33页
    2.4 小结与讨论第33-34页
第三章 花绒寄甲 mth 基因的实时定量表达研究第34-42页
    3.1 引言第34页
    3.2 材料与方法第34-37页
        3.2.1 实验材料及仪器第34-35页
            3.2.1.1 试虫来源及处理第34-35页
            3.2.1.2 主要试剂及来源第35页
            3.2.1.3 主要仪器及产地第35页
        3.2.2 实验方法第35-37页
            3.2.2.1 RNA 提取及质量检测第35-36页
            3.2.2.2 反转录及转录效果检测第36页
            3.2.2.3 片段选择及 RT-qPCR 引物设计第36-37页
            3.2.2.4 内参基因的选择第37页
            3.2.2.5 荧光定量 PCR第37页
            3.2.2.6 数据分析第37页
    3.3 结果与分析第37-41页
        3.3.1 总 RNA 质量检测第37-38页
        3.3.2 反转录效果检测第38-39页
        3.3.3 标准曲线第39页
        3.3.4 定量结果第39-41页
    3.4 小结第41-42页
第四章 花绒寄甲 mth 基因的全长克隆第42-55页
    4.1 引言第42页
    4.2 材料与方法第42-45页
        4.2.1 材料第42-43页
            4.2.1.1 试虫来源第42-43页
            4.2.1.2 主要试剂及来源第43页
            4.2.1.3 主要仪器及产地第43页
        4.2.2 实验方法第43-45页
            4.2.2.1 RNA 提取第43页
            4.2.2.2 全长克隆的引物设计第43-44页
            4.2.2.3 3’RACE 和 5’RACE第44-45页
            4.2.2.4 全长序列拼接及验证第45页
    4.3 结果与分析第45-54页
        4.3.1 总 RNA 质量检测第45-46页
        4.3.2 mth 基因的 RACE PCR 扩增第46-47页
            4.3.2.1 3’和 5’ RACE PCR第46页
            4.3.2.2 全长验证 PCR第46-47页
        4.3.3 mth1 和 mth2 的 cDNA 全长序列及推测的氨基酸序列第47-50页
        4.3.4 花绒寄甲 mth1 和 mth2 推测的氨基酸序列的相似性比较及进化树分析第50-54页
    4.4 小结与讨论第54-55页
第五章 花绒寄甲的 P450 基因家族分析第55-61页
    5.1 引言第55页
    5.2 实验方法第55页
    5.3 结果与分析第55-59页
    5.4 小结与讨论第59-61页
第六章 全文总结第61-63页
    6.1 主要结果第61页
    6.2 创新点第61-62页
    6.3 存在的问题和展望第62-63页
参考文献第63-72页
致谢第72-73页
作者简介第73页

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