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福建马铃薯病毒的分子鉴定与检测技术

中文摘要第12-15页
英文摘要第15页
1 马铃薯病毒鉴定与检测方法的研究背景、问题与思考第19-41页
    1.1 马铃薯主要病毒简介第19-23页
        1.1.1 马铃薯Y病毒和马铃薯A病毒第19-21页
        1.1.2 马铃薯X病毒第21-22页
        1.1.3 马铃薯卷叶病毒第22页
        1.1.4 马铃薯S病毒和马铃薯M病毒第22-23页
    1.2 以抗体为基础的免疫学检测方法第23-30页
        1.2.1 酶联免疫吸附法测定第23-25页
            1.2.1.1 基本原理第23-24页
            1.2.1.2 双抗体夹心-酶联免疫吸附法第24页
            1.2.1.3 硝酸纤维素膜-酶联免疫吸附法第24-25页
            1.2.1.4 快速酶联免疫吸附法第25页
        1.2.2 其他以抗体为基础的免疫学方法第25-26页
            1.2.2.1 直接组织免疫测定第25页
            1.2.2.2 免疫电镜技术第25-26页
            1.2.2.3 反向被动血细胞凝集反应第26页
            1.2.2.4 流式细胞仪法第26页
            1.2.2.5 IgG指示试纸法第26页
        1.2.3 病毒抗血清的制备第26-30页
            1.2.3.1 以提纯病毒粒体为抗原制备抗血清第26-27页
            1.2.3.2 以病毒外壳蛋白基因体外表达产物为抗原制备抗血清第27页
            1.2.3.3 病毒DNA介导的抗血清的制备第27-29页
            1.2.3.4 病毒单链抗体的制备第29-30页
    1.3 马铃薯病毒分子检测技术第30-38页
        1.3.1 RT-PCR检测技术第30-33页
            1.3.1.1 常规RT-PCR检测技术第30-31页
            1.3.1.2 多元-RT-PCR检测技术第31-32页
            1.3.1.3 荧光竞争-RT-PCR检测技术第32页
            1.3.1.4 免疫捕捉-RT-PCR检测技术第32-33页
        1.3.2 指示分子-核酸序列扩增检测技术第33-35页
        1.3.3 核酸杂交检测技术第35-38页
            1.3.3.1 核酸斑点杂交技术第36-37页
            1.3.3.2 PCR微量板杂交检测技术第37-38页
    1.4 血清学与分子生物学技术的比较第38-39页
        1.4.1 对标本的要求第38页
        1.4.2 敏感性和特异性第38页
        1.4.3 病毒定量检测第38页
        1.4.4 病毒基因分型第38-39页
        1.4.5 操作的复杂性、自动化程度第39页
        1.4.6 检测费用第39页
    1.5 讨论与展望第39-41页
2 试剂与常规方法第41-56页
    2.1 材料第41-42页
        2.1.1 菌株第41页
        2.1.2 质粒第41页
        2.1.3 引物第41-42页
        2.1.4 试剂及酶类第42页
    2.2 方法第42-56页
        2.2.1 电子显微镜观察第42页
        2.2.2 血清学检测第42-43页
            2.2.2.1 抗体夹心-酶联免疫吸附法第42-43页
            2.2.2.2 间接酶联免疫吸附法第43页
            2.2.2.3 快速酶联免疫吸附法第43页
        2.2.3 植物总RNA提取第43-44页
            2.2.3.1 异硫氰酸胍法第43-44页
            2.2.3.2 TRIzol法第44页
            2.2.3.3 试剂盒法第44页
        2.2.4 反转录-聚合酶链式反应第44-46页
            2.2.4.1 常规RT-PCR第44页
                2.2.4.1.1 反转录第44页
                2.2.4.1.2 聚合酶链式反应第44页
            2.2.4.2 一步RT-PCR检测技术第44-45页
            2.2.4.3 免疫捕捉-RT-PCR检测技术第45-46页
                2.2.4.3.1 病毒粒体的免疫捕捉第45-46页
                2.2.4.3.2 RT-PCR扩增第46页
        2.2.5 目的基因转化大肠杆菌第46-50页
            2.2.5.1 DNA片段的切胶纯化第46页
            2.2.5.2 与载体质粒的连接第46-48页
                2.2.5.2.1 与pGEM-T easy载体连接第46-47页
                2.2.5.2.2 与原核表达载体pGEX2T连接第47-48页
            2.2.5.3 氯化钙法转化第48-50页
                2.2.5.3.1 感受态细胞的制备第48页
                2.2.5.3.2 转化第48页
                2.2.5.3.3 碱裂解法小量提取质粒第48-49页
                2.2.5.3.4 重组克隆的酶切鉴定第49页
                2.2.5.3.5 重组克隆的PCR鉴定第49-50页
        2.2.6 序列测定与分析第50页
            2.2.6.1 DNA序列测定第50页
            2.2.6.2 DNA序列分析第50页
        2.2.7 病毒基因在大肠杆菌中的表达第50-52页
            2.2.7.1 PVS CP基因原核表达载体的构建第50页
            2.2.7.2 PVX、PVA CP、PVY P1基因原核表达载体的构建第50页
            2.2.7.3 融合蛋白的诱导表达第50-51页
            2.2.7.4 蛋白的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳第51页
            2.2.7.5 Western blot鉴定第51-52页
        2.2.8 融合蛋白特异性抗血清的制备及应用第52页
            2.2.8.1 融合蛋白抗血清的制备第52页
            2.2.8.2 抗血清效价测定第52页
            2.2.8.3 间接ELISA检测方法的建立第52页
        2.2.9 DNA探针的制备及应用第52-55页
            2.2.9.1 地高辛标记的DNA探针制备第52-53页
            2.2.9.2 RNA点杂交第53-54页
                2.2.9.2.1 常规方法第53-54页
                2.2.9.2.2 改进方法第54页
            2.2.9.3 PCR微量板杂交第54-55页
        2.2.10 马铃薯病毒检测试剂盒的研制第55页
            2.2.10.1 马铃薯病毒一步RT-PCR检测试剂盒的组装第55页
            2.2.10.2 马铃薯病毒核酸斑点杂交检测试剂盒的组装第55页
            2.2.10.3 马铃薯病毒ELISA检测试剂盒的组装第55页
        2.2.11 福建马铃薯病毒病发生情况调查第55-56页
            2.2.11.1 病毒样品的采集第55页
            2.2.11.2 病毒样品的检测第55-56页
3 马铃薯S病毒的鉴定及检测技术第56-67页
    3.1 PVS毒源的检测鉴定与分离纯化第56-57页
        3.1.1 样品的采集第56页
        3.1.2 样品的检测第56-57页
            3.1.2.1 血清学检测第56-57页
            3.1.2.2 电子显微镜观察第57页
            3.1.2.3 PVS的生物学鉴定第57页
    3.2 PVS CP基因的克隆与序列差异分析第57-60页
        3.2.1 PVS CP基因的RT-PCR扩增及克隆第57页
        3.2.2 PVS CP基因序列测定及与分析第57-58页
        3.2.3 PVS CP氨基酸序列差异性比较第58-60页
    3.3 PVS CP基因的原核表达及抗血清的制备第60-64页
        3.3.1 PVS CP基因融合蛋白原核表达载体的构建第60页
        3.3.2 融合蛋白SDS-PAGE分离鉴定第60-62页
        3.3.3 Western blot鉴定第62-63页
        3.3.4 GST-SCP蛋白抗血清的制备与效价测定第63页
        3.3.5 间接ELISA检测方法的建立第63页
            3.3.5.1 抗血清的适宜工作浓度第63页
            3.3.5.2 检测灵敏度第63页
        3.3.6 快速ELISA检测方法的建立第63-64页
    3.4 PVS分子检测技术的建立第64-67页
        3.4.1 PVS RT-PCR检测技术第64-65页
            3.4.1.1 常规RT-PCR检测技第64页
            3.4.1.2 一步RT-PCR检测技术第64-65页
            3.4.1.3 IC-RT-PCR检测技术第65页
        3.4.2 核酸杂交检测技术第65-67页
            3.4.2.1 NASH检测技术第65页
            3.4.2.2 PCR-微量板检测技术第65-67页
4 马铃薯X病毒的鉴定及检测技术第67-78页
    4.1 毒源的获得第67-68页
        4.1.1 样品的采集第67页
        4.1.2 样品的检测第67-68页
            4.1.2.1 血清学检测第67-68页
            4.1.2.2 电子显微镜观察第68页
            4.1.2.3 PVX的生物学鉴定第68页
    4.2 PVX CP基因的克隆与序列分析第68-72页
        4.2.1 PVX CP基因的扩增与克隆第68-69页
        4.2.2 PVX CP基因序列测定与分析第69-70页
        4.2.3 PVX不同分离物间CP基因核苷酸及氨基酸序列差异分析第70-72页
    4.3 PVX CP基因的原核表达及特异性抗血清的制备第72-75页
        4.3.1 原核表达载体的构建第72-73页
        4.3.2 融合蛋白的诱导表达第73-74页
        4.3.3 免疫学鉴定第74-75页
        4.3.4 GST-XCP蛋白抗血清的制备与效价测定第75页
        4.3.5 间接ELISA检测方法的建立第75页
        4.3.6 快速ELISA检测技术的建立第75页
    4.4 PVX分子检测技术的建立第75-78页
        4.4.1 常规RT-PCR检测技术第75-76页
        4.4.2 RT-PCR检测技术的改进第76-77页
        4.4.3 核酸杂交检测第77-78页
            4.4.3.1 NASH检测技术第77页
            4.4.3.2 PCR-微量板检测技术第77-78页
5 马铃薯Y病毒的检测与鉴定第78-89页
    5.1 毒源的获得第78-79页
    5.2 PVY的提纯及电镜观察第79页
    5.3 PVY P1基因的克隆与序列分析第79-83页
        5.3.1 PVY P1基因的RT-PCR扩增及克隆第79-80页
        5.3.2 PVY P1基因序列测定及同源性比较第80-83页
            5.3.2.1 PVY P1基因的序列测定及分析第80页
            5.3.2.2 PVY不同分离物P1氨基酸序列差异性分析第80-83页
    5.4 PVY P1基因的原核表达第83-85页
        5.4.1 PVY P1基因融合蛋白原核表达载体的构建第83-84页
        5.4.2 融合蛋白SDS-PAGE分离鉴定第84-85页
    5.5 PVY RT-PCR检测技术第85-87页
        5.5.1 常规RT-PCR检测技术的建立第85页
        5.5.2 一步RT-PCR检测技术第85-86页
        5.5.3 IC-RT-PCR检测技术第86-87页
    5.6 PVY核酸斑点杂交检测技术第87-89页
        5.6.1 PVY核酸斑点杂交检测第87-88页
        5.6.2 RT-PCR-微量板杂交检测第88-89页
6 马铃薯A病毒的鉴定及检测第89-98页
    6.1 PVA毒源的检测鉴定与分离纯化第89-90页
        6.1.1 样品的采集第89页
        6.1.2 样品的检测第89-90页
            6.1.2.1 电子显微镜观察第89页
            6.1.2.2 生物学鉴定第89-90页
    6.2 PVA CP基因的克隆与序列差异分析第90-94页
        6.2.1 PVA CP基因的RT-PCR扩增及克隆第90页
        6.2.2 PVA CP基因序列测定及同源性比较第90-91页
        6.2.3 PVA不同分离物CP氨基酸差异性分析第91-94页
    6.3 PVA CP基因的原核表达第94-96页
        6.3.1 PVA CP基因融合蛋白原核表达载体的构建第94-95页
        6.3.2 融合蛋白SDS-PAGE分离鉴定第95-96页
    6.4 PYA RT-PCR分子检测技术第96-97页
        6.4.1 常规RT-PCR检测技术第96页
        6.4.2 一步RT-PCR检测技术第96-97页
    6.5 核酸杂交检测技术第97-98页
        6.5.1 核酸斑点杂交检测第97页
        6.5.2 PCR-微量板检测技术第97-98页
7 马铃薯卷叶病毒的鉴定与检测第98-103页
    7.1 PLRV毒源的获得第98页
    7.2 PLRV CP基因的克隆与序列差异分析第98-101页
        7.2.1 PLRV CP基因的RT-PCR扩增及克隆第98-99页
        7.2.2 PLRV CP基因序列测定及同源性比较第99页
        7.2.3 PLRV不同分离物CP氨基酸序列差异性分析第99-101页
    7.3 PLRVRT-PCR检测技术第101-103页
        7.3.1 常规RT-PCR检测技术的建立第101-102页
        7.3.2 一步RT-PCR检测技术第102页
        7.3.3 IC-RT-PCR检测技术第102-103页
8 马铃薯病毒检测试剂盒的研制第103-107页
    8.1 一步RT-PCR检测试剂盒第103-104页
        8.1.1 试剂组成及配方第103页
        8.1.2 操作方法第103-104页
    8.2 核酸斑点杂交检测试剂盒第104-105页
        8.2.1 主要试剂配方第104页
        8.2.2 操作方法第104-105页
    8.3 ELISA检测试剂盒第105-107页
        8.3.1 主要试剂配方第105-106页
        8.3.2 操作方法第106-107页
9 福建省马铃薯病毒发病情况调查第107-113页
    9.1 福建省马铃薯病毒病田间症状第107-110页
        9.1.1 花叶第107-108页
        9.1.2 卷叶第108-109页
        9.1.3 矮化第109页
        9.1.4 束顶第109-110页
    9.2 福建省马铃薯病毒的检测鉴定第110页
    9.3 福建省马铃薯病毒病发生情况分析第110-112页
    9.4 福建省马铃薯病毒病发生原因的初步分析第112-113页
        9.4.1 种薯来源与马铃薯病毒病发生关系第112页
        9.4.2 留种方式与马铃薯病毒病发生关系第112-113页
讨论第113-118页
结语第118-120页
参考文献第120-128页
致谢第128-129页
附录1 缩写词和英汉对照第129-131页
附录2: 本研究使用的主要试剂与溶液的配制第131-136页
附录3: 攻读博士期间发表(投稿)的论文第136页

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