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基于转录组测序探究土槿皮乙酸对芒果炭疽病菌有丝分裂的影响

摘要第9-10页
英文摘要第10-11页
1 前言第12-20页
    1.1 土槿皮乙酸研究概况第12-13页
        1.1.1 土槿皮乙酸医用抑菌及抗肿瘤机理研究概况第12-13页
        1.1.2 土槿皮乙酸农用抑菌研究概况第13页
    1.2 杀(抑)菌活性物质作用机理研究概况第13-16页
        1.2.1 农用杀菌剂作用机理研究概况第13-14页
        1.2.2 植物源抑菌活性物质对植物病原菌作用机制研究概况第14-16页
    1.3 转录组测序及在农药作用机理研究中的应用第16-18页
        1.3.1 转录组测序第16-17页
        1.3.2 转录组测序技术在农药作用机理研究中的应用第17-18页
    1.4 研究目的及意义第18-20页
2 材料与方法第20-28页
    2.1 材料第20-21页
        2.1.1 供试菌株第20页
        2.1.2 供试试剂及试剂配制第20-21页
    2.2 试验方法第21-28页
        2.2.1 孢子悬浮液制备第21页
        2.2.2 药剂对芒果炭疽病菌分生孢子萌发的毒力测定第21页
        2.2.3 分生孢子萌发过程中的核相变化第21-22页
        2.2.4 芒果炭疽病菌菌丝的培养与药剂处理第22页
        2.2.5 芒果炭疽病菌菌株总RNA提取、质量检测及测序第22-23页
        2.2.6 cDNA文库构建及Illumina测序第23页
        2.2.7 原始数据过滤第23页
        2.2.8 转录组拼接、组装第23-24页
        2.2.9 Unigene功能注释第24页
        2.2.10 表达量及表达差异分析第24-25页
        2.2.11 差异表达基因的功能显著性富集分析第25-26页
        2.2.12 样品总RNA提取及反转录合成cDNA第26页
        2.2.13 引物设计与合成第26页
        2.2.14 实时荧光定量PCR第26-28页
3 结果与分析第28-56页
    3.1 药剂处理对芒果炭疽病菌分生孢子萌发过程中核分裂的影响第28-33页
        3.1.1 药剂处理对芒果炭疽病菌分生孢子萌发的影响第28页
        3.1.2 芒果炭疽病菌分生孢子正常萌发过程中核相动态变化第28-30页
        3.1.3 CBM对芒果炭疽病菌分生孢子萌发过程中核分裂的影响第30页
        3.1.4 PAB对芒果炭疽病菌分生孢子萌发过程中核分裂的影响第30-33页
    3.2 芒果炭疽病菌总RNA质量检测第33-34页
    3.3 转录组测序质量评估第34-39页
        3.3.1 原始数据整理、过滤和质量评估第34-35页
        3.3.2 转录组拼接结果分析第35-39页
    3.4 Unigene功能注释第39-42页
        3.4.1 Nr数据库注释第39-40页
        3.4.2 GO功能注释第40-41页
        3.4.3 COG数据库注释第41-42页
        3.4.4 KEGG功能注释第42页
    3.5 Unigene差异表达分析第42-48页
        3.5.1 差异表达基因的GO功能富集分析第44-46页
        3.5.2 差异表达基因的KEGG功能富集分析第46-48页
    3.6 qRT-PCR验证第48-50页
    3.7 与有丝分裂相关的差异表达基因分析第50-56页
4 讨论第56-62页
    4.1 PAB对芒果炭疽病菌分生孢子萌发过程核分裂的影响第56-57页
    4.2 PAB与CBM诱导对芒果炭疽病菌基因表达的影响第57-58页
    4.3 PAB可能抑菌靶基因的筛选和讨论第58-60页
        4.3.1 β-微管蛋白基因(TUB1)第58-59页
        4.3.2 细胞分裂调控蛋白基因(Cdc6)第59页
        4.3.3 TypeⅡB DNA拓扑异构酶基因(topoⅡB)第59-60页
    4.4 展望第60-62页
5 结论第62-64页
参考文献第64-74页
致谢第74-76页
个人简历第76-78页
附录第78-87页

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