| 中文摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第1章 绪论 | 第13-35页 |
| 1.1 遗传学及表观遗传学 | 第13-14页 |
| 1.1.1 遗传学 | 第13页 |
| 1.1.2 表观遗传学 | 第13-14页 |
| 1.1.3 最新进展 | 第14页 |
| 1.2 DNA甲基化研究 | 第14-23页 |
| 1.2.1 甲基化修饰 | 第14-15页 |
| 1.2.2 CpG岛及DNA甲基化的分布 | 第15-16页 |
| 1.2.3 甲基化与基因表达调控 | 第16-18页 |
| 1.2.4 DNA甲基化与生命体的关系 | 第18-19页 |
| 1.2.5 DNA甲基化检测技术 | 第19-23页 |
| 1.3 基因表达检测研究 | 第23-25页 |
| 1.3.1 概述 | 第23页 |
| 1.3.2 常用的检测方法 | 第23-25页 |
| 1.4 转录因子与核酸互作研究 | 第25-33页 |
| 1.4.1 概述 | 第25页 |
| 1.4.2 几种重要转录因子 | 第25-27页 |
| 1.4.3 转录因子与核酸互作的研究方法 | 第27-33页 |
| 1.5 近红外荧光技术 | 第33-34页 |
| 1.6 本论文的主要研究内容 | 第34-35页 |
| 第2章 基于近红外荧光-尼龙膜技术检测DNA甲基化及基因表达 | 第35-47页 |
| 2.1 引言 | 第35页 |
| 2.2 材料与方法 | 第35-39页 |
| 2.2.1 主要试剂与仪器 | 第35-36页 |
| 2.2.2 准备固定有探针的尼龙膜 | 第36页 |
| 2.2.3 细胞培养和药物处理 | 第36页 |
| 2.2.4 准备gDNA和总RNA | 第36-37页 |
| 2.2.5 M-NIFA检测DNA甲基化 | 第37-38页 |
| 2.2.6 亚硫酸氢盐测序法检测DNA甲基化 | 第38页 |
| 2.2.7 M-NIFA检测基因的转录 | 第38页 |
| 2.2.8 通过尼龙膜固定探针检测gDNA的捕获 | 第38-39页 |
| 2.3 实验结果 | 第39-44页 |
| 2.3.1 M-NIFA检测原理 | 第39-40页 |
| 2.3.2 M-NIFA甲基化检测系统的建立 | 第40-41页 |
| 2.3.3 M-NIFA的转录检测系统的建立 | 第41-42页 |
| 2.3.4 M-NIFA检测gDNA的甲基化 | 第42-43页 |
| 2.3.5 通过尼龙膜固定探针进行gDNA捕获的检测 | 第43页 |
| 2.3.6 亚硫酸氢盐测序法检测gDNA的甲基化 | 第43页 |
| 2.3.7 M-NIFA检测基因的转录 | 第43-44页 |
| 2.3.8 qPCR进行基因表达验证 | 第44页 |
| 2.4 讨论分析 | 第44-46页 |
| 2.5 本章小结 | 第46-47页 |
| 第3章 基于近红外荧光-微孔板技术检测DNA甲基化及基因表达 | 第47-63页 |
| 3.1 引言 | 第47页 |
| 3.2 材料与方法 | 第47-51页 |
| 3.2.1 主要试剂与仪器 | 第47-48页 |
| 3.2.2 制备探针共价结合的微孔板、基因组DNA和总RNA | 第48-49页 |
| 3.2.3 基因组DNA与探针共价结合的微孔板的杂交反应 | 第49-50页 |
| 3.2.4 检测DNA甲基化 | 第50页 |
| 3.2.5 亚硫酸氢盐测序法检测DNA甲基化 | 第50页 |
| 3.2.6 检测基因的转录及定量PCR检测 | 第50-51页 |
| 3.3 实验结果 | 第51-60页 |
| 3.3.1 W-NIFA检测原理 | 第51-52页 |
| 3.3.2 甲基化模拟检测 | 第52-53页 |
| 3.3.3 KIR3DL1,p14~(ARF)及TP53BP2基因启动子区甲基化检测 | 第53-56页 |
| 3.3.4 甲基化水平的相关性分析 | 第56页 |
| 3.3.5 荧光定量PCR检测 | 第56页 |
| 3.3.6 NIRF-GED方法的检测原理 | 第56-57页 |
| 3.3.7 NIRF-GED标准曲线的建立 | 第57-58页 |
| 3.3.8 NIRF-GED方法进行基因表达的绝对定量分析 | 第58-59页 |
| 3.3.9 荧光定量PCR检测 | 第59-60页 |
| 3.4 讨论分析 | 第60-61页 |
| 3.5 本章小结 | 第61-63页 |
| 第4章 基于近红外荧光-醛基基片技术对DNA甲基化、基因表达及其对转录因子与TFBS互作的研究初探 | 第63-74页 |
| 4.1 引言 | 第63页 |
| 4.2 材料与方法 | 第63-67页 |
| 4.2.1 主要试剂与仪器 | 第63-65页 |
| 4.2.2 固定捕获探针的醛基基片的准备 | 第65页 |
| 4.2.3 细胞培养和药物处理 | 第65页 |
| 4.2.4 准备基因组DNA和总RNA | 第65页 |
| 4.2.5 S-NIFA系统建立及优化 | 第65-66页 |
| 4.2.6 免疫沉淀技术(ChIP及MeDIP)富集特异性DNA片段 | 第66页 |
| 4.2.7 LM-PCR | 第66-67页 |
| 4.2.8 S-NIFA技术的样品检测 | 第67页 |
| 4.2.9 荧光定量PCR检测 | 第67页 |
| 4.3 实验结果 | 第67-72页 |
| 4.3.1 S-NIFA检测原理 | 第67-68页 |
| 4.3.2 S-NIFA系统建立及优化 | 第68-69页 |
| 4.3.3 免疫沉淀技术(ChIP及MeDIP)富集特异性DNA片段 | 第69-70页 |
| 4.3.4 DNA样品的LM-PCR反应 | 第70-71页 |
| 4.3.5 S-NIFA技术的样品检测 | 第71-72页 |
| 4.3.6 基因表达的荧光定量PCR检测 | 第72页 |
| 4.4 讨论分析 | 第72-73页 |
| 4.5 本章小结 | 第73-74页 |
| 第5章 胚肺细胞DNA甲基化研究及其对基因表达调控的影响 | 第74-87页 |
| 5.1 引言 | 第74-75页 |
| 5.2 材料与方法 | 第75-78页 |
| 5.2.1 主要试剂与仪器 | 第75页 |
| 5.2.2 TP53BP2和Apaf-1基因启动子区的CpG岛预测 | 第75-76页 |
| 5.2.3 TP53BP2和Apaf-1基因启动子区CpG岛转录因子结合位点的预测 | 第76页 |
| 5.2.4 TP53BP2和Apaf-1因启动子区CpG岛甲基化检测 | 第76-78页 |
| 5.3 实验结果 | 第78-85页 |
| 5.3.1 TP53BP2和Apaf-1因启动子区CpG岛的预测结果 | 第78-79页 |
| 5.3.2 TP53BP2和Apaf-1基因启动子区转录因子结合位点的预测 | 第79-80页 |
| 5.3.3 TP53BP2和Apaf-1基因启动子区CpG岛甲基化检测 | 第80-85页 |
| 5.4 讨论分析 | 第85-86页 |
| 5.5 本章小结 | 第86-87页 |
| 总结与展望 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-99页 |
| 作者简介 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100页 |
