| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第一章 引言 | 第12-23页 |
| 1.1 甘薯产业的概况 | 第12页 |
| 1.2 甘薯分子标记及研究现状 | 第12-15页 |
| 1.2.1 分子标记种类及应用 | 第12-14页 |
| 1.2.1.1 分子标记的种类 | 第12-13页 |
| 1.2.1.2 分子标记的应用 | 第13-14页 |
| 1.2.2 分子标记在甘薯遗传育种研究中的应用 | 第14-15页 |
| 1.2.2.1 研究甘薯起源、进化与分类 | 第14页 |
| 1.2.2.2 分析甘薯遗传多样性和亲缘关系 | 第14页 |
| 1.2.2.3 绘制指纹图谱，鉴定甘薯品种 | 第14-15页 |
| 1.2.2.4 构建甘薯分子遗传图谱 | 第15页 |
| 1.2.2.5 甘薯基因定位和DNA分子标记辅助选择育种 | 第15页 |
| 1.3 SNP检测方法的研究进展 | 第15-20页 |
| 1.3.1 基于凝胶电泳的SNP检测方法 | 第15-18页 |
| 1.3.1.1 单链构象多态性(SSCP) | 第16页 |
| 1.3.1.2 变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第16-17页 |
| 1.3.1.3 酶切扩增多态性序列(CAPS) | 第17页 |
| 1.3.1.4 等位基因特异性PCR(AS-PCR) | 第17-18页 |
| 1.3.2 高通量、自动化程度较高的SNP检测方法 | 第18-20页 |
| 1.3.2.1 直接测序 | 第18页 |
| 1.3.2.2 DNA芯片 | 第18-19页 |
| 1.3.2.3 变性高效液相色谱(DHPLC) | 第19页 |
| 1.3.2.4 质谱检测 | 第19-20页 |
| 1.3.2.5 高分辨熔解曲线(HRM) | 第20页 |
| 1.4 转录组测序研究及分子标记开发 | 第20-22页 |
| 1.4.1 测序技术研究 | 第20-21页 |
| 1.4.1.1 全基因组测序的研究 | 第21页 |
| 1.4.1.2 转录组测序研究 | 第21页 |
| 1.4.2 甘薯转录组测序研究 | 第21-22页 |
| 1.4.3 基于转录组测序的分子标记的开发 | 第22页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第22-23页 |
| 第二章 甘薯SNP检测方法的筛选与反应条件的优化 | 第23-41页 |
| 2.1 材料与方法 | 第23-28页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第23页 |
| 2.1.2 实验主要仪器、设备 | 第23-24页 |
| 2.1.3 样本基因组DNA提取 | 第24页 |
| 2.1.4 甘薯SNP标记快速高效检测方法的选择 | 第24-26页 |
| 2.1.4.1 等位基因特异性PCR(AS-PCR) | 第24-25页 |
| 2.1.4.2 四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR) | 第25-26页 |
| 2.1.4.3 酶切扩增多态性序列(CAPS) | 第26页 |
| 2.1.4.4 SNP凝胶电泳检测 | 第26页 |
| 2.1.5 甘薯SNP检测方法反应体系的优化 | 第26-28页 |
| 2.1.5.1 Tetra-primer ARMS-PCR反应体系退火温度的优化 | 第26-27页 |
| 2.1.5.2 Tetra-primer ARMS-PCR反应体系中内外引物浓度比的优化 | 第27-28页 |
| 2.1.5.3 Tetra-primer ARMS-PCR反应体系中Taq DNA聚合酶用量的优化 | 第28页 |
| 2.2 结果与分析 | 第28-38页 |
| 2.2.1 样本基因组DNA的提取和检测 | 第28-29页 |
| 2.2.2 甘薯SNP标记快速高效检测方法的选择 | 第29-31页 |
| 2.2.2.1 SNP位点T2-32906检测效果比较 | 第29-30页 |
| 2.2.2.2 SNP位点T3-30695检测效果比较 | 第30-31页 |
| 2.2.3 甘薯SNP检测方法反应体系的优化 | 第31-38页 |
| 2.2.3.1 不同退火温度下SNP位点PCR扩增产物的检测 | 第31-33页 |
| 2.2.3.2 不同内外引物浓度比的SNP位点PCR扩增产物的检测 | 第33-36页 |
| 2.2.3.3 不同Taq DNA聚合酶用量的SNP位点PCR扩增产物的检测 | 第36-38页 |
| 2.3 讨论 | 第38-41页 |
| 第三章 利用Tetra-primer ARMS-PCR开发甘薯SNP标记 | 第41-54页 |
| 3.1 材料与方法 | 第41-42页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第41页 |
| 3.1.2 实验主要仪器、设备 | 第41页 |
| 3.1.3 Tetra-primer ARMS-PCR引物的设计 | 第41-42页 |
| 3.1.4 Tetra-primer ARMS-PCR引物的扩增 | 第42页 |
| 3.1.5 Tetra-primer ARMS-PCR扩增产物的电泳检测 | 第42页 |
| 3.1.6 甘薯SNP标记的开发 | 第42页 |
| 3.2 结果与分析 | 第42-52页 |
| 3.2.1 Tetra-primer ARMS-PCR引物 | 第42-43页 |
| 3.2.2 Tetra-primer ARMS-PCR扩增结果 | 第43-47页 |
| 3.2.3 甘薯候选SNP位点的检测 | 第47-52页 |
| 3.3 讨论 | 第52-54页 |
| 第四章 全文结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 附录 | 第65-85页 |
| 作者简历 | 第85页 |
