| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 引言 | 第11-26页 |
| 1.1 黄缘闭壳龟研究概述 | 第11-16页 |
| 1.1.1 淡水龟科闭壳龟类简介 | 第11-12页 |
| 1.1.2 黄缘闭壳龟简介 | 第12-15页 |
| 1.1.3 黄缘闭壳龟的濒危保护状况 | 第15-16页 |
| 1.2 非损伤性取样提取动物DNA方法概述 | 第16-18页 |
| 1.2.1 非损伤性取样提取动物DNA方法简介 | 第16-17页 |
| 1.2.2 DNA的非损伤提取方法在濒危物种保护研究中的应用 | 第17-18页 |
| 1.3 应用于濒危动物保护研究中的分子标记技术 | 第18-24页 |
| 1.3.1 随机扩增片段长度多态性（RAPD） | 第18-19页 |
| 1.3.2 限制性片段长度多态性（RFLP） | 第19页 |
| 1.3.3 扩增片段长度多态性（AFLP） | 第19-20页 |
| 1.3.4 微卫星DNA标记（SSR） | 第20-22页 |
| 1.3.5 单核苷酸多态性（SNPs） | 第22页 |
| 1.3.6 线粒体DNA（mt DNA） | 第22-24页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第24-26页 |
| 第二章 黄缘闭壳龟基因组微卫星分子标记的开发及群体遗传多样性分析 | 第26-43页 |
| 2.1 材料 | 第26-28页 |
| 2.1.1 主要试验仪器 | 第26-27页 |
| 2.1.2 主要试验试剂 | 第27页 |
| 2.1.3 主要缓冲液及其配方 | 第27-28页 |
| 2.1.4 试验材料 | 第28页 |
| 2.2 方法 | 第28-32页 |
| 2.2.1 黄缘闭壳龟基因组DNA提取 | 第28-29页 |
| 2.2.2 黄缘闭壳龟基因组微卫星富集文库的构建 | 第29-31页 |
| 2.2.3 引物设计 | 第31-32页 |
| 2.2.4 引物筛选及多态位点的遗传分析 | 第32页 |
| 2.2.5 数据分析 | 第32页 |
| 2.3 结果与分析 | 第32-41页 |
| 2.3.1 基因组DNA提取 | 第32-33页 |
| 2.3.2 基因组DNA的酶切 | 第33-34页 |
| 2.3.3 连接与预扩增 | 第34页 |
| 2.3.4 菌液PCR扩增检测 | 第34页 |
| 2.3.5 测序结果分析及微卫星引物设计 | 第34-39页 |
| 2.3.6 多态性标记筛选及群体遗传多样性分析 | 第39-41页 |
| 2.4 讨论 | 第41-43页 |
| 第三章 黄缘闭壳龟基因组潜在SNP位点的发掘 | 第43-51页 |
| 3.1 材料 | 第43-44页 |
| 3.1.1 主要试验仪器 | 第43-44页 |
| 3.1.2 主要试验试剂 | 第44页 |
| 3.1.3 主要缓冲液及其配方 | 第44页 |
| 3.1.4 试验材料 | 第44页 |
| 3.2 方法 | 第44-46页 |
| 3.2.1 黄缘闭壳龟基因组DNA提取 | 第44页 |
| 3.2.2 Mse I酶切，接头连接和预扩增 | 第44-45页 |
| 3.2.3 异源双链DNA分子的形成，酶切和延伸 | 第45页 |
| 3.2.4 分离含有潜在SNP位点的DNA片段 | 第45-46页 |
| 3.2.5 SNP位点的确认 | 第46页 |
| 3.3 结果与分析 | 第46-49页 |
| 3.3.1 混合DNA池酶切结果分析 | 第46-47页 |
| 3.3.2 磁珠富集片段的PCR扩增结果 | 第47-48页 |
| 3.3.3 确认潜在SNP位点的引物序列 | 第48-49页 |
| 3.4 讨论 | 第49-51页 |
| 第四章 黄缘闭壳龟DNA非损伤性提取方法研究 | 第51-59页 |
| 4.1 材料 | 第51-52页 |
| 4.1.1 主要试验仪器 | 第51页 |
| 4.1.2 主要试验试剂 | 第51-52页 |
| 4.1.3 主要缓冲液及其配方 | 第52页 |
| 4.1.4 试验材料 | 第52页 |
| 4.2 方法 | 第52-54页 |
| 4.2.1 DNA的提取 | 第52-53页 |
| 4.2.2 DNA的检测与含量的测定 | 第53页 |
| 4.2.3 PCR扩增检测 | 第53-54页 |
| 4.2.4 转化与测序 | 第54页 |
| 4.3 结果与分析 | 第54-57页 |
| 4.3.1 非损伤性方法提取黄缘闭壳龟DNA的结果分析 | 第54-55页 |
| 4.3.2 微卫星PCR验证分析 | 第55-56页 |
| 4.3.3 线粒体CO1、CO2基因PCR验证分析 | 第56-57页 |
| 4.4 讨论 | 第57-59页 |
| 4.4.1 两种不同黄缘闭壳龟试验材料的非损伤提取 | 第57-58页 |
| 4.4.2 非损伤性方法提取DNA的可行性 | 第58-59页 |
| 第五章 基于微卫星和线粒体标记的黄缘闭壳龟群体遗传结构分析 | 第59-69页 |
| 5.1 材料与方法 | 第59-60页 |
| 5.1.1 主要实验仪器 | 第59页 |
| 5.1.2 主要实验试剂 | 第59页 |
| 5.1.3 主要缓冲液及配方 | 第59页 |
| 5.1.4 实验材料 | 第59-60页 |
| 5.2 方法 | 第60-61页 |
| 5.2.1 基因组DNA提取 | 第60页 |
| 5.2.2 微卫星PCR扩增及基因型检测 | 第60页 |
| 5.2.3 线粒体引物选取、PCR扩增及测序 | 第60页 |
| 5.2.4 数据分析 | 第60-61页 |
| 5.3 结果与分析 | 第61-67页 |
| 5.3.1 基于微卫星标记的黄缘闭壳龟遗传多样性分析 | 第61-63页 |
| 5.3.2 基于线粒体CO1和CO2基因的单倍型与系统发育分析 | 第63-67页 |
| 5.4 讨论 | 第67-69页 |
| 第六章 小结 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-75页 |
