| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 主要符号对照表 | 第6-10页 |
| 第1章 引言 | 第10-20页 |
| 1.1 山丹概述 | 第10-14页 |
| 1.1.1 山丹简介 | 第10-11页 |
| 1.1.2 山丹的研究现状 | 第11-14页 |
| 1.2 谱系地理学简介 | 第14-18页 |
| 1.2.1 谱系地理学的概念 | 第14-15页 |
| 1.2.2 谱系地理学的发展 | 第15-16页 |
| 1.2.3 谱系地理学的研究方法 | 第16-18页 |
| 1.3 本研究的目的意义和技术路线 | 第18-20页 |
| 1.3.1 研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 1.3.2 研究的技术路线 | 第19-20页 |
| 第2章 材料与方法 | 第20-32页 |
| 2.1 野外调查与取样 | 第20-24页 |
| 2.2 实验方法 | 第24-30页 |
| 2.2.1 基因组DNA的提取 | 第24-25页 |
| 2.2.2 基因组DNA质量的检测 | 第25页 |
| 2.2.3 ITS-PCR扩增体系的建立 | 第25-26页 |
| 2.2.4 cpDNA-PCR扩增体系的建立 | 第26-30页 |
| 2.2.5 ITS和cpDNA扩增检测及测序 | 第30页 |
| 2.3 数据分析 | 第30-32页 |
| 2.3.1 测序结果处理与序列比对 | 第30页 |
| 2.3.2 遗传多样性和群体遗传结构 | 第30-31页 |
| 2.3.3 单倍型网络图和系统发育分析 | 第31页 |
| 2.3.4 IBD相关性分析 | 第31页 |
| 2.3.5 失配分布和中性检验 | 第31-32页 |
| 第3章 结果与分析 | 第32-58页 |
| 3.1 基因组DNA的质量 | 第32-33页 |
| 3.2 ITS4-ITS5序列结果与分析 | 第33-43页 |
| 3.2.1 ITS4-ITS5序列信息 | 第33-34页 |
| 3.2.2 遗传多样性和群体遗传结构 | 第34-37页 |
| 3.2.3 ITS单倍型的地理分布 | 第37-38页 |
| 3.2.4 TCS单倍型网络图及系统发育关系 | 第38-40页 |
| 3.2.5 IBD分析 | 第40页 |
| 3.2.6 失配分布与中性检验 | 第40-43页 |
| 3.3 ITS1-ITS4序列结果与分析 | 第43-49页 |
| 3.3.1 ITS1-ITS4序列信息 | 第43-44页 |
| 3.3.2 种群遗传多样性和群体遗传结构 | 第44-46页 |
| 3.3.3 ITS单倍型的地理分布 | 第46-47页 |
| 3.3.4 TCS单倍型网络图及系统发育关系 | 第47-49页 |
| 3.3.5 失配分布与中性检验 | 第49页 |
| 3.4 cpDNA-PCR反应体系建立与优化 | 第49-56页 |
| 3.4.1 单因素筛选结果 | 第49-52页 |
| 3.4.2 影响cpDNA-PCR扩增因子的正交优化 | 第52-53页 |
| 3.4.3 退火温度对cpDNA-PCR反应的影响 | 第53-54页 |
| 3.4.4 cpDNA-PCR最优反应体系的确定 | 第54-55页 |
| 3.4.5 cpDNA引物筛选结果 | 第55-56页 |
| 3.5 cpDNA序列结果与分析 | 第56-58页 |
| 3.5.1 cpDNA序列信息 | 第56页 |
| 3.5.2 cpDNA试验结果 | 第56-58页 |
| 第4章 讨论 | 第58-63页 |
| 4.1 PCR条件的优化 | 第58页 |
| 4.2 ITS和cpDNA序列分子进化特点分析 | 第58-59页 |
| 4.3 cpDNA谱系特征 | 第59页 |
| 4.4 山丹的遗传多样性 | 第59-60页 |
| 4.5 山丹的遗传结构和种群历史动态 | 第60-61页 |
| 4.6 山丹保护措施 | 第61-63页 |
| 第5章 结论与展望 | 第63-65页 |
| 5.1 结论 | 第63-64页 |
| 5.2 展望 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 作者简介 | 第74页 |