| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7页 |
| Chapter1 INTRODUCTION | 第14-37页 |
| 1.1 Photosynthetic pathways | 第14-22页 |
| 1.1.1 C_3 pathway | 第14-17页 |
| 1.1.2 C_4 pathway | 第17-22页 |
| 1.2 Evolution of C_4 photosynthetic pathway | 第22-28页 |
| 1.2.1 Phylogenetic distribution | 第22页 |
| 1.2.2 Kranz anatomy | 第22-25页 |
| 1.2.3 Molecular regulation of C_4 pathways | 第25-28页 |
| 1.3 The C_4 Rice Project | 第28-33页 |
| 1.3.1 Rice | 第28-31页 |
| 1.3.2 The C_4 Rice Project – Overview | 第31-32页 |
| 1.3.3 Previous studies | 第32-33页 |
| 1.4 Laser capture microdissection technique | 第33-36页 |
| 1.4.1 LCM systems | 第33-35页 |
| 1.4.2 LCM applications on plants | 第35-36页 |
| 1.5 Aims | 第36-37页 |
| Chapter2 MATERIALS AND METHODS | 第37-47页 |
| 2.1 Plant materials | 第37页 |
| 2.1.1 Oryza sativa | 第37页 |
| 2.1.2 Zea mays | 第37页 |
| 2.2 LCM sample preparation | 第37-39页 |
| 2.2.1 Leaf sample collection and fixation | 第37-38页 |
| 2.2.2.Microwave processing | 第38-39页 |
| 2.2.3 Microtome sectioning | 第39页 |
| 2.2.4 LCM | 第39页 |
| 2.3 RNA Extraction and qualification | 第39-41页 |
| 2.3.1 RNA extraction | 第39-40页 |
| 2.3.2 RNA integrity testing | 第40-41页 |
| 2.4 RNA amplification and RNA-seq | 第41-47页 |
| 2.4.1 RNA amplification | 第41-46页 |
| 2.4.2 RNA-seq | 第46-47页 |
| Chapter3 Mc- and BSc-specific RNA of rice and maize | 第47-54页 |
| 3.1 Introduction | 第47页 |
| 3.2 Results and discussion | 第47-52页 |
| 3.2.1 Leaf collection | 第47-48页 |
| 3.2.2 Laser capture microdissection | 第48-50页 |
| 3.2.3 RNA Extraction and RNA Integrity Testing | 第50-52页 |
| 3.3 Discussion | 第52-54页 |
| Chapter4 Differential expression of rice Mc and BSc transcriptomes | 第54-63页 |
| 4.1 Introduction | 第54页 |
| 4.2 Results | 第54-60页 |
| 4.2.1 RNA-seq and alignment against the rice reference genome | 第54-55页 |
| 4.2.2 Differential expression of genes between rice BSc and Mc | 第55-60页 |
| 4.3 Discussion | 第60-63页 |
| 4.3.1 RNA-seq and alignment against the reference genome | 第60页 |
| 4.3.2. Differential expression of genes between BSc and Mc | 第60-63页 |
| Chapter5 Differential expression of maize Mc and BSc transcriptomes | 第63-71页 |
| 5.1 Introduction | 第63页 |
| 5.2 Results | 第63-68页 |
| 5.2.1 RNA-seq and alignment against the reference genome | 第63页 |
| 5.2.2 Differential expression of genes between BSc and Mc | 第63-68页 |
| 5.3 Discussion | 第68-71页 |
| 5.3.1 RNA-seq and alignment against the reference genome | 第68页 |
| 5.3.2 Differential expression of genes between BSc and Mc | 第68-71页 |
| CONCLUSION | 第71-72页 |
| References | 第72-83页 |
| 致谢Acknowledgement | 第83-84页 |
| 作者简历RESUME | 第84-86页 |
