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铜绿假单胞菌应答多株噬菌体感染相关基因的筛选及噬菌体C11基因组的功能注释

摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
1 前言第10-19页
    1.1 铜绿假单胞菌第10页
        1.1.1 铜绿假单胞菌概述第10页
        1.1.2 铜绿假单胞菌多样性第10页
        1.1.3 铜绿假单胞菌耐药性第10页
    1.2 铜绿假单胞菌噬菌体第10-12页
        1.2.1 噬菌体分类第10-11页
        1.2.2 铜绿假单胞菌噬菌体治疗研究第11-12页
        1.2.3 铜绿假单胞菌噬菌体全基因测序研究进展第12页
    1.3 铜绿假单胞菌噬菌体与铜绿假单胞菌相互作用的关系第12-17页
        1.3.1 宿主菌中与噬菌体感染相关基因的研究进展第12-14页
        1.3.2 铜绿假单胞菌噬菌体受体研究方法第14-15页
        1.3.3 铜绿假单胞菌噬菌体受体分析第15-16页
        1.3.4 铜绿假单胞菌噬菌体感染相关基因的研究进展第16-17页
    1.4 论文研究意义和研究内容第17-19页
        1.4.1 研究意义第17-18页
        1.4.2 研究内容第18-19页
2 材料和方法第19-27页
    2.1 实验菌株、质粒及噬菌体第19-20页
    2.2 引物第20-21页
    2.3 铜绿假单胞菌感染相关基因的遗传分析第21-24页
        2.3.1 转座子文库构建及耐受噬菌体突变株的筛选第21页
        2.3.2 菌株对噬菌体敏感性测定第21-22页
        2.3.3 突变株的噬菌体吸附率测定第22页
        2.3.4 突变株与噬菌体的共培养实验第22页
        2.3.5 反向PCR鉴定Tn5G插入位点第22-23页
        2.3.6 回复实验第23页
        2.3.7 定量PCR第23-24页
    2.4 噬菌体C11电镜分析第24-25页
    2.5 噬菌体C11 一步生长曲线测定第25页
    2.6 噬菌体C11基因组测序样品的制备及测序第25页
    2.7 噬菌体C11基因组末端序列的发现与确定第25-26页
    2.8 噬菌体C11基因组序列分析第26页
    2.9 噬菌体C11基因组注释第26-27页
3 结果与讨论第27-79页
    3.1 利用转座子Tn5G筛选耐受噬菌体突变株第27-30页
        3.1.1 噬菌体O1的耐受突变株筛选第27页
        3.1.2 噬菌体O2的耐受突变株筛选第27页
        3.1.3 噬菌体K1的耐受突变株筛选第27页
        3.1.4 噬菌体K2的耐受突变株筛选第27页
        3.1.5 噬菌体K3的耐受突变株筛选第27-28页
        3.1.6 噬菌体C10的耐受突变株筛选第28页
        3.1.7 噬菌体C11的生物学特性以及耐受突变株筛选第28-30页
    3.2 耐受噬菌体突变株表型分析第30-36页
        3.2.1 突变株对噬菌体敏感性的确定第30-32页
        3.2.2 噬菌体吸附率确定第32-36页
    3.3 噬菌体感染必需宿主基因的分析第36-42页
        3.3.1 噬菌体O1感染必需宿主基因的分析第36-37页
        3.3.2 噬菌体O2感染必需宿主基因的分析第37-38页
        3.3.3 噬菌体K1感染必需宿主基因的分析第38页
        3.3.4 噬菌体K2感染必需宿主基因的分析第38页
        3.3.5 噬菌体K3感染必需的宿主基因的分析第38-39页
        3.3.6 噬菌体C10感染必需的宿主基因的分析第39页
        3.3.7 噬菌体C11感染必需的宿主基因的分析第39-42页
    3.4 基因功能互补实验第42-59页
        3.4.1 基因PA4367的功能互补实验第42-43页
        3.4.2 基因PA0583的功能互补实验第43-45页
        3.4.3 基因PA5004的功能互补实验第45-46页
        3.4.4 基因BN889_05221的功能互补实验第46-48页
        3.4.5 基因wbpR的功能互补实验第48-51页
        3.4.6 基因PA3808的功能互补试验第51-52页
        3.4.7 基因PA1993的功能互补实验第52-53页
        3.4.8 基因PA5181的功能互补实验第53-55页
        3.4.9 基因PA0243的功能互补实验第55-56页
        3.4.10 基因PA1115的功能互补实验第56-57页
        3.4.11 基因PALES_16971的功能互补实验第57-58页
        3.4.12 基因PA5001的功能互补实验第58页
        3.4.13 基因wbpT的功能互补实验第58页
        3.4.14 基因wbpO的功能互补实验第58-59页
        3.4.15 基因wbpL的功能互补实验第59页
        3.4.16 基因wbpV的功能互补实验第59页
    3.5 非受体基因相关功能的研究第59-63页
        3.5.1 噬菌体C11对吸附率不变的突变株的生长影响第59-60页
        3.5.2 基因BN889_05221、基因PA3808、基因PA1993、基因PA5181、基因PA0243、基因PA1115的功能分析第60-63页
    3.6 噬菌体C11的基因组注释第63-79页
        3.6.1 噬菌体C11基因组DNA测序样品分析第63-64页
        3.6.2 噬菌体C11基因组末端序列的发现与确定第64-66页
        3.6.3 噬菌体C11基因组的一般特征注释第66-68页
        3.6.4 噬菌体C11基因组编码基因分析第68-76页
        3.6.5 噬菌体C11的比较基因组学分析第76-79页
4 结论第79-80页
5 展望第80-81页
6 参考文献第81-91页
7 攻读硕士学位期间发表论文情况第91-92页
8 致谢第92-93页
9 附录第93-101页

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