芥菜型油菜A9染色体BAC物理图谱的构建及比较基因组分析
摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5-6页 |
缩略词表(Abbreviation) | 第7-10页 |
1 文献综述 | 第10-18页 |
1.1 芸薹属基因组学 | 第10-11页 |
1.1.1 芸薹属基因组及染色体进化 | 第10-11页 |
1.1.2 芸薹属比较基因组学研究进展 | 第11页 |
1.1.3 芸薹属基因组测序 | 第11页 |
1.2 基因组作图 | 第11-15页 |
1.2.1 遗传图谱 | 第12-13页 |
1.2.2 物理图谱 | 第13-14页 |
1.2.3 序列图谱 | 第14-15页 |
1.3 测序技术与组装 | 第15-16页 |
1.3.1 测序技术的发展 | 第15页 |
1.3.2 基因组组装 | 第15-16页 |
1.4 A9染色体研究进展 | 第16页 |
1.5 研究目的和意义 | 第16-18页 |
2 试验材料与方法 | 第18-21页 |
2.1 试验材料 | 第18页 |
2.2 方法 | 第18-21页 |
2.2.1 BAC质粒DNA混合池构建 | 第18-19页 |
2.2.2 引物的设计 | 第19页 |
2.2.3 PCR反应体系 | 第19页 |
2.2.4 BAC单克隆的筛选 | 第19页 |
2.2.5 PCR反应产物的琼脂糖凝胶电泳检测 | 第19-20页 |
2.2.6 BAC末端测序和序列分析 | 第20-21页 |
3 结果与分析 | 第21-26页 |
3.1 芥菜型油菜A9染色体物理图 | 第21-22页 |
3.2 芸薹属植物A9染色体结构比较 | 第22-26页 |
3.2.1 A9染色体祖先保守区块的比较 | 第22页 |
3.2.2 A9染色体宏观共线性比较 | 第22页 |
3.2.3 A9染色体微观共线性比较 | 第22-26页 |
4 讨论 | 第26-28页 |
4.1 BAC物理图谱构建中的问题 | 第26页 |
4.2 BAC物理图谱可获得更完整的基因组序列 | 第26-27页 |
4.3 芸薹属植物A9染色体比较分析 | 第27页 |
4.4 芥菜型油菜物理图谱与遗传图谱的整合 | 第27-28页 |
5 结论 | 第28-29页 |
参考文献 | 第29-36页 |
附表 | 第36-55页 |
致谢 | 第55-56页 |
作者简介 | 第56页 |