鲳属鱼类的线粒体基因组演化及银鲳的遗传多样性分析
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-19页 |
| ·银鲳的简介及研究概况 | 第12-16页 |
| ·银鲳的简介 | 第12-13页 |
| ·银鲳的研究概况 | 第13-16页 |
| ·鲳属鱼类的系统分类研究 | 第13-15页 |
| ·银鲳的种群遗传研究 | 第15-16页 |
| ·鱼类线粒体基因组的结构特征及其研究意义 | 第16页 |
| ·微卫星标记 | 第16-18页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第18-19页 |
| 第二章 银鲳线粒体全基因序列的测定和结构分析 | 第19-32页 |
| ·材料和方法 | 第19-23页 |
| ·材料 | 第19-20页 |
| ·实验试剂及仪器 | 第20-21页 |
| ·总DNA的提取 | 第21页 |
| ·引物的设计 | 第21-23页 |
| ·PCR扩增、纯化及测序 | 第23页 |
| ·序列拼接及分析 | 第23页 |
| ·结果与分析 | 第23-29页 |
| ·PCR结果 | 第23-24页 |
| ·基因组结构 | 第24-26页 |
| ·碱基组成特点 | 第26-27页 |
| ·蛋白质编码基因的密码子使用频率 | 第27-28页 |
| ·tRNA基因 | 第28-29页 |
| ·rRNA基因 | 第29页 |
| ·讨论 | 第29-32页 |
| ·PCR扩增反应 | 第29页 |
| ·重复tRNAMet结构 | 第29-32页 |
| 第三章 鲳属鱼类线粒体全基因组序列的测定和分析 | 第32-49页 |
| ·实验材料与方法 | 第32-36页 |
| ·样本的采集及保存 | 第32-33页 |
| ·主要的实验试剂和仪器 | 第33页 |
| ·总DNA的提取 | 第33页 |
| ·引物的设计 | 第33页 |
| ·PCR扩增、纯化及测序 | 第33-35页 |
| ·常规PCR扩增 | 第33-34页 |
| ·长PCR扩增 | 第34页 |
| ·PCR产物纯化及测序 | 第34-35页 |
| ·实验数据的处理 | 第35-36页 |
| ·序列的拼接 | 第35-36页 |
| ·线粒体基因组全序列的基因定位 | 第36页 |
| ·线粒体基因组的结构分析 | 第36页 |
| ·结果与分析 | 第36-47页 |
| ·总DNA的提取 | 第36-37页 |
| ·线粒体全基因组序列的结构特征 | 第37-41页 |
| ·蛋白质编码基因的分析 | 第41-45页 |
| ·蛋白质编码基因的基本特征分析 | 第41-42页 |
| ·蛋白质编码基因的起始密码子和终止密码子 | 第42页 |
| ·蛋白质编码基因的遗传距离和基因突变分析 | 第42-45页 |
| ·鲳属鱼类系统进化分析 | 第45-47页 |
| ·讨论 | 第47-49页 |
| 第四章 银鲳26对多态微卫星引物的开发及跨种扩增 | 第49-64页 |
| ·实验材料与方法 | 第49-56页 |
| ·样本的采集 | 第49页 |
| ·主要的实验试剂和仪器 | 第49-50页 |
| ·具体实验方法 | 第50-55页 |
| ·DNA的提取 | 第50页 |
| ·制作接头 | 第50页 |
| ·DNA的酶切和接头的连接 | 第50页 |
| ·连接产物的扩增 | 第50-51页 |
| ·探针杂交 | 第51-52页 |
| ·磁珠富集 | 第52页 |
| ·富集微卫星片段的PCR扩增 | 第52-53页 |
| ·目标微卫星片段的克隆和测序 | 第53-54页 |
| ·序列分析和引物设计 | 第54-55页 |
| ·微卫星多态性位点的筛选 | 第55页 |
| ·数据分析 | 第55-56页 |
| ·结果与讨论 | 第56-64页 |
| ·银鲳总DNA的提取 | 第56页 |
| ·酶切连接PCR结果 | 第56-57页 |
| ·富集微卫星片段的PCR扩增结果 | 第57页 |
| ·阳性克隆的筛选及引物的设计 | 第57-59页 |
| ·SSR多态性引物的分析和跨种扩增 | 第59-64页 |
| 第五章 基于微卫星分析银鲳8个群体的遗传多样性 | 第64-78页 |
| ·实验材料与方法 | 第64-67页 |
| ·样本的采集 | 第64-65页 |
| ·主要的实验试剂和仪器 | 第65页 |
| ·总DNA的提取 | 第65页 |
| ·银鲳群体的微卫星分析 | 第65页 |
| ·数据的统计分析 | 第65-67页 |
| ·结果与分析 | 第67-76页 |
| ·种群遗传多样性分析 | 第67-73页 |
| ·种群结构分析 | 第73-75页 |
| ·种群动态分析 | 第75-76页 |
| ·讨论 | 第76-78页 |
| ·群体遗传多样性 | 第76-77页 |
| ·群体遗传分化 | 第77-78页 |
| 小结 | 第78-79页 |
| 参考文献 | 第79-84页 |
| 附录 | 第84-89页 |
| 致谢 | 第89页 |
