摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
前言 | 第9-11页 |
一.实验材料 | 第11-14页 |
1. 实验对象 | 第11-12页 |
2. 主要试剂及耗材 | 第12-14页 |
·外周血DNA提取所用的主要试剂 | 第12页 |
·PCR反应试剂 | 第12页 |
·荧光标记引物PCR-STR分型试剂及耗材 | 第12页 |
·测序试剂和材料 | 第12-13页 |
·主要溶液的配置 | 第13-14页 |
3. 主要仪器设备 | 第14页 |
·DNA提取主要使用的仪器 | 第14页 |
·基因分型及测序主要使用的仪器 | 第14页 |
二.研究方法 | 第14-25页 |
1. 外周血的DNA的提取与定量 | 第14-15页 |
·试剂盒抽提外周血基因组DNA | 第14-15页 |
·DNA的定量 | 第15页 |
2. HLA-G基因8号外显子3'UTR区域14 bp插入/缺失多态性检测 | 第15-21页 |
·14bp插入/缺失多态检测 | 第15-16页 |
·PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测 | 第16-17页 |
·PCR产物测序验证 | 第17-21页 |
3. HLA-G基因8号外显子3'UTR多态性检测 | 第21-22页 |
·PCR检测HLA-G基因8号外显子3'UTR多态性 | 第21-22页 |
·PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测 | 第22页 |
·PCR产物测序验证 | 第22页 |
4. PCR-STR分型 | 第22-24页 |
·STR位点信息 | 第22-23页 |
·PCR扩增反应体系 | 第23页 |
·PCR扩增反应程序 | 第23-24页 |
·毛细管电泳样品的准备 | 第24页 |
·荧光标记引物PCR扩增产物在基因自动化分析仪上检测 | 第24页 |
5. 数据分析 | 第24-25页 |
·原始数据分析 | 第24页 |
·采用SPSS17.0统计分析软件包 | 第24-25页 |
·采用Arlequin3.11群体遗传数据分析软件包 | 第25页 |
·采用Poptree 2 software软件包 | 第25页 |
·采用Structure software Version 2.3软件包 | 第25页 |
三. 研究结果 | 第25-41页 |
1. 14bp插入/缺失琼脂糖凝胶电泳结果 | 第25-26页 |
2. PCR产物测序验证 | 第26页 |
3. HLA-G基因3'UTR区域的多态性检测 | 第26-27页 |
4. 10个STR等位基因扫描及分型结果 | 第27-29页 |
5. Hardy-Weinberg平衡检验及杂合度分析 | 第29-32页 |
·5个 少数民族群体HLA-G基因8号外显子S'UTR区域的Hardy-Weinberg平衡检验及杂合度分析 | 第29-30页 |
·5个少数民族群体10个中性STR位点的Hardy-Weinberg平衡检验及杂合度分析 | 第30-32页 |
6. 5个少数民族群体HLA-G基因8号外显子3'UTR区域的等位基因分布频率的χ2配对比较 | 第32-33页 |
7. 连锁不平衡分析和单倍型构建分析 | 第33页 |
8. 单倍型在5个群体中分布的Ewens-Watterson中性检测 | 第33-34页 |
9. 5个群体HLA-G基因8号外显子3'UTR区域的单倍型类群分布及比较 | 第34-35页 |
10. 族群间遗传分化指数(F_(ST))及Nei的遗传距离Da | 第35-37页 |
·HLA-G基因3'UTR区域8个多态性位点族群间遗传分化指数(F_(ST))及Nei的遗传距离Da | 第35-36页 |
·10个STR位点的族群间遗传分化指数(F_(ST))及Nei的遗传距离Da | 第36-37页 |
11. 系统发育树及基因树的构建 | 第37-39页 |
·HLA-G基因3'UTR区域构建的基因树 | 第37-38页 |
·10个中性STR构建的系统发育树 | 第38-39页 |
12. 聚类分析 | 第39-41页 |
四.讨论 | 第41-45页 |
1. HLA-G基因3'UTR区域多态性位点在不同群体中分布存在差异 | 第41页 |
2. HLA-G基因8号外显子3'UTR区域在5个少数民族群体中分布受到平衡选择作用 | 第41-43页 |
3. 引起平衡选择作用的原因 | 第43-45页 |
本文总结与展望 | 第45-47页 |
小结 | 第45-46页 |
展望 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-50页 |
附录 | 第50-58页 |
附录1 缩略语表 | 第50-51页 |
附录2 | 第51-53页 |
附录3 | 第53-58页 |
致谢 | 第58-59页 |
个人简历 | 第59-60页 |