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中国5个少数民族群体中选择压力对HLA-G基因3UTR区域作用研究

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
前言第9-11页
一.实验材料第11-14页
 1. 实验对象第11-12页
 2. 主要试剂及耗材第12-14页
     ·外周血DNA提取所用的主要试剂第12页
     ·PCR反应试剂第12页
     ·荧光标记引物PCR-STR分型试剂及耗材第12页
     ·测序试剂和材料第12-13页
     ·主要溶液的配置第13-14页
 3. 主要仪器设备第14页
     ·DNA提取主要使用的仪器第14页
     ·基因分型及测序主要使用的仪器第14页
二.研究方法第14-25页
 1. 外周血的DNA的提取与定量第14-15页
     ·试剂盒抽提外周血基因组DNA第14-15页
     ·DNA的定量第15页
 2. HLA-G基因8号外显子3'UTR区域14 bp插入/缺失多态性检测第15-21页
     ·14bp插入/缺失多态检测第15-16页
     ·PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测第16-17页
     ·PCR产物测序验证第17-21页
 3. HLA-G基因8号外显子3'UTR多态性检测第21-22页
     ·PCR检测HLA-G基因8号外显子3'UTR多态性第21-22页
     ·PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测第22页
     ·PCR产物测序验证第22页
 4. PCR-STR分型第22-24页
     ·STR位点信息第22-23页
     ·PCR扩增反应体系第23页
     ·PCR扩增反应程序第23-24页
     ·毛细管电泳样品的准备第24页
     ·荧光标记引物PCR扩增产物在基因自动化分析仪上检测第24页
 5. 数据分析第24-25页
     ·原始数据分析第24页
     ·采用SPSS17.0统计分析软件包第24-25页
     ·采用Arlequin3.11群体遗传数据分析软件包第25页
     ·采用Poptree 2 software软件包第25页
     ·采用Structure software Version 2.3软件包第25页
三. 研究结果第25-41页
 1. 14bp插入/缺失琼脂糖凝胶电泳结果第25-26页
 2. PCR产物测序验证第26页
 3. HLA-G基因3'UTR区域的多态性检测第26-27页
 4. 10个STR等位基因扫描及分型结果第27-29页
 5. Hardy-Weinberg平衡检验及杂合度分析第29-32页
   ·5个 少数民族群体HLA-G基因8号外显子S'UTR区域的Hardy-Weinberg平衡检验及杂合度分析第29-30页
   ·5个少数民族群体10个中性STR位点的Hardy-Weinberg平衡检验及杂合度分析第30-32页
 6. 5个少数民族群体HLA-G基因8号外显子3'UTR区域的等位基因分布频率的χ2配对比较第32-33页
 7. 连锁不平衡分析和单倍型构建分析第33页
 8. 单倍型在5个群体中分布的Ewens-Watterson中性检测第33-34页
 9. 5个群体HLA-G基因8号外显子3'UTR区域的单倍型类群分布及比较第34-35页
 10. 族群间遗传分化指数(F_(ST))及Nei的遗传距离Da第35-37页
     ·HLA-G基因3'UTR区域8个多态性位点族群间遗传分化指数(F_(ST))及Nei的遗传距离Da第35-36页
     ·10个STR位点的族群间遗传分化指数(F_(ST))及Nei的遗传距离Da第36-37页
 11. 系统发育树及基因树的构建第37-39页
     ·HLA-G基因3'UTR区域构建的基因树第37-38页
     ·10个中性STR构建的系统发育树第38-39页
 12. 聚类分析第39-41页
四.讨论第41-45页
 1. HLA-G基因3'UTR区域多态性位点在不同群体中分布存在差异第41页
 2. HLA-G基因8号外显子3'UTR区域在5个少数民族群体中分布受到平衡选择作用第41-43页
 3. 引起平衡选择作用的原因第43-45页
本文总结与展望第45-47页
 小结第45-46页
 展望第46-47页
参考文献第47-50页
附录第50-58页
 附录1 缩略语表第50-51页
 附录2第51-53页
 附录3第53-58页
致谢第58-59页
个人简历第59-60页

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