| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-19页 |
| §1.1 生物信息学简介 | 第11页 |
| §1.2 研究背景 | 第11-12页 |
| §1.3 基因的表达与调控 | 第12-13页 |
| §1.4 调控模体及其表示法 | 第13-17页 |
| §1.5 本文的组织结构及创新 | 第17-19页 |
| 第二章 调控模体预测问题算法简介 | 第19-27页 |
| §2.1 基于共调控基因调控序列的方法 | 第19-21页 |
| §2.2 系统发生足迹法 | 第21-22页 |
| §2.3 基于图理论的两种算法 | 第22-24页 |
| §2.4 总结 | 第24-27页 |
| 第三章 一种新的基于图理论的模体预测算法MDS | 第27-39页 |
| §3.1 图的构造 | 第27-30页 |
| §3.2 MDS算法设计与分析 | 第30-34页 |
| §3.3 数据及结果 | 第34-35页 |
| §3.4 结果分析与比较 | 第35-38页 |
| §3.5 总结 | 第38-39页 |
| 第四章 总结与展望 | 第39-43页 |
| §4.1 总结 | 第39-40页 |
| §4.2 展望 | 第40-43页 |
| 参考文献 | 第43-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第48页 |