摘要 | 第1-10页 |
ABSTRACT | 第10-18页 |
第1章 引言 | 第18-22页 |
·真核生物成熟mRNA的形成与结构 | 第18-20页 |
·真核生物的转录过程 | 第18-19页 |
·真核生物的mRNA序列特征及翻译 | 第19-20页 |
·mRNA的5'UTR对翻译的调控 | 第20-22页 |
第2章 实验材料 | 第22-33页 |
·实验仪器及分析软件 | 第22-23页 |
·使用的数据集及其细节 | 第23-33页 |
·公共数据集RefGene | 第23-24页 |
·人类RNA的Genbank格式数据human.rna.gbff.gz | 第24-25页 |
·人类疾病相关变异数据集ClinVar | 第25-27页 |
·肿瘤相关变异数据集1: TCGA | 第27-30页 |
·肿瘤相关变异数据集2: COSMIC | 第30-31页 |
·基因本体Gene ontology数据集1 | 第31-32页 |
·数据集Full ontology | 第32-33页 |
第3章 实验方法与结果 | 第33-80页 |
·技术路线图 | 第33页 |
·数据处理与分析 | 第33-80页 |
·文件human.rna.gbff的数据过滤 | 第33-36页 |
·利用RefGene数据集将36591个mRNA在基因组上进行hg19坐标定位 | 第36-40页 |
·过滤并保留唯一的5'UTR | 第40-44页 |
·含有uORF的基因定位以及它们的基本统计量 | 第44-53页 |
·GO功能富集分析 | 第53-56页 |
·寻找motif及Kozak信号强度分析 | 第56-66页 |
·疾病数据库与uORF的关联 | 第66-73页 |
·实验验证 | 第73-80页 |
第4章 分析与讨论 | 第80-82页 |
参考文献 | 第82-91页 |
致谢 | 第91-92页 |