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基于GenBank和RefGene数据集的人类成熟mRNA的5UTR翻译调控序列研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-18页
第1章 引言第18-22页
   ·真核生物成熟mRNA的形成与结构第18-20页
     ·真核生物的转录过程第18-19页
     ·真核生物的mRNA序列特征及翻译第19-20页
   ·mRNA的5'UTR对翻译的调控第20-22页
第2章 实验材料第22-33页
   ·实验仪器及分析软件第22-23页
   ·使用的数据集及其细节第23-33页
     ·公共数据集RefGene第23-24页
     ·人类RNA的Genbank格式数据human.rna.gbff.gz第24-25页
     ·人类疾病相关变异数据集ClinVar第25-27页
     ·肿瘤相关变异数据集1: TCGA第27-30页
     ·肿瘤相关变异数据集2: COSMIC第30-31页
     ·基因本体Gene ontology数据集1第31-32页
     ·数据集Full ontology第32-33页
第3章 实验方法与结果第33-80页
   ·技术路线图第33页
   ·数据处理与分析第33-80页
     ·文件human.rna.gbff的数据过滤第33-36页
     ·利用RefGene数据集将36591个mRNA在基因组上进行hg19坐标定位第36-40页
     ·过滤并保留唯一的5'UTR第40-44页
     ·含有uORF的基因定位以及它们的基本统计量第44-53页
     ·GO功能富集分析第53-56页
     ·寻找motif及Kozak信号强度分析第56-66页
     ·疾病数据库与uORF的关联第66-73页
     ·实验验证第73-80页
第4章 分析与讨论第80-82页
参考文献第82-91页
致谢第91-92页

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