| 致谢 | 第1-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-21页 |
| ·DNA 分子标记概述 | 第10-16页 |
| ·分子标记的主要特征 | 第11页 |
| ·分子标记主要类型、原理及特点 | 第11-14页 |
| ·限制性片段长度多态性（RFLP）标记 | 第11-12页 |
| ·随机扩增多态性 DNA（RAPD）标记 | 第12页 |
| ·序列标记位点（STS）标记 | 第12页 |
| ·扩增片段长度多态性（AFLP）标记 | 第12-13页 |
| ·单核苷酸多态性（SNP）标记 | 第13页 |
| ·简单序列重复（SSR）标记 | 第13-14页 |
| ·理想 DNA 分子标记的特征 | 第14-15页 |
| ·SSR 标记的应用 | 第15-16页 |
| ·构建遗传连锁图谱 | 第15页 |
| ·分子标记辅助育种 | 第15页 |
| ·建立 DNA 指纹图谱 | 第15-16页 |
| ·遗传多样性的研究 | 第16页 |
| ·EST-SSR 标记开发及应用 | 第16-19页 |
| ·EST 概述 | 第16-17页 |
| ·EST-SSR 标记开发 | 第17页 |
| ·EST-SSR 标记的特点 | 第17-18页 |
| ·EST-SSRs 标记的应用 | 第18-19页 |
| ·遗传连锁图谱的构建 | 第18页 |
| ·种质资源遗传多样性的研究 | 第18-19页 |
| ·比较作图 | 第19页 |
| ·EST-SSR 分子标记的通用性研究 | 第19-20页 |
| ·本课题研究的目的意义 | 第20-21页 |
| 第二章 鹅掌楸转录组测序及 EST-SSR 分子标记开发 | 第21-32页 |
| ·实验材料 | 第21页 |
| ·实验方法 | 第21-27页 |
| ·鹅掌楸 EST-SSR 引物的开发 | 第21-26页 |
| ·RNA 提取 | 第21-22页 |
| ·RNA 纯化 | 第22页 |
| ·RNA 质量检测 | 第22-23页 |
| ·转录组文库制备 | 第23页 |
| ·文库成簇（clustering）与测序 | 第23页 |
| ·生物信息学分析 | 第23-26页 |
| ·鹅掌楸 EST-SSR 引物筛选 | 第26页 |
| ·北美鹅掌楸 EST-SSR 引物的开发 | 第26-27页 |
| ·引物设计原则 | 第26页 |
| ·SSR 引物选取原则 | 第26-27页 |
| ·北美鹅掌楸 EST-SSR 引物开发 | 第27页 |
| ·引物稀释 | 第27页 |
| ·结果与分析 | 第27-31页 |
| ·鹅掌楸花瓣和叶片 RNA 的提取 | 第27-28页 |
| ·原始测序序列（Raw reads）结果分类 | 第28页 |
| ·测序数据质量汇总 | 第28页 |
| ·拼接转录本长度分布 | 第28-29页 |
| ·SSR 分析 | 第29页 |
| ·鹅掌楸 EST-SSR 引物的开发 | 第29-31页 |
| ·北美鹅掌楸 EST-SSR 引物设计 | 第31页 |
| ·讨论 | 第31-32页 |
| ·RNA 的提取 | 第31页 |
| ·生物信息学软件的应用 | 第31-32页 |
| 第三章 利用北美鹅掌楸 EST-SSR 分子标记检测鹅掌楸天然群体的遗传多样性 | 第32-43页 |
| ·实验材料 | 第32页 |
| ·实验方法 | 第32-37页 |
| ·鹅掌楸属树种总 DNA 的提取与纯化 | 第32-33页 |
| ·DNA 粗提 | 第32-33页 |
| ·DNA 纯化 | 第33页 |
| ·DNA 质量的检测 | 第33-34页 |
| ·SSR 引物筛选与 PCR 扩增反应 | 第34-35页 |
| ·PCR 产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 | 第35-36页 |
| ·电泳和银染步骤各试剂和溶液的配制 | 第35页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳过程 | 第35-36页 |
| ·银染检测步骤 | 第36页 |
| ·条带判读与统计分析 | 第36-37页 |
| ·结果与分析 | 第37-41页 |
| ·北美鹅掌楸 EST-SSR 引物的 PCR 扩增结果与多态性分析 | 第37页 |
| ·广西猫儿山鹅掌楸天然群体的遗传多样性分析 | 第37-41页 |
| ·讨论 | 第41-43页 |
| ·PCR 扩增产物的判读 | 第41页 |
| ·北美鹅掌楸 EST-SSR 引物的多态性分析 | 第41-42页 |
| ·鹅掌楸天然群体的遗传多样性分析 | 第42-43页 |
| 第四章 鹅掌楸 EST-SSR 跨属间通用性分析 | 第43-52页 |
| ·实验材料 | 第43-44页 |
| ·实验方法 | 第44-46页 |
| ·木兰科植物 DNA 的提取与纯化 | 第44页 |
| ·鹅掌楸 EST-SSR 引物多态性检测 | 第44页 |
| ·鹅掌楸 EST-SSR 引物跨属间的通用性分析 | 第44-45页 |
| ·条带判读与统计分析 | 第45-46页 |
| ·结果与分析 | 第46-50页 |
| ·鹅掌楸 SSR 引物的多态性筛选及在属内的通用性分析 | 第46-47页 |
| ·鹅掌楸 EST-SSR 引物的跨属间通用性分析 | 第47-50页 |
| ·讨论 | 第50-52页 |
| ·SSR-PCR 反应体系的优化 | 第50页 |
| ·鹅掌楸 EST-SSR 引物的多态性分析 | 第50页 |
| ·鹅掌楸 EST-SSR 引物的跨属间通用性分析 | 第50-51页 |
| ·鹅掌楸 EST-SSR 引物的进一步分析 | 第51-52页 |
| 第五章 主要研究结论与进一步研究展望 | 第52-54页 |
| ·主要研究结论 | 第52-53页 |
| ·鹅掌楸属树种 EST-SSR 分子标记的开发 | 第52页 |
| ·利用北美鹅掌楸 EST-SSR 分子标记检测鹅掌楸天然群体遗传多样性 | 第52页 |
| ·鹅掌楸 EST-SSR 引物的多态性检测及通用性分析 | 第52-53页 |
| ·进一步研究展望 | 第53-54页 |
| ·鹅掌楸 EST-SSR 引物的进一步分析 | 第53页 |
| ·EST-SSR 引物在木兰科植物中的研究展望 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-57页 |
