| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| Abbreviation | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-31页 |
| 第一节 药用植物转录组研究方法 | 第12-15页 |
| ·转录组研究技术方法及应用 | 第12-13页 |
| ·药用植物EST测序平台选择 | 第13-15页 |
| 第二节 EST与高通量测序技术结合在中草药基因研究中的应用 | 第15-16页 |
| 第三节 NCBI的EST数据现状 | 第16页 |
| 第四节 灵芝、喜树、西洋参研究进展 | 第16-30页 |
| ·喜树碱相关研究进展 | 第17-23页 |
| ·灵芝相关研究背景 | 第23-28页 |
| ·西洋参研究进展 | 第28-30页 |
| 第五节 本研究的目的和意义 | 第30-31页 |
| 第二章 喜树转录组测序及喜树碱合成、转运基因的发掘 | 第31-60页 |
| 研究简介 | 第31-32页 |
| 第一节 材料和方法 | 第32-39页 |
| ·植物材料准备和处理 | 第32页 |
| ·RNA的提取和cDNA合成 | 第32-33页 |
| ·454文库构建、测序和注释 | 第33-34页 |
| ·基因克隆和分析 | 第34-37页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第37-39页 |
| 第二节 研究结果 | 第39-57页 |
| ·454测序和EST拼接 | 第39页 |
| ·注释和分类 | 第39-44页 |
| ·喜树碱生物合成和转运的候选基因 | 第44-57页 |
| 第三节 讨论 | 第57-60页 |
| ·异胡豆苷合成基因的克隆和分析 | 第58页 |
| ·喜树碱合成下游途径候选基因的发现 | 第58-59页 |
| ·喜树碱转运基因的发现 | 第59-60页 |
| 第三章 赤芝子实体转录组数据初步分析 | 第60-68页 |
| 研究简介 | 第60页 |
| 第一节 材料和方法 | 第60-61页 |
| ·生物材料 | 第60页 |
| ·RNA提取和cDNA合成 | 第60-61页 |
| ·测序文库的构建、测序、拼接和注释 | 第61页 |
| 第二节 研究结果 | 第61-67页 |
| ·数据拼接与基因注释 | 第61页 |
| ·三萜灵芝酸骨架合成基因 | 第61-62页 |
| ·参与灵芝酸合成的下游基因搜索 | 第62-63页 |
| ·参与木质素降解的候选基因 | 第63-67页 |
| 第三节 讨论 | 第67-68页 |
| 第四章 西洋参转录因子PqWRKY1基因功能研究 | 第68-86页 |
| 研究简介 | 第68页 |
| 第一节 材料和方法 | 第68-75页 |
| ·生物材料和载体 | 第68-69页 |
| ·主要药品及试剂 | 第69页 |
| ·溶液和培养基 | 第69-70页 |
| ·主要仪器 | 第70页 |
| ·实验方法 | 第70-75页 |
| 第二节 研究结果 | 第75-84页 |
| ·西洋参中WRKY基因的发现 | 第75页 |
| ·PqWRKY1基因的克隆和分析 | 第75-76页 |
| ·PqWRKY1的亚细胞定位 | 第76页 |
| ·PqWRKY1的转录激活能力 | 第76-80页 |
| ·PqWRKY1转基因株系的基因表达分析 | 第80页 |
| ·PqWRKY1基因提高拟南芥抗逆性 | 第80-84页 |
| 第三节 讨论 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-98页 |
| 附表 | 第98-145页 |
| 总结与展望 | 第145-146页 |
| 致谢 | 第146-147页 |
| 作者简介 | 第147-149页 |