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体内核仁素—染色质相互作用的功能研究

中文摘要第1-8页
RESUME第8-10页
SUMMARY第10-15页
LIST OF TABLES AND FIGURES第15-18页
LIST OF ABBREVIATIONS第18-20页
CHAPTER Ⅰ:INTRODUCTION第20-84页
 Ⅰ1. THE STRUCTURE AND ORGANIZATION OF CHROMATIN第20-42页
  Ⅰ1.1 The Nucleosome第20-22页
  Ⅰ1.2 Higher Orders of Chromatin Structure第22-25页
   Ⅰ1.2.1 The nucleosome and "beads-on-a-string"第23-24页
   Ⅰ1.2.2 30 nm chromatin fiber第24-25页
   Ⅰ1.2.3 Chromatin structure beyond the 30nm fiber第25页
  Ⅰ1.3 Chromatin Organization第25-29页
   Ⅰ1.3.1 Classical data:euchromatin and heterochromatin第25-27页
   Ⅰ1.3.2 Recent data:chromosome territories第27-29页
  Ⅰ1.4 Epigenetic Regulation of Chromatin第29-42页
   Ⅰ1.4.1 DNA methylation第29-31页
   Ⅰ1.4.2 Post-translational modifications of histones第31-37页
    Ⅰ1.4.2.1 Histone acetylation and deacetylation第32页
    Ⅰ1.4.2.2 Histone methylation and demethylation第32-33页
    Ⅰ1.4.2.3 Other covalent histone modifications第33-37页
   Ⅰ1.4.3 Incorporation of histone variants第37-40页
   Ⅰ1.4.4 ATP dependent chromatin remodeling第40-42页
 Ⅰ2. STRUCTURE AND FUNCTIONS OF THE NUCLEOLUS第42-56页
  Ⅰ2.1 Organization of the Nucleolus第42-48页
   Ⅰ2.1.1 Structure of the nucleolus第42-44页
   Ⅰ2.1.2 Nucleolar Organizer Regions第44-46页
   Ⅰ2.1.3 Nucleolar proteins第46-48页
  Ⅰ2.2 Ribosome Biogenesis第48-56页
   Ⅰ2.2.1 Structure of the rDNA transcription unit第48-49页
   Ⅰ2.2.2 Transcription of ribosomal DNA genes第49-52页
   Ⅰ2.2.3 Epigenetic regulation of rDNA transcription第52-55页
   Ⅰ2.2.4 Pre-rRNA maturation and ribosome assembly第55-56页
 Ⅰ3. STRUCTURE AND FUNCTIONS OF NUCLEOLIN第56-83页
  Ⅰ3.1 Properties of Nucleolin Domains第59-65页
   Ⅰ3.1.1 Nucleic acid binding properties of nucleolin第60-63页
   Ⅰ3.1.2 Protein-protein interactions第63-65页
  Ⅰ3.2 Post-translational Modifications of Nucleolin第65-69页
   Ⅰ3.2.1 Phosphorylation of nucleolin第66-68页
   Ⅰ3.2.2 Methylation of nucleolin第68页
   Ⅰ3.2.3 ADP-ribosylation and glycosylation of nucleolin第68-69页
  Ⅰ3.3 Functions of Nucleolin第69-83页
   Ⅰ3.3.1 Nucleolar functions of nucleolin第69-74页
       ·Role in polymerase I transcription第69-73页
    Ⅰ3.3.1.2 Role in rRNA maturation and pre-ribosome assembly第73-74页
   Ⅰ3.3.2 Functions of nucleolin in Pol Ⅱ transcription第74-76页
   Ⅰ3.3.3 Role of nucleolin in post-transcriptional regulation第76-77页
   Ⅰ3.3.4 Functions of nucleolin in DNA metabolism第77-80页
   Ⅰ3.3.5 Functions of nucleolin in cell cycle regulation, cell division and proliferation第80-83页
 Ⅰ4. OBJECTIVES第83-84页
CHAPTER Ⅱ:RESULTS第84-105页
 Ⅱ1. Interaction of nucleolin with histones第84-91页
 Ⅱ2. Nucleolin is associated with rDNA第91-93页
 Ⅱ3. Nucleolin is associated with active rDNA repeats第93-95页
 114. Depletion of nucleolin affects epigenetic marks of rDNA chromatin第95-97页
 115. Nucleolin affects TTF-1 interaction with T0第97-100页
 116. macroH2A1 is relocalized to the nucleoli after nucleolin depletion第100-102页
 117. rDNA repression by nucleolin depletion is alleviated by the inactivation of macroH2Al第102-105页
CHAPTER Ⅲ. DISSCUSSIONS AND PERSPECTIVES第105-115页
CHAPTER Ⅳ:MATERIALS AND METHODS第115-122页
 Ⅳ1.Plasmids第115-116页
 Ⅳ2. Peptides第116页
 Ⅳ3. Preparation of Hela cell nuclear extracts第116-117页
 Ⅳ4. Histone tail peptide pull-down第117页
 Ⅳ5. Cell lines and siRNA transfection第117-118页
 Ⅳ6. Transcription analysis by RT-QPCR第118页
 Ⅳ7. Immunofluorescence第118-119页
 Ⅳ8. Chromatin immunoprecipitation and DNA methylation assays第119-120页
 Ⅳ9. Antibodies第120-122页
REFERENCES第122-157页
List of Publications第157-159页
ACKNOWLEDGEMENTS第159页

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