淀粉纤维蛋白错误折叠机理的理论研究
摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-9页 |
第一章 绪论 | 第9-15页 |
·分子模拟概述 | 第9-11页 |
·分子模拟基本方法归纳量子力学方法 | 第9-11页 |
·淀粉样疾病的研究背景 | 第11-15页 |
·淀粉样疾病的发现 | 第11-12页 |
·淀粉样疾病的研究现状 | 第12-15页 |
第二章 分子动力学与研究对象 | 第15-25页 |
·分子动力学理论及Amber工具 | 第15-21页 |
·分子力场 | 第15-18页 |
·分子动力学计算原理 | 第18-20页 |
·分子动力学软件Amber | 第20-21页 |
·淀粉状纤维蛋白 | 第21-25页 |
第三章 实验流程以及数据分析 | 第25-31页 |
·短肽数据处理 | 第25-26页 |
·模拟预处理 | 第26-28页 |
·模拟条件理论要求 | 第26-27页 |
·模拟体系预处理设置 | 第27-28页 |
·常温(298K)模拟过程 | 第28-29页 |
·模拟参数设置标准 | 第28-29页 |
·模拟过程 | 第29页 |
·氨基酸突变处理 | 第29-30页 |
·数据处理及分析 | 第30-31页 |
第四章 实验结果 | 第31-51页 |
·八类多肽六聚体结构稳定性分析 | 第31-36页 |
·MVGGVV-1 数据分析 | 第36-43页 |
·突变数据分析 | 第36-41页 |
·MVGGVV-1 八类多聚体的稳定性分析 | 第41-43页 |
·VEALYL的数据处理 | 第43-51页 |
·VEALYL的突变型数据分析 | 第43-47页 |
·VEALYL八类多聚体的稳定性分析 | 第47-51页 |
第五章 结论与展望 | 第51-52页 |
参考文献 | 第52-55页 |
致谢 | 第55-56页 |
攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第56页 |