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人源异戊二烯焦磷酸异构酶及真核起始因子2B的结构生物学研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-12页
第一部分 人源异戊二烯焦磷酸异构酶(IPP异构酶)的结构生物学研究第12-60页
 第一章 绪论—异戊二烯焦磷酸异构酶的研究概述第12-25页
   ·异戊二烯类化合物生物合成途径与药物设计第12-13页
   ·异戊二烯焦磷酸异构酶的分类与功能第13-15页
   ·对于异戊二烯焦磷酸异构酶催化机理的生化研究第15-16页
   ·大肠杆菌异戊二烯异构酶的结构生物学研究第16-23页
   ·异戊二烯焦磷酸异构酶与药物设计第23-25页
 第二章 人源异戊二烯焦磷酸异构酶基因的克隆,蛋白的表达纯化,晶体的生长和结构解析第25-34页
   ·人源异戊二烯焦磷酸异构酶的克隆与表达载体构建第25-27页
   ·人源异戊二烯焦磷酸异构酶的表达纯化和晶体筛选第27-29页
   ·晶体衍射数据的收集和处理第29-30页
   ·晶体结构的解析与分析第30-34页
 第三章 实验结果与分析讨论第34-56页
   ·实验结果第34-46页
     ·两种分别带有N端与C端His-tag的蛋白性质的区别第34-35页
     ·人源异戊二烯焦磷酸异构酶的晶体结构的解析过程第35-40页
     ·人源与大肠杆菌异戊二烯焦磷酸异构酶结构的比较第40页
     ·三种人源异戊二烯焦磷酸异构酶的结构主链上的区别第40-42页
     ·hIPPI3结构中底物类似物及三种结构中活性口袋构象的不同第42-45页
     ·hIPPl3结构中底物类似物的结合第45-46页
   ·人源IPP异构酶结构的分析与讨论第46-54页
     ·焦磷酸乙醇胺(EAPP)可能是人源IPP异构酶的抑制剂第46页
     ·N端不稳定的α螺旋打开或形成的可能机理第46-48页
     ·在质子化与去质子化过程中可能的质子供体与反应的可逆性第48-51页
     ·人源异戊二烯焦磷酸异构酶中底物诱导的活性位点构象变化第51-53页
     ·高浓度Mn~(2+)抑制人源异戊二烯焦磷酸异构酶活性的机理第53-54页
   ·结论第54-56页
 第一部分 参考文献第56-60页
第二部分 人源真核起始因子2B(EIF2B)的结构生物学研究第60-120页
 第一章 绪论—真核翻译起始过程及EIF2B的功能和调控第60-84页
   ·真核翻译起始过程在基因表达调控中的作用第60页
   ·真核翻译起始的过程第60-66页
   ·两种重要的翻译起始因子eIF2和eIF2B的组成和功能第66-72页
     ·eIF2(α)的磷酸化对于eIF2B活性的抑制第67-68页
     ·酵母和哺乳动物细胞中eIF2B的组成第68-70页
     ·eIF2B活性的抑制对于翻译过程的影响第70-72页
   ·eIF2(α)的磷酸化第72-73页
   ·eIF2与eIF2B的相互作用及可能的磷酸化eIF2的抑制机理第73-77页
   ·eIF2B催化eIF2鸟苷酸交换的机理第77-78页
   ·eIF2B与人类疾病第78-84页
     ·白质消失(VWM)第78-81页
     ·糖尿病与癌症第81-84页
 第二章 实验设计与实验方法第84-97页
   ·人源eIF2B五个亚基的克隆构建第84-91页
     ·人源eIF2Bα和eIF2Bε亚基的克隆构建第84-86页
     ·LIC克隆策略与人源eIF2Bβ,γ及δ亚基基因的克隆构建第86-91页
     ·eIF2Bε亚基C端区域的克隆构建第91页
   ·人源eIF2B五个亚基的表达与纯化第91-93页
     ·人源eIF2Bα蛋白的表达纯化第91-92页
     ·融合MBP的人源eIFBβ和eIF2Bγ蛋白的表达纯化第92-93页
     ·人源eIF2BεCTD蛋白的表达纯化第93页
     ·其它人源eIF2B亚基全长蛋白的表达第93页
   ·人源eIF2Bα与eIF2BεCTD蛋白的晶体生长第93-94页
   ·人源eIF2Bα与eIF2BεCTD蛋白的数据收集及人源eIF2Bα晶体结构的解析第94-97页
 第三章 实验结果与分析讨论第97-111页
   ·人源eIF2Bα亚基的结构第97-106页
     ·人源eIF2Bα亚基的整体结构第97-99页
     ·人源eIF2Bα亚基中可能参与与eIF2结合的表面第99-102页
     ·人源eIF2Bα亚基中Rossmann折叠可能参与形成调节亚复合物第102-104页
     ·人源eIF2Bα与肾上腺素受体之间可能的相互作用模型第104-105页
     ·人源eIF2Bα与疾病CACH/VWM相关的两个突变第105-106页
   ·人源eIF2Bε亚基C端结构域的晶体衍射数据收集第106-108页
   ·人源eIF2B其它亚基的表达纯化第108-109页
   ·结论与展望第109-111页
 第二部份 参考文献第111-120页
附录 博士期间其它主要完成的工作第120-121页
致谢第121-122页
在读期间发表的学术论文第122页

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