摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-12页 |
第一部分 人源异戊二烯焦磷酸异构酶(IPP异构酶)的结构生物学研究 | 第12-60页 |
第一章 绪论—异戊二烯焦磷酸异构酶的研究概述 | 第12-25页 |
·异戊二烯类化合物生物合成途径与药物设计 | 第12-13页 |
·异戊二烯焦磷酸异构酶的分类与功能 | 第13-15页 |
·对于异戊二烯焦磷酸异构酶催化机理的生化研究 | 第15-16页 |
·大肠杆菌异戊二烯异构酶的结构生物学研究 | 第16-23页 |
·异戊二烯焦磷酸异构酶与药物设计 | 第23-25页 |
第二章 人源异戊二烯焦磷酸异构酶基因的克隆,蛋白的表达纯化,晶体的生长和结构解析 | 第25-34页 |
·人源异戊二烯焦磷酸异构酶的克隆与表达载体构建 | 第25-27页 |
·人源异戊二烯焦磷酸异构酶的表达纯化和晶体筛选 | 第27-29页 |
·晶体衍射数据的收集和处理 | 第29-30页 |
·晶体结构的解析与分析 | 第30-34页 |
第三章 实验结果与分析讨论 | 第34-56页 |
·实验结果 | 第34-46页 |
·两种分别带有N端与C端His-tag的蛋白性质的区别 | 第34-35页 |
·人源异戊二烯焦磷酸异构酶的晶体结构的解析过程 | 第35-40页 |
·人源与大肠杆菌异戊二烯焦磷酸异构酶结构的比较 | 第40页 |
·三种人源异戊二烯焦磷酸异构酶的结构主链上的区别 | 第40-42页 |
·hIPPI3结构中底物类似物及三种结构中活性口袋构象的不同 | 第42-45页 |
·hIPPl3结构中底物类似物的结合 | 第45-46页 |
·人源IPP异构酶结构的分析与讨论 | 第46-54页 |
·焦磷酸乙醇胺(EAPP)可能是人源IPP异构酶的抑制剂 | 第46页 |
·N端不稳定的α螺旋打开或形成的可能机理 | 第46-48页 |
·在质子化与去质子化过程中可能的质子供体与反应的可逆性 | 第48-51页 |
·人源异戊二烯焦磷酸异构酶中底物诱导的活性位点构象变化 | 第51-53页 |
·高浓度Mn~(2+)抑制人源异戊二烯焦磷酸异构酶活性的机理 | 第53-54页 |
·结论 | 第54-56页 |
第一部分 参考文献 | 第56-60页 |
第二部分 人源真核起始因子2B(EIF2B)的结构生物学研究 | 第60-120页 |
第一章 绪论—真核翻译起始过程及EIF2B的功能和调控 | 第60-84页 |
·真核翻译起始过程在基因表达调控中的作用 | 第60页 |
·真核翻译起始的过程 | 第60-66页 |
·两种重要的翻译起始因子eIF2和eIF2B的组成和功能 | 第66-72页 |
·eIF2(α)的磷酸化对于eIF2B活性的抑制 | 第67-68页 |
·酵母和哺乳动物细胞中eIF2B的组成 | 第68-70页 |
·eIF2B活性的抑制对于翻译过程的影响 | 第70-72页 |
·eIF2(α)的磷酸化 | 第72-73页 |
·eIF2与eIF2B的相互作用及可能的磷酸化eIF2的抑制机理 | 第73-77页 |
·eIF2B催化eIF2鸟苷酸交换的机理 | 第77-78页 |
·eIF2B与人类疾病 | 第78-84页 |
·白质消失(VWM) | 第78-81页 |
·糖尿病与癌症 | 第81-84页 |
第二章 实验设计与实验方法 | 第84-97页 |
·人源eIF2B五个亚基的克隆构建 | 第84-91页 |
·人源eIF2Bα和eIF2Bε亚基的克隆构建 | 第84-86页 |
·LIC克隆策略与人源eIF2Bβ,γ及δ亚基基因的克隆构建 | 第86-91页 |
·eIF2Bε亚基C端区域的克隆构建 | 第91页 |
·人源eIF2B五个亚基的表达与纯化 | 第91-93页 |
·人源eIF2Bα蛋白的表达纯化 | 第91-92页 |
·融合MBP的人源eIFBβ和eIF2Bγ蛋白的表达纯化 | 第92-93页 |
·人源eIF2BεCTD蛋白的表达纯化 | 第93页 |
·其它人源eIF2B亚基全长蛋白的表达 | 第93页 |
·人源eIF2Bα与eIF2BεCTD蛋白的晶体生长 | 第93-94页 |
·人源eIF2Bα与eIF2BεCTD蛋白的数据收集及人源eIF2Bα晶体结构的解析 | 第94-97页 |
第三章 实验结果与分析讨论 | 第97-111页 |
·人源eIF2Bα亚基的结构 | 第97-106页 |
·人源eIF2Bα亚基的整体结构 | 第97-99页 |
·人源eIF2Bα亚基中可能参与与eIF2结合的表面 | 第99-102页 |
·人源eIF2Bα亚基中Rossmann折叠可能参与形成调节亚复合物 | 第102-104页 |
·人源eIF2Bα与肾上腺素受体之间可能的相互作用模型 | 第104-105页 |
·人源eIF2Bα与疾病CACH/VWM相关的两个突变 | 第105-106页 |
·人源eIF2Bε亚基C端结构域的晶体衍射数据收集 | 第106-108页 |
·人源eIF2B其它亚基的表达纯化 | 第108-109页 |
·结论与展望 | 第109-111页 |
第二部份 参考文献 | 第111-120页 |
附录 博士期间其它主要完成的工作 | 第120-121页 |
致谢 | 第121-122页 |
在读期间发表的学术论文 | 第122页 |