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川渝黔6个山羊品种mtDNA D-loop遗传多样性与系统进化研究

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
第一章 文献综述第9-31页
   ·遗传多样性及其研究方法第9-12页
     ·遗传多样性的概念及其意义第9-10页
     ·我国家养动物遗传多样性(DAD,Diversity of Domestic Animal)研究的重要性和必要性第10页
     ·遗传多样性的研究方法第10-12页
   ·线粒体DNA以及在家养动物遗传育种中的应用第12-19页
     ·动物线粒体简介第12-17页
     ·mtDNA在家畜遗传育种中的应用第17-19页
   ·川渝黔地区山羊品种遗传多样性及其起源研究进展第19-25页
     ·川渝黔地区主要山羊品种(类群)概述第19-23页
     ·川渝黔地区山羊遗传资源多样性第23-24页
     ·川渝黔地区山羊的起源第24-25页
   ·有关遗传多样性以及系统进化数据处理方法第25-31页
     ·遗传多样性数据处理方法第25-27页
     ·分子系统发育分析与系统发育树第27-31页
引言第31-33页
第二章 实验材料与方法第33-39页
   ·材料第33-35页
     ·血样采集数量及地点第33页
     ·主要试剂及仪器第33-35页
   ·方法第35-37页
     ·实验样品的采集第35-36页
     ·基因组DNA的制备第36页
     ·线粒体DNA的D-loop区全序列的扩增第36-37页
     ·PCR产物的回收和纯化第37页
     ·PCR产物委托上海生工生物工程技术服务有限公司测序第37页
   ·统计分析第37-39页
     ·序列编辑第37页
     ·序列比对第37-38页
     ·序列碱基组成以及NJ树的构建第38页
     ·遗传多样性分析第38页
     ·群体扩张以及遗传分化的分析第38页
     ·网络分析第38-39页
第三章 结果与分析第39-65页
   ·基因组DNA检测结果第39页
   ·PCR扩增纯化结果第39-40页
   ·测序结果第40页
   ·川渝黔地区山羊mtDNA D-loop的遗传多样性第40-54页
     ·山羊mtDNA序列变异第40-46页
     ·川渝黔山羊品种遗传多样性的统计参数第46-47页
     ·川渝黔地区山羊品种单倍型分析第47-48页
     ·川渝黔地区山羊品种间的亲缘关系第48-53页
     ·系统发育地理结构简要分析第53-54页
   ·川渝黔地区山羊品种系统发育分析第54-65页
     ·进化树的构建第54页
     ·各支系的网络结构第54-62页
     ·群体扩张第62-65页
第四章 讨论第65-73页
   ·川渝黔地区山羊品种的遗传多样性第65-66页
   ·川渝黔山羊品种之间的遗传分化第66-67页
   ·川渝黔地区山羊品种的亲缘关系第67页
   ·川渝黔地区山羊品种的母系起源第67-68页
   ·关于支系B的起源第68-69页
   ·取样策略第69页
   ·不同建树方法及其基本假定第69-71页
   ·需要进一步研究解决的问题第71-73页
第五章 结论第73-75页
参考文献第75-83页
致谢第83-85页
攻读学位期间发表的文章第85页

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