| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-17页 |
| ·研究背景与意义 | 第9-12页 |
| ·酶体系 | 第12-17页 |
| ·内切酶的特点和分类 | 第12-14页 |
| ·H5N1病毒内切酶单金属离子机理 | 第14-17页 |
| 第2章 量子化学理论基础和计算方法 | 第17-31页 |
| ·量子化学 | 第17-21页 |
| ·Schrodinger方程 | 第17-18页 |
| ·从头算方法(ab intio method) | 第18-21页 |
| ·密度泛函理论方法 | 第21-24页 |
| ·基组 | 第24-25页 |
| ·过渡态理论(TST) | 第25-28页 |
| ·变分过渡状态理论 | 第26页 |
| ·传统过渡状态理论 | 第26-27页 |
| ·过渡态(TS)的寻找 | 第27-28页 |
| ·QM/MM组合方法 | 第28-31页 |
| ·ONIOM方法 | 第28页 |
| ·MM方法 | 第28-29页 |
| ·QM/MM方法 | 第29-31页 |
| 第3章 筛选优化H5N1病毒内切酶活性中心的计算方法 | 第31-37页 |
| ·引言 | 第31页 |
| ·计算方法 | 第31-32页 |
| ·结果与讨论 | 第32-35页 |
| ·构建模型 | 第32-33页 |
| ·优化模型并筛选计算方法 | 第33-35页 |
| ·本章小结 | 第35-37页 |
| 第4章 H5N1病毒内切酶催化水解RNA链反应机理研究 | 第37-49页 |
| ·引言 | 第37-38页 |
| ·计算方法 | 第38页 |
| ·结果与讨论 | 第38-47页 |
| ·反应活性中心模型的构建 | 第38-40页 |
| ·反应途径一 | 第40-43页 |
| ·反应途径二 | 第43-45页 |
| ·反应途径三 | 第45-47页 |
| ·本章小结 | 第47-49页 |
| 第5章 ONIOM方法计算研究H5N1病毒内切酶 | 第49-53页 |
| ·引言 | 第49页 |
| ·计算方法 | 第49-50页 |
| ·结果讨论 | 第50-52页 |
| ·模型的构建和优化 | 第50-52页 |
| ·IR图分析 | 第52页 |
| ·本章小结 | 第52-53页 |
| 第6章 主要结论与展望 | 第53-55页 |
| ·主要结论 | 第53-54页 |
| ·展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-63页 |
| 致谢 | 第63-65页 |
| 攻读硕士学位期间研究成果 | 第65页 |