摘要 | 第1-8页 |
Abstract | 第8-10页 |
1.文献综述 | 第10-25页 |
·比较基因组学的研究方法及应用 | 第10-13页 |
·比较基因组学的研究方法 | 第10-11页 |
·比较基因组学的应用 | 第11-13页 |
·阐明物种进化史 | 第11页 |
·比较基因组学与基因克隆 | 第11-12页 |
·揭示非编码功能序列 | 第12页 |
·新基因的发现 | 第12-13页 |
·芸薹属比较基因组学研究 | 第13-16页 |
·芸薹属植物基因组概况 | 第13页 |
·芸薹属A、B、C基因组之间的关系 | 第13-14页 |
·芸薹属不同基因组比较遗传图谱研究 | 第14-16页 |
·芸薹属植物与拟南芥之间的比较基因组学研究 | 第16-21页 |
·芸薹属植物与拟南芥之间的比较遗传作图 | 第16-17页 |
·芸薹属植物与拟南芥基因组的微观共线性研究 | 第17-21页 |
·芸薹属植物比较物理作图 | 第17-19页 |
·随机区域的比较物理作图 | 第17-18页 |
·特定农艺性状区域的比较物理作图 | 第18-19页 |
·序列水平的比较研究 | 第19-21页 |
·甘蓝型油菜细胞核雄性不育的研究 | 第21-23页 |
·细胞核雄性不育的遗传 | 第21-22页 |
·甘蓝型油菜细胞核育性相关基因的定位 | 第22-23页 |
·分子标记 | 第23-25页 |
·常见分子标记的分类及原理 | 第24页 |
·一种新型分子标记——扩增共有序列遗传标记 | 第24-25页 |
2.研究目的和意义 | 第25-27页 |
3.材料及方法 | 第27-32页 |
·实验材料 | 第27页 |
·DNA提取 | 第27页 |
·BAC质粒DNA的提取 | 第27页 |
·ACGM分析 | 第27-31页 |
·引物设计 | 第27-28页 |
·PCR反应体系、反应程序 | 第28页 |
·扩增产物的电泳检测 | 第28-29页 |
·PAGE胶制备 | 第28页 |
·电泳分离 | 第28-29页 |
·染色与显影 | 第29页 |
·基因型记载 | 第29页 |
·片断回收,克隆及测序 | 第29-30页 |
·片段的回收及再扩增 | 第29页 |
·连接反应 | 第29-30页 |
·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化 | 第30页 |
·重组子筛选、鉴定 | 第30页 |
·克隆片段的测序及其序列分析 | 第30页 |
·分子标记连锁图谱构建 | 第30-31页 |
·Shotgun测序法 | 第31-32页 |
4.结果与分析 | 第32-44页 |
·拟南芥BnMs1基因同源区在芸薹属A、C基因组的分布 | 第32-34页 |
·ACGM的引物设计 | 第32页 |
·ACGM的多态性检测 | 第32-33页 |
·遗传图谱的构建 | 第33-34页 |
·ACGM辅助BnMs2基因定位 | 第34-36页 |
·ACGM引物筛选 | 第34页 |
·与BnMs2基因连锁的ACGM的连锁分析 | 第34-36页 |
·芸薹属A、C基因组中候选克隆的筛选及候选区序列的测定 | 第36-40页 |
·甘蓝基因组BAC文库中候选单克隆的筛选 | 第36-38页 |
·甘蓝型油菜基因组BAC文库中候选单克隆的筛选 | 第38-40页 |
·芸薹属A、C基因组中BnMs候选基因区域序列的测定 | 第40页 |
·BnMs1、BnMs2候选基因区域序列的分析比对 | 第40-44页 |
5.讨论 | 第44-49页 |
·ACGM的优越性 | 第44-45页 |
·拟南芥与芸薹属基因组的亲缘和进化关系 | 第45-47页 |
·快速筛选混合池基因组BAC文库的方法 | 第47页 |
·Shotgun文库测序应注意的问题 | 第47-48页 |
·序列拼接中的难题 | 第48-49页 |
参考文献 | 第49-56页 |
附录 Doyle&Doyle CTAB Procedure | 第56-58页 |
致谢 | 第58页 |