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芸薹属A、C基因组及拟南芥BnMs候选基因区共线性比较

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
1.文献综述第10-25页
   ·比较基因组学的研究方法及应用第10-13页
     ·比较基因组学的研究方法第10-11页
     ·比较基因组学的应用第11-13页
       ·阐明物种进化史第11页
       ·比较基因组学与基因克隆第11-12页
       ·揭示非编码功能序列第12页
       ·新基因的发现第12-13页
   ·芸薹属比较基因组学研究第13-16页
     ·芸薹属植物基因组概况第13页
     ·芸薹属A、B、C基因组之间的关系第13-14页
     ·芸薹属不同基因组比较遗传图谱研究第14-16页
   ·芸薹属植物与拟南芥之间的比较基因组学研究第16-21页
     ·芸薹属植物与拟南芥之间的比较遗传作图第16-17页
     ·芸薹属植物与拟南芥基因组的微观共线性研究第17-21页
       ·芸薹属植物比较物理作图第17-19页
         ·随机区域的比较物理作图第17-18页
         ·特定农艺性状区域的比较物理作图第18-19页
       ·序列水平的比较研究第19-21页
   ·甘蓝型油菜细胞核雄性不育的研究第21-23页
     ·细胞核雄性不育的遗传第21-22页
     ·甘蓝型油菜细胞核育性相关基因的定位第22-23页
   ·分子标记第23-25页
     ·常见分子标记的分类及原理第24页
     ·一种新型分子标记——扩增共有序列遗传标记第24-25页
2.研究目的和意义第25-27页
3.材料及方法第27-32页
   ·实验材料第27页
   ·DNA提取第27页
   ·BAC质粒DNA的提取第27页
   ·ACGM分析第27-31页
     ·引物设计第27-28页
     ·PCR反应体系、反应程序第28页
     ·扩增产物的电泳检测第28-29页
       ·PAGE胶制备第28页
       ·电泳分离第28-29页
       ·染色与显影第29页
     ·基因型记载第29页
     ·片断回收,克隆及测序第29-30页
       ·片段的回收及再扩增第29页
       ·连接反应第29-30页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第30页
       ·重组子筛选、鉴定第30页
       ·克隆片段的测序及其序列分析第30页
     ·分子标记连锁图谱构建第30-31页
   ·Shotgun测序法第31-32页
4.结果与分析第32-44页
   ·拟南芥BnMs1基因同源区在芸薹属A、C基因组的分布第32-34页
     ·ACGM的引物设计第32页
     ·ACGM的多态性检测第32-33页
     ·遗传图谱的构建第33-34页
   ·ACGM辅助BnMs2基因定位第34-36页
     ·ACGM引物筛选第34页
     ·与BnMs2基因连锁的ACGM的连锁分析第34-36页
   ·芸薹属A、C基因组中候选克隆的筛选及候选区序列的测定第36-40页
     ·甘蓝基因组BAC文库中候选单克隆的筛选第36-38页
     ·甘蓝型油菜基因组BAC文库中候选单克隆的筛选第38-40页
     ·芸薹属A、C基因组中BnMs候选基因区域序列的测定第40页
   ·BnMs1、BnMs2候选基因区域序列的分析比对第40-44页
5.讨论第44-49页
   ·ACGM的优越性第44-45页
   ·拟南芥与芸薹属基因组的亲缘和进化关系第45-47页
   ·快速筛选混合池基因组BAC文库的方法第47页
   ·Shotgun文库测序应注意的问题第47-48页
   ·序列拼接中的难题第48-49页
参考文献第49-56页
附录 Doyle&Doyle CTAB Procedure第56-58页
致谢第58页

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