| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 引言 | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| ·生物信息学简介 | 第10-11页 |
| ·序列比对背景及意义 | 第11-12页 |
| ·多重序列比对基础 | 第12-16页 |
| 第二章 多重序列比对方法研究现状 | 第16-20页 |
| ·动态规划算法 | 第16-17页 |
| ·CLUSTAL 算法 | 第17-18页 |
| ·基于隐马尔可夫模型的多重序列比对算法 | 第18-19页 |
| ·现有算法分析 | 第19-20页 |
| 第三章 基于并行隐马尔可夫模型多重序列比对算法 | 第20-32页 |
| ·隐马尔可夫模型的基本原理 | 第20-25页 |
| ·多重序列比对问题的隐马尔可夫模型 | 第25-27页 |
| ·并行隐马尔可夫模型多重序列比对算法 | 第27-32页 |
| 第四章 并行隐马尔可夫模型多重序列比对系统实现 | 第32-43页 |
| ·并行计算平台的选择 | 第32-34页 |
| ·系统分析 | 第34-38页 |
| ·系统设计 | 第38-42页 |
| ·系统实现 | 第42-43页 |
| 第五章 结论与展望 | 第43-47页 |
| ·实验结果与算法比较 | 第43-45页 |
| ·研究的不足和展望 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 在学期间公开发表论文及参加的科研项目情况 | 第50页 |