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蓟马中内共生菌Wolbachia的多样性及其对寄主线粒体COI基因的影响

摘要第1-10页
Abstract第10-12页
第一章 引言第12-26页
   ·Wolbachia 的存在第12页
   ·Wolbachia 的分布范围第12-13页
   ·Wolbachia 分类简介第13-17页
   ·Wolbachia 的传播第17-18页
   ·Wolbachia 的检测及对寄主的影响第18-21页
     ·Wolbachia 的检测第18-19页
     ·Wolbachia 对寄主的影响第19-21页
     ·Wolbachia 的应用前景第21页
   ·蓟马简介第21-23页
     ·蓟马的生殖方式第22页
     ·蓟马的鉴定第22-23页
   ·蓟马共生菌的研究现状第23页
   ·立题依据第23-26页
第二章 材料与方法第26-33页
   ·试验选材第26页
   ·试验方法第26-31页
     ·蓟马基因组总DNA 的提取第26页
     ·COI 和ITS2 基因检测第26-27页
     ·MLST 基因和wsp 基因检测第27页
     ·PCR 结果检测第27-28页
     ·连接转化第28页
     ·转化子的筛选第28-31页
     ·菌落PCR 的测定与测序第31页
   ·试验数据处理和分析第31-33页
     ·测序结果第31页
     ·拼接第31页
     ·BLAST 比对第31页
     ·Wolbachia 鉴定第31-32页
     ·COI 单体型及wsp 和 MLST 基因的allele第32页
     ·系统发育树构建第32页
     ·重组分析第32页
     ·序列差异分析以及分子进化分析第32-33页
第三章 结果与分析第33-75页
   ·蓟马标本的采集及其形态鉴定第33-42页
     ·蓟马种类的分子鉴定第36-42页
   ·蓟马感染Wolbachia 情况第42-49页
     ·50 种蓟马中Wolbachia 的感染情况第42-49页
   ·蓟马中的Wolbachia 超群鉴定第49-61页
     ·Wolbachia 基因的分子检测统计第49页
     ·根据wsp 基因序列进行超群分析第49-51页
     ·ftsZ 基因序列分析结果第51-56页
     ·基于coxA, fbpA, gatB, hcpA 单个基因的分析第56页
     ·基于coxA, fbpA, gatB, hcpA, ftsZ 多个基因的分析第56-60页
     ·蓟马的食性和感染情况的关系第60-61页
   ·Wolbachia 基因的重组第61-67页
     ·重组软件分析结果第61-66页
     ·G 超群第66-67页
   ·Wolbachia 对蓟马COI 的影响第67-75页
     ·COI 的单体型和中性进化第67-73页
     ·不同分组之间的遗传比较第73-75页
第四章 讨论第75-77页
   ·分子鉴定和形态鉴定第75页
   ·生物学特征与感染情况关系第75页
   ·Wolbachia 分类适用的分子标记第75-76页
     ·wsp第75页
     ·多基因分析第75-76页
   ·Wolbachia 与蓟马COI 的关系第76-77页
     ·捕食性的影响第76页
     ·COI 基因序列多样性第76-77页
第五章 结论第77-78页
   ·蓟马的形态鉴定和分子鉴定第77页
   ·Wolbachia 的分类第77页
   ·基因重组第77页
   ·wolbachia 感染对蓟马COI 基因的影响第77-78页
参考文献第78-83页
附录1:本研究发现的MLST 新allele 在PubMLST 数据库中的编号第83-88页
附录2:本论文中新发现的wsp 基因4 个高变区及核苷酸序列allele 编号第88-91页
附录3:本论文在BOLD 中登记的COI 基因情况第91-92页
附录4:基于coxA 基因构建的Wolbachia 系统发育关系第92-96页
附录5:基于fbpA 基因构建的Wolbachia 系统发育关系第96-100页
附录6:基于gatB 基因构建的Wolbachia 系统发育关系第100-104页
附录7:基于hcpA 基因构建的Wolbachia 系统发育关系第104-108页
附录8:基于MLST5 个基因构建的Wolbachia 系统发育关系第108-112页
附录9:基于wsp 基因构建的Wolbachia 系统发育关系第112-115页
致谢第115-116页
硕士学位论文内容简介及自评第116页

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